Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 AL033519.2-201ENST00000403958 392 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
STRN3Q13033 UQCRBP2-201ENST00000447827 297 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
STRN3Q13033 MTATP8P1-201ENST00000467115 207 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
STRN3Q13033 RPL26P26-201ENST00000480251 434 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
STRN3Q13033 MIR449C-201ENST00000516047 92 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
STRN3Q13033 SNORA9.3-201ENST00000516383 129 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
STRN3Q13033 RNU6-897P-201ENST00000517135 105 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
STRN3Q13033 AP003465.1-201ENST00000520575 382 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
STRN3Q13033 AC124657.1-201ENST00000527819 429 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
STRN3Q13033 AC107871.2-201ENST00000612894 502 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
STRN3Q13033 AL357075.2-201ENST00000614906 189 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
STRN3Q13033 MIR6733-201ENST00000635723 61 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
STRN3Q13033 hsa-mir-548d-1.1-201ENST00000636914 97 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
STRN3Q13033 IKZF2-213ENST00000457361 9350 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
STRN3Q13033 CFH-202ENST00000367429 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
STRN3Q13033 ZBED5-202ENST00000432999 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
STRN3Q13033 Y_RNA.176-201ENST00000363815 109 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
STRN3Q13033 RNU6-926P-201ENST00000384075 107 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
STRN3Q13033 SNORA67.2-201ENST00000384300 149 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
STRN3Q13033 MIR300-201ENST00000401138 83 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
STRN3Q13033 MIR887-201ENST00000401258 79 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
STRN3Q13033 AL079342.1-201ENST00000401460 267 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
STRN3Q13033 AL353743.2-202ENST00000439544 473 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
STRN3Q13033 LINC02041-201ENST00000440726 246 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
STRN3Q13033 NDUFB4P10-201ENST00000452541 359 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
STRN3Q13033 AC003982.1-202ENST00000469928 248 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
STRN3Q13033 LNX1-AS1-203ENST00000511989 488 ntTSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
STRN3Q13033 SNORA40.15-201ENST00000516884 107 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
STRN3Q13033 AL157911.1-202ENST00000554123 502 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
STRN3Q13033 AC008269.2-201ENST00000561915 1105 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
STRN3Q13033 MIR3605-201ENST00000583214 100 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
STRN3Q13033 AL033523.1-201ENST00000605153 153 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
STRN3Q13033 ST7-AS1_1.1-201ENST00000611142 116 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
STRN3Q13033 AC011476.5-201ENST00000615594 130 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
STRN3Q13033 MAP4K3-205ENST00000437545 3924 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
STRN3Q13033 TMPRSS11A-201ENST00000334830 3054 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
STRN3Q13033 Y_RNA.149-201ENST00000363558 117 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
STRN3Q13033 RNU6-727P-201ENST00000363592 107 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
STRN3Q13033 SNORA5B-201ENST00000363786 132 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
STRN3Q13033 Y_RNA.214-201ENST00000364201 112 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
STRN3Q13033 Y_RNA.415-201ENST00000384012 112 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
STRN3Q13033 MIR586-201ENST00000385035 97 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
STRN3Q13033 AL590004.2-201ENST00000404787 371 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
STRN3Q13033 RNA5SP504-201ENST00000410676 117 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
STRN3Q13033 RPS29P6-201ENST00000438196 145 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
STRN3Q13033 TRAPPC2P8-201ENST00000440676 396 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
STRN3Q13033 AL731563.1-201ENST00000442202 214 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
STRN3Q13033 RNU7-14P-201ENST00000459331 62 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
STRN3Q13033 AP001486.1-201ENST00000463339 476 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
STRN3Q13033 AC116563.1-201ENST00000505454 396 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
STRN3Q13033 MTCO2P24-201ENST00000515611 426 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
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STRN3Q13033 RRN3P3-201ENST00000549207 578 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
STRN3Q13033 AC018448.1-201ENST00000552843 316 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
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STRN3Q13033 MARCH7-203ENST00000409591 2147 ntTSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
STRN3Q13033 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
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STRN3Q13033 ARHGAP11A-207ENST00000565905 3318 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
STRN3Q13033 SNORD31B-201ENST00000364977 69 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
STRN3Q13033 Y_RNA.462-201ENST00000384268 102 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
STRN3Q13033 Y_RNA.574-201ENST00000384766 95 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
STRN3Q13033 AL357139.1-201ENST00000407792 426 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
STRN3Q13033 RNU2-48P-201ENST00000410694 191 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
STRN3Q13033 RNA5SP21-201ENST00000410917 96 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
STRN3Q13033 AL355388.1-201ENST00000415726 401 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
STRN3Q13033 ELOCP20-201ENST00000422460 345 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
STRN3Q13033 MTCYBP9-201ENST00000431021 303 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
STRN3Q13033 AC234781.5-202ENST00000453508 426 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
STRN3Q13033 RN7SL499P-201ENST00000481141 276 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
STRN3Q13033 CPSF6-207ENST00000551516 234 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
STRN3Q13033 AC022469.2-201ENST00000554759 396 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
STRN3Q13033 AC135178.3-204ENST00000585181 451 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
STRN3Q13033 AC130454.1-201ENST00000622948 401 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
STRN3Q13033 ANKRD30BP1-201ENST00000451052 2186 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
STRN3Q13033 ZCCHC10-202ENST00000355372 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
STRN3Q13033 MIR410-201ENST00000362222 80 ntBASIC3□□□□□ -1.93
STRN3Q13033 RNU6-770P-201ENST00000363929 105 ntBASIC3□□□□□ -1.93
STRN3Q13033 RNU1-112P-201ENST00000364401 164 ntBASIC3□□□□□ -1.93
STRN3Q13033 RNU6-1026P-201ENST00000384465 108 ntBASIC3□□□□□ -1.93
STRN3Q13033 MIR9-1-201ENST00000385198 89 ntBASIC3□□□□□ -1.93
STRN3Q13033 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC3□□□□□ -1.93
STRN3Q13033 ELOCP21-201ENST00000412558 336 ntBASIC3□□□□□ -1.93
STRN3Q13033 AC008080.3-201ENST00000440074 380 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
STRN3Q13033 RNU6-625P-201ENST00000459412 107 ntBASIC3□□□□□ -1.93
STRN3Q13033 RPS27AP9-201ENST00000477681 438 ntBASIC3□□□□□ -1.93
STRN3Q13033 AL049873.1-201ENST00000480540 376 ntBASIC3□□□□□ -1.93
STRN3Q13033 AC018868.1-201ENST00000491307 315 ntBASIC3□□□□□ -1.93
STRN3Q13033 AC004052.1-202ENST00000505680 516 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
STRN3Q13033 ATP5EP1-201ENST00000510257 156 ntBASIC3□□□□□ -1.93
STRN3Q13033 RNU6-408P-201ENST00000515910 100 ntBASIC3□□□□□ -1.93
STRN3Q13033 RN7SKP132-201ENST00000516001 208 ntBASIC3□□□□□ -1.93
STRN3Q13033 AK6P2-201ENST00000549020 471 ntBASIC3□□□□□ -1.93
STRN3Q13033 AC079600.2-201ENST00000550076 130 ntBASIC3□□□□□ -1.93
STRN3Q13033 GNG2-205ENST00000554736 569 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3□□□□□ -1.93
STRN3Q13033 MGAT4C-210ENST00000620241 3194 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
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