Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 RNU2-44P-201ENST00000516795 194 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CNTN1Q12860 SNORA20.3-201ENST00000516880 132 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CNTN1Q12860 AC084816.1-207ENST00000538317 584 ntTSL 4 BASIC1.82□□□□□ -2.12
CNTN1Q12860 AC026470.2-201ENST00000561492 181 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CNTN1Q12860 AC078899.2-201ENST00000595282 212 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CNTN1Q12860 AC012493.3-201ENST00000604494 112 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CNTN1Q12860 uc_338.5-201ENST00000611839 155 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CNTN1Q12860 TEX41-243ENST00000614173 190 ntTSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
CNTN1Q12860 AL162373.1-201ENST00000620433 407 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CNTN1Q12860 KTN1-214ENST00000554507 2057 ntTSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
CNTN1Q12860 ZNF736P3Y-201ENST00000428264 1465 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CNTN1Q12860 CEP162-201ENST00000257766 5063 ntTSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
CNTN1Q12860 Y_RNA.88-201ENST00000363029 99 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CNTN1Q12860 RNU6-593P-201ENST00000364716 112 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CNTN1Q12860 SNORD31B-201ENST00000364977 69 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CNTN1Q12860 RNU6-438P-201ENST00000365561 103 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CNTN1Q12860 RNU6-1026P-201ENST00000384465 108 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CNTN1Q12860 MIR32-201ENST00000384965 70 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CNTN1Q12860 MIR676-201ENST00000390702 67 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CNTN1Q12860 SUMO2P12-201ENST00000405924 140 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CNTN1Q12860 RPL37P10-201ENST00000412884 288 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CNTN1Q12860 PLCL2-AS1-201ENST00000414844 311 ntTSL 2 BASIC1.81□□□□□ -2.12
CNTN1Q12860 AC123900.1-201ENST00000420390 96 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CNTN1Q12860 AC004386.2-201ENST00000441858 148 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CNTN1Q12860 SNRPEP8-201ENST00000442866 260 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CNTN1Q12860 AL357873.1-201ENST00000449215 282 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
CNTN1Q12860 RN7SL274P-201ENST00000492268 272 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CNTN1Q12860 AC103851.1-201ENST00000506833 274 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CNTN1Q12860 LINC02233-201ENST00000513718 358 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
CNTN1Q12860 AC009107.1-201ENST00000561923 330 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
CNTN1Q12860 MPP6-209ENST00000625307 126 ntTSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
CNTN1Q12860 LINC02555-201ENST00000563933 1951 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CNTN1Q12860 FSD1L-201ENST00000374707 7062 ntTSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
CNTN1Q12860 ZNF299P-201ENST00000406845 1804 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CNTN1Q12860 ZNF404-202ENST00000587539 1851 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
CNTN1Q12860 RNU1-58P-201ENST00000362413 163 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CNTN1Q12860 SNORA16.1-201ENST00000364597 132 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CNTN1Q12860 SNORD81.2-201ENST00000365153 76 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CNTN1Q12860 RNU6-601P-201ENST00000384540 107 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CNTN1Q12860 RNU6-160P-201ENST00000384591 107 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CNTN1Q12860 MIR597-201ENST00000384968 97 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CNTN1Q12860 RNA5SP465-201ENST00000391195 109 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CNTN1Q12860 Y_RNA.594-201ENST00000410373 140 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CNTN1Q12860 AC004866.1-201ENST00000411748 78 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CNTN1Q12860 KRTAP25-1-201ENST00000416044 370 ntAPPRIS P1 BASIC1.8□□□□□ -2.12
CNTN1Q12860 AC096920.1-201ENST00000423991 241 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CNTN1Q12860 MTCO3P8-201ENST00000453691 755 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CNTN1Q12860 AC016925.1-201ENST00000458303 298 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CNTN1Q12860 snoU13.30-201ENST00000458951 104 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CNTN1Q12860 RPL30P10-201ENST00000488148 337 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CNTN1Q12860 AC116353.2-201ENST00000505332 712 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CNTN1Q12860 SNORA25.15-201ENST00000516487 89 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CNTN1Q12860 AP005660.1-201ENST00000522972 293 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CNTN1Q12860 AC087441.2-201ENST00000529141 262 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CNTN1Q12860 AP003174.2-201ENST00000544663 294 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
CNTN1Q12860 AC036222.2-201ENST00000579033 333 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
CNTN1Q12860 MIR5006-201ENST00000583027 110 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CNTN1Q12860 RMST_6.1-201ENST00000611980 203 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CNTN1Q12860 TCL6_2.1-201ENST00000615162 119 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CNTN1Q12860 ST7-OT4_1.1-201ENST00000615322 200 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CNTN1Q12860 AL590240.4-201ENST00000616908 390 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CNTN1Q12860 SDR42E1P4-201ENST00000620894 481 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CNTN1Q12860 AC091932.3-201ENST00000624223 323 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CNTN1Q12860 AL807742.1-203ENST00000637444 759 ntTSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
CNTN1Q12860 BX322639.1-202ENST00000423987 2213 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CNTN1Q12860 DEUP1-202ENST00000525646 1920 ntTSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
CNTN1Q12860 ZNF204P-201ENST00000416749 2397 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CNTN1Q12860 SAGE1-202ENST00000370709 2879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
CNTN1Q12860 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
CNTN1Q12860 MIR340-201ENST00000362125 95 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CNTN1Q12860 Y_RNA.48-201ENST00000362710 103 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CNTN1Q12860 RNU6-595P-201ENST00000363944 107 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CNTN1Q12860 SNORD114-6-201ENST00000364393 72 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CNTN1Q12860 Y_RNA.482-201ENST00000384377 111 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CNTN1Q12860 RNU11-3P-201ENST00000391111 133 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CNTN1Q12860 AL627390.1-201ENST00000396055 340 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CNTN1Q12860 RNU6-1050P-201ENST00000410388 107 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CNTN1Q12860 AC098614.3-201ENST00000438957 440 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CNTN1Q12860 AC009237.7-201ENST00000447357 229 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CNTN1Q12860 HMGN1P12-201ENST00000499125 195 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CNTN1Q12860 HMGB3P17-201ENST00000504195 649 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CNTN1Q12860 Y_RNA.670-201ENST00000516255 105 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CNTN1Q12860 Y_RNA.691-201ENST00000516611 103 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CNTN1Q12860 RNU6-250P-201ENST00000516958 103 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CNTN1Q12860 AC023200.1-201ENST00000519660 651 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
CNTN1Q12860 CBX3P8-201ENST00000532412 525 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CNTN1Q12860 AC027018.1-202ENST00000534723 383 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
CNTN1Q12860 AC007450.1-201ENST00000536492 188 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
CNTN1Q12860 AC022035.1-201ENST00000579923 302 ntTSL 2 BASIC1.79□□□□□ -2.12
CNTN1Q12860 SNRPGP20-201ENST00000604477 205 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CNTN1Q12860 TP73-AS1.1-201ENST00000611447 161 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CNTN1Q12860 CDKN3-212ENST00000620759 196 ntTSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
CNTN1Q12860 AC130454.1-201ENST00000622948 401 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CNTN1Q12860 TPTEP1-208ENST00000636884 213 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CNTN1Q12860 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
CNTN1Q12860 RNA5SP276-201ENST00000362580 94 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CNTN1Q12860 RNU6-545P-201ENST00000362681 104 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CNTN1Q12860 RNU6-23P-201ENST00000363283 107 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CNTN1Q12860 SNORD115-8-201ENST00000363856 82 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CNTN1Q12860 RNA5SP493-201ENST00000364115 91 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
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