Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 FMO2-201ENST00000209929 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
PTPREP23469 OSBPL8-202ENST00000393249 7047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
PTPREP23469 TBC1D31-210ENST00000521676 3256 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
PTPREP23469 RNU6-655P-201ENST00000362858 107 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
PTPREP23469 Y_RNA.265-201ENST00000364677 108 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
PTPREP23469 MIR759-201ENST00000390224 91 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
PTPREP23469 PVALB-202ENST00000404171 422 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
PTPREP23469 RNU5F-4P-201ENST00000516581 114 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
PTPREP23469 IGLL4P-201ENST00000614590 133 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
PTPREP23469 OR10D3-202ENST00000641351 3561 ntAPPRIS P1 BASIC4.74□□□□□ -1.65
PTPREP23469 AC024940.1-206ENST00000632817 4299 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
PTPREP23469 MAPK10-253ENST00000641010 4072 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
PTPREP23469 DOCK7-218ENST00000635123 6297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPREP23469 MPDZ-215ENST00000541718 7603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPREP23469 AC007656.2-201ENST00000624902 4547 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPREP23469 ZNF705A-201ENST00000359286 3455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPREP23469 OSBPL6-201ENST00000190611 10513 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPREP23469 GABRB2-203ENST00000393959 7191 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPREP23469 RNU6-1125P-201ENST00000363601 107 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPREP23469 SNORD74.4-201ENST00000364129 80 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPREP23469 SNORA7.2-201ENST00000364446 145 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPREP23469 RNU6-1276P-201ENST00000365372 104 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPREP23469 Y_RNA.344-201ENST00000365381 112 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPREP23469 MIR449B-201ENST00000384995 97 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPREP23469 MT-TI-201ENST00000387365 69 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPREP23469 EIF4EP4-201ENST00000424916 578 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPREP23469 RNU6-221P-201ENST00000459541 99 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPREP23469 AC024022.1-202ENST00000508911 394 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPREP23469 RNU2-13P-201ENST00000515909 113 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPREP23469 RNA5SP367-201ENST00000516557 118 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPREP23469 AC011602.1-201ENST00000546484 331 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPREP23469 LINC02164-201ENST00000566684 272 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPREP23469 AC022601.1-201ENST00000596954 577 ntTSL 4 BASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPREP23469 MCF2-201ENST00000338585 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPREP23469 OR8K3-204ENST00000641689 2380 ntAPPRIS P1 BASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPREP23469 KYNU-201ENST00000264170 15316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPREP23469 MGA-202ENST00000545763 11413 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPREP23469 AC000403.1-201ENST00000613696 3585 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPREP23469 SLC38A9-223ENST00000515629 2673 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPREP23469 MTTP-201ENST00000265517 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPREP23469 ADGRL2-208ENST00000370725 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPREP23469 GPR180-201ENST00000376958 8822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPREP23469 CACNB4-257ENST00000637547 7658 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPREP23469 MIR448-201ENST00000362131 111 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPREP23469 RNA5SP124-201ENST00000362739 110 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPREP23469 RNU6-242P-201ENST00000384359 107 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPREP23469 HSPE1P12-201ENST00000412576 301 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPREP23469 AC063976.3-201ENST00000426849 329 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPREP23469 RPS4XP11-201ENST00000446897 772 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPREP23469 HMGN2P21-201ENST00000447764 270 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPREP23469 AC025445.1-201ENST00000502728 300 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPREP23469 RNU6-1270P-201ENST00000517128 108 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPREP23469 AC007450.1-201ENST00000536492 188 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPREP23469 AC243829.5-201ENST00000578447 247 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPREP23469 AC012493.2-201ENST00000595083 291 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPREP23469 PHF20L1-210ENST00000395390 5900 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPREP23469 PTP4A1-205ENST00000626021 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPREP23469 GHR-208ENST00000612382 4699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPREP23469 RBBP6-203ENST00000381039 3384 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
PTPREP23469 MYCBP2-211ENST00000544440 14664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
PTPREP23469 EYS-202ENST00000342421 2168 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
PTPREP23469 CEP57-213ENST00000541150 2911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
PTPREP23469 DMD-207ENST00000378677 13932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
PTPREP23469 UBE4A-201ENST00000252108 6103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
PTPREP23469 RNA5SP387-201ENST00000364226 106 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
PTPREP23469 Y_RNA.290-201ENST00000364879 114 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
PTPREP23469 KRTAP19-8-201ENST00000382822 318 ntAPPRIS P1 BASIC4.71□□□□□ -1.66
PTPREP23469 SNORD61-201ENST00000384252 73 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
PTPREP23469 SNORA11.1-201ENST00000408133 129 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
PTPREP23469 MIR1283-1-201ENST00000408494 87 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
PTPREP23469 AC006011.1-201ENST00000442758 349 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
PTPREP23469 AL441985.1-201ENST00000457727 251 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
PTPREP23469 LINC01969-201ENST00000514468 455 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
PTPREP23469 MIR3944-201ENST00000581277 108 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
PTPREP23469 AL121772.2-201ENST00000614331 297 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
PTPREP23469 AC073308.1-201ENST00000623696 305 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
PTPREP23469 LINS1-201ENST00000314742 4821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
PTPREP23469 FGD4-211ENST00000531134 2924 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
PTPREP23469 F8-202ENST00000360256 9059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
PTPREP23469 LRMP-201ENST00000354454 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
PTPREP23469 ESCO1-201ENST00000269214 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
PTPREP23469 ADGRG4-201ENST00000370652 9820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
PTPREP23469 Y_RNA.73-201ENST00000362910 113 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PTPREP23469 RNU6-279P-201ENST00000391297 101 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PTPREP23469 RNA5SP104-201ENST00000410989 118 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PTPREP23469 RNU6-57P-201ENST00000411348 103 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PTPREP23469 AC093159.1-201ENST00000416845 424 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
PTPREP23469 AL139254.1-201ENST00000421114 376 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
PTPREP23469 MIR4753-201ENST00000585119 83 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PTPREP23469 GALP-203ENST00000590002 150 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
PTPREP23469 AC007229.1-201ENST00000590455 412 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PTPREP23469 JPX_2.1-201ENST00000614161 69 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PTPREP23469 U6.73-201ENST00000619194 103 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PTPREP23469 LGI1-210ENST00000629035 2251 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
PTPREP23469 ATF7IP2-202ENST00000356427 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
PTPREP23469 ZNF962P-201ENST00000443465 3140 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PTPREP23469 ST7-221ENST00000465133 2155 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
PTPREP23469 AC007496.3-201ENST00000624987 3443 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPREP23469 DAZ4-202ENST00000382314 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPREP23469 NFAT5-203ENST00000393742 13067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.6 ms