Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 AC012306.1-201ENST00000423267 114 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
FOXF2Q12947 BTF3P11-201ENST00000426582 477 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
FOXF2Q12947 LINC00459-201ENST00000431656 376 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
FOXF2Q12947 AL583835.2-201ENST00000435483 500 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
FOXF2Q12947 CFAP44-AS1-201ENST00000473329 396 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
FOXF2Q12947 AC020703.1-201ENST00000505051 521 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
FOXF2Q12947 AC018448.1-201ENST00000552843 316 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
FOXF2Q12947 SNORA50A-202ENST00000629536 136 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
FOXF2Q12947 LINC00890-202ENST00000569275 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
FOXF2Q12947 DAZ4-201ENST00000382296 2048 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
FOXF2Q12947 MAPK10-362ENST00000641864 4484 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
FOXF2Q12947 SHOC2-201ENST00000265277 3691 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
FOXF2Q12947 MTND5P35-201ENST00000557537 1720 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
FOXF2Q12947 CACNB4-222ENST00000636350 7654 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
FOXF2Q12947 TAB3-203ENST00000378930 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
FOXF2Q12947 OFD1P6Y-202ENST00000451061 2724 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
FOXF2Q12947 AC004944.1-201ENST00000517807 3059 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
FOXF2Q12947 AC110774.1-201ENST00000623567 2018 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
FOXF2Q12947 AC242426.3-202ENST00000607149 2397 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
FOXF2Q12947 Y_RNA.7-201ENST00000362352 102 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
FOXF2Q12947 SNORD56.3-201ENST00000363507 71 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
FOXF2Q12947 Y_RNA.179-201ENST00000363844 90 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
FOXF2Q12947 Y_RNA.215-201ENST00000364204 112 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
FOXF2Q12947 Y_RNA.238-201ENST00000364441 102 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
FOXF2Q12947 RNU6-312P-201ENST00000364629 107 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
FOXF2Q12947 RNU6-805P-201ENST00000365643 106 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
FOXF2Q12947 RNU6-198P-201ENST00000384258 104 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
FOXF2Q12947 RNU6-1168P-201ENST00000390831 104 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
FOXF2Q12947 SNORA26.3-201ENST00000391119 136 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
FOXF2Q12947 SNORA48.8-201ENST00000391324 134 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
FOXF2Q12947 RNA5SP390-201ENST00000410191 113 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
FOXF2Q12947 RNU2-2P-201ENST00000410396 191 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
FOXF2Q12947 RAB28P5-201ENST00000427490 651 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
FOXF2Q12947 AC022018.1-201ENST00000430685 241 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
FOXF2Q12947 AC007179.2-207ENST00000435557 556 ntTSL 4 BASIC2.7□□□□□ -1.98
FOXF2Q12947 AL714022.1-201ENST00000439897 151 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
FOXF2Q12947 AL121594.1-201ENST00000475906 575 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
FOXF2Q12947 PPP2R2B-IT1-201ENST00000505921 447 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
FOXF2Q12947 RNU6-155P-201ENST00000516347 100 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
FOXF2Q12947 RNU6-711P-201ENST00000517255 106 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
FOXF2Q12947 AC090155.2-201ENST00000518854 267 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
FOXF2Q12947 SUMO2P18-201ENST00000518873 252 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
FOXF2Q12947 CYCSP23-201ENST00000519781 313 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
FOXF2Q12947 AC091152.3-201ENST00000604227 325 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
FOXF2Q12947 RNU2-4P-201ENST00000606190 192 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
FOXF2Q12947 AL008718.3-201ENST00000610217 321 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
FOXF2Q12947 U2.15-201ENST00000611544 191 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
FOXF2Q12947 U2.16-201ENST00000613119 191 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
FOXF2Q12947 U2.12-201ENST00000613778 191 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
FOXF2Q12947 U2.9-201ENST00000615427 191 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
FOXF2Q12947 AC004467.1-201ENST00000615678 330 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
FOXF2Q12947 U2.11-201ENST00000616345 191 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
FOXF2Q12947 U2.2-201ENST00000616535 191 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
FOXF2Q12947 U2.3-201ENST00000617785 191 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
FOXF2Q12947 U2.19-201ENST00000618602 191 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
FOXF2Q12947 RNU2-1-201ENST00000618664 191 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
FOXF2Q12947 U2.6-201ENST00000619225 191 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
FOXF2Q12947 U2.5-201ENST00000619465 191 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
FOXF2Q12947 U2.10-201ENST00000620268 191 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
FOXF2Q12947 AC091932.3-201ENST00000624223 323 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
FOXF2Q12947 HIF1A-201ENST00000323441 3555 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
FOXF2Q12947 SAMD9-201ENST00000379958 6852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
FOXF2Q12947 EPS15-202ENST00000371730 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
FOXF2Q12947 CPD-202ENST00000543464 4007 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
FOXF2Q12947 GAGE12B-201ENST00000361446 117 ntAPPRIS P1 BASIC2.69□□□□□ -1.98
FOXF2Q12947 RNU6-1272P-201ENST00000362776 107 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
FOXF2Q12947 Y_RNA.182-201ENST00000363880 111 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
FOXF2Q12947 RNU6-487P-201ENST00000365430 104 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
FOXF2Q12947 Y_RNA.357-201ENST00000365487 109 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
FOXF2Q12947 Y_RNA.412-201ENST00000384001 104 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
FOXF2Q12947 Y_RNA.586-201ENST00000391146 98 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
FOXF2Q12947 RNU6-1077P-201ENST00000410506 102 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
FOXF2Q12947 PTGES3P4-201ENST00000426243 356 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
FOXF2Q12947 SEPT7P4-201ENST00000437076 306 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
FOXF2Q12947 AL445524.1-202ENST00000440665 416 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
FOXF2Q12947 RPS27AP9-201ENST00000477681 438 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
FOXF2Q12947 AC117394.2-201ENST00000487827 323 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
FOXF2Q12947 RNU4ATAC15P-201ENST00000516415 126 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
FOXF2Q12947 SNORD59.2-201ENST00000516873 68 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
FOXF2Q12947 AC010177.1-201ENST00000547819 366 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
FOXF2Q12947 DEFB117-201ENST00000602356 141 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
FOXF2Q12947 AC027045.1-201ENST00000609065 202 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
FOXF2Q12947 AL365222.1-201ENST00000614661 98 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
FOXF2Q12947 SNORD98-201ENST00000636377 67 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
FOXF2Q12947 BCHE-201ENST00000264381 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
FOXF2Q12947 AC000403.1-201ENST00000613696 3585 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
FOXF2Q12947 SYNE1-212ENST00000423061 27436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
FOXF2Q12947 RRAS2-211ENST00000537760 2034 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
FOXF2Q12947 AKAP7-209ENST00000541650 2008 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
FOXF2Q12947 FILIP1L-206ENST00000471562 2854 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
FOXF2Q12947 CATSPERB-201ENST00000256343 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
FOXF2Q12947 SLC30A6-202ENST00000357055 4758 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
FOXF2Q12947 PLOD2-204ENST00000461497 3043 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
FOXF2Q12947 TMPRSS11A-202ENST00000508048 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
FOXF2Q12947 Y_RNA.23-201ENST00000362496 106 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
FOXF2Q12947 RNU4-84P-201ENST00000364200 139 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
FOXF2Q12947 RNU6-19P-201ENST00000384718 107 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
FOXF2Q12947 TRAJ31-201ENST00000390506 57 ntAPPRIS P1 BASIC2.68□□□□□ -1.98
FOXF2Q12947 RNA5SP252-201ENST00000391131 119 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
FOXF2Q12947 AL512633.1-201ENST00000399931 655 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.6 ms