Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Length 708 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 SNORA74C-2-201ENST00000411179 201 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
RABGEF1Q9UJ41 RPL30P4-201ENST00000429309 333 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
RABGEF1Q9UJ41 HLA-N-201ENST00000437516 135 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
RABGEF1Q9UJ41 AC112771.1-201ENST00000463581 102 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
RABGEF1Q9UJ41 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
RABGEF1Q9UJ41 TRAV8-5-201ENST00000537369 341 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
RABGEF1Q9UJ41 AC069240.1-201ENST00000548774 375 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
RABGEF1Q9UJ41 HIGD1AP1-201ENST00000550979 275 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
RABGEF1Q9UJ41 AC019288.1-201ENST00000557918 224 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
RABGEF1Q9UJ41 MIR3163-201ENST00000581592 73 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
RABGEF1Q9UJ41 U7.3-201ENST00000616123 62 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
RABGEF1Q9UJ41 AC007546.2-201ENST00000623996 360 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
RABGEF1Q9UJ41 AC068544.1-201ENST00000635064 248 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
RABGEF1Q9UJ41 RIMS1-204ENST00000401910 3542 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
RABGEF1Q9UJ41 TMEM106B-201ENST00000396667 12539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
RABGEF1Q9UJ41 ERICH3-AS1-202ENST00000612390 4874 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
RABGEF1Q9UJ41 CADM2-AS1-201ENST00000476021 2656 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
RABGEF1Q9UJ41 PCAT4-201ENST00000504263 2091 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
RABGEF1Q9UJ41 RXFP1-204ENST00000423548 3930 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
RABGEF1Q9UJ41 R3HCC1L-205ENST00000612478 3337 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP479-201ENST00000364858 117 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-24P-201ENST00000384440 107 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
RABGEF1Q9UJ41 MIR659-201ENST00000384963 97 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
RABGEF1Q9UJ41 RNU6ATAC5P-201ENST00000388104 126 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
RABGEF1Q9UJ41 U8.17-201ENST00000391292 132 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
RABGEF1Q9UJ41 RPL21P3-201ENST00000395517 478 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP104-201ENST00000410989 118 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
RABGEF1Q9UJ41 AC012671.1-201ENST00000451912 203 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
RABGEF1Q9UJ41 VWA8P1-201ENST00000510889 176 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
RABGEF1Q9UJ41 MIR5197-201ENST00000583721 112 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
RABGEF1Q9UJ41 SMCR2_2.1-201ENST00000619783 161 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
RABGEF1Q9UJ41 MIR376A2-201ENST00000636782 80 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
RABGEF1Q9UJ41 SCN3A-209ENST00000639244 8854 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
RABGEF1Q9UJ41 PIK3C2G-203ENST00000535651 2497 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
RABGEF1Q9UJ41 OTOGL-202ENST00000458043 8083 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
RABGEF1Q9UJ41 IL33-201ENST00000381434 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
RABGEF1Q9UJ41 DDX60L-209ENST00000511577 6781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
RABGEF1Q9UJ41 PCDH11X-205ENST00000373094 9179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
RABGEF1Q9UJ41 NLGN1-206ENST00000457714 8242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
RABGEF1Q9UJ41 CFTR-201ENST00000003084 6132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
RABGEF1Q9UJ41 PIGN-229ENST00000638936 4233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
RABGEF1Q9UJ41 ORC4-201ENST00000264169 6598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
RABGEF1Q9UJ41 AC006504.1-201ENST00000562493 3666 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
RABGEF1Q9UJ41 LINC01505-206ENST00000637046 4266 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
RABGEF1Q9UJ41 UTP20-201ENST00000261637 9025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
RABGEF1Q9UJ41 TENM1-201ENST00000371130 12875 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
RABGEF1Q9UJ41 RNU1-22P-201ENST00000363334 158 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-979P-201ENST00000383896 107 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-644P-201ENST00000391155 98 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
RABGEF1Q9UJ41 AL162591.2-201ENST00000449634 317 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
RABGEF1Q9UJ41 AC025445.1-201ENST00000502728 300 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
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RABGEF1Q9UJ41 AC068657.1-201ENST00000520807 306 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
RABGEF1Q9UJ41 AC113192.5-201ENST00000528779 486 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
RABGEF1Q9UJ41 IGKV2OR2-8-201ENST00000558710 300 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
RABGEF1Q9UJ41 AC007598.1-202ENST00000561528 435 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
RABGEF1Q9UJ41 MIR5588-201ENST00000581890 63 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
RABGEF1Q9UJ41 AC011944.2-201ENST00000624440 683 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
RABGEF1Q9UJ41 MIR4662A-201ENST00000637499 67 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
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RABGEF1Q9UJ41 EYA4-202ENST00000355286 4317 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
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RABGEF1Q9UJ41 NCOA1-201ENST00000288599 6952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-1104P-201ENST00000384723 104 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
RABGEF1Q9UJ41 MIR548A2-201ENST00000384956 97 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP129-201ENST00000410276 118 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
RABGEF1Q9UJ41 VDAC1P3-201ENST00000434069 851 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
RABGEF1Q9UJ41 RNU7-164P-201ENST00000459221 62 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
RABGEF1Q9UJ41 RPS29P21-201ENST00000496272 170 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP468-201ENST00000516782 93 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
RABGEF1Q9UJ41 RN7SKP282-201ENST00000516824 299 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
RABGEF1Q9UJ41 CYP4A43P-201ENST00000568156 121 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
RABGEF1Q9UJ41 MIR4666B-201ENST00000578142 81 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
RABGEF1Q9UJ41 LINC01533-202ENST00000588694 632 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
RABGEF1Q9UJ41 KIAA1524-208ENST00000625495 147 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
RABGEF1Q9UJ41 QSER1-201ENST00000399302 9335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
RABGEF1Q9UJ41 EXOC1-202ENST00000349598 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
RABGEF1Q9UJ41 ARHGAP11A-207ENST00000565905 3318 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
RABGEF1Q9UJ41 AKAP7-209ENST00000541650 2008 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
RABGEF1Q9UJ41 PRKAA2-202ENST00000610361 9280 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
RABGEF1Q9UJ41 IMPG2-201ENST00000193391 8337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
RABGEF1Q9UJ41 CYYR1-AS1-201ENST00000357401 3412 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
RABGEF1Q9UJ41 CNGB3-201ENST00000320005 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
RABGEF1Q9UJ41 UNC13C-201ENST00000260323 12946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
RABGEF1Q9UJ41 ABI3BP-206ENST00000471714 6783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
RABGEF1Q9UJ41 NEDD4-201ENST00000338963 7019 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.10-201ENST00000362371 110 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-1099P-201ENST00000363533 107 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-944P-201ENST00000364023 107 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP509-201ENST00000364577 119 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-675P-201ENST00000384236 104 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
RABGEF1Q9UJ41 RNU2-49P-201ENST00000410666 184 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.621-201ENST00000411065 96 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
RABGEF1Q9UJ41 AC004975.1-201ENST00000428733 208 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
RABGEF1Q9UJ41 RPL23AP93-201ENST00000440847 484 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
RABGEF1Q9UJ41 RNU7-172P-201ENST00000517125 64 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
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