Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SH3BP4Q9P0V3 PLCL2-AS1-201ENST00000414844 311 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SH3BP4Q9P0V3 AC092427.1-202ENST00000430569 476 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SH3BP4Q9P0V3 RPS29P6-201ENST00000438196 145 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SH3BP4Q9P0V3 AL445524.1-202ENST00000440665 416 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SH3BP4Q9P0V3 AIG1P1-201ENST00000503376 148 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SH3BP4Q9P0V3 SCGB1D5P-201ENST00000515134 247 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-138P-201ENST00000515952 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-1198P-201ENST00000516904 67 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SH3BP4Q9P0V3 AC103726.1-201ENST00000520785 474 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SH3BP4Q9P0V3 AC124657.1-201ENST00000527819 429 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SH3BP4Q9P0V3 AP001318.2-201ENST00000533378 492 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SH3BP4Q9P0V3 AK6P2-201ENST00000549020 471 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SH3BP4Q9P0V3 AC012493.2-201ENST00000595083 291 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SH3BP4Q9P0V3 AL138963.2-201ENST00000605137 226 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SH3BP4Q9P0V3 FPGT-TNNI3K-202ENST00000370895 7566 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SH3BP4Q9P0V3 MDM2-206ENST00000350057 1401 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
SH3BP4Q9P0V3 CYSLTR1-201ENST00000373304 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
SH3BP4Q9P0V3 DYNC2H1-202ENST00000375735 13678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
SH3BP4Q9P0V3 ERBIN-202ENST00000380935 6692 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-1159P-201ENST00000362933 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-461P-201ENST00000364195 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-200P-201ENST00000364743 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SH3BP4Q9P0V3 MIR181A2-201ENST00000384863 110 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SH3BP4Q9P0V3 MIR549A-201ENST00000385268 96 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP201-201ENST00000410316 124 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SH3BP4Q9P0V3 AC121342.1-201ENST00000423914 550 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SH3BP4Q9P0V3 AC112220.1-201ENST00000434628 355 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SH3BP4Q9P0V3 LINC02041-201ENST00000440726 246 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SH3BP4Q9P0V3 AC010095.1-201ENST00000443543 144 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SH3BP4Q9P0V3 AC012308.1-201ENST00000451232 178 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SH3BP4Q9P0V3 IFT74-AS1-201ENST00000456198 405 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SH3BP4Q9P0V3 SAR1B-211ENST00000509937 455 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SH3BP4Q9P0V3 SNORA40.9-201ENST00000515895 93 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP54-201ENST00000516951 92 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SH3BP4Q9P0V3 AC083973.1-205ENST00000518994 601 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SH3BP4Q9P0V3 LINC01570-201ENST00000561572 434 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SH3BP4Q9P0V3 AC141273.1-201ENST00000565300 479 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SH3BP4Q9P0V3 CYP4A27P-201ENST00000567218 190 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SH3BP4Q9P0V3 AC055872.1-201ENST00000570978 278 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SH3BP4Q9P0V3 MIR3136-201ENST00000583498 78 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SH3BP4Q9P0V3 AC090115.4-201ENST00000609970 188 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SH3BP4Q9P0V3 AC091953.5-201ENST00000622919 233 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SH3BP4Q9P0V3 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
SH3BP4Q9P0V3 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
SH3BP4Q9P0V3 CHD1-201ENST00000284049 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
SH3BP4Q9P0V3 IL6ST-201ENST00000336909 8776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SH3BP4Q9P0V3 ZNF334-205ENST00000615481 3706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SH3BP4Q9P0V3 AL035425.3-201ENST00000564206 4996 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SH3BP4Q9P0V3 BX322639.1-202ENST00000423987 2213 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SH3BP4Q9P0V3 LTN1-201ENST00000361371 7685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
SH3BP4Q9P0V3 Z82195.2-201ENST00000612348 18351 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SH3BP4Q9P0V3 CEP57L1-223ENST00000523787 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-1266P-201ENST00000362794 105 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP374-201ENST00000362939 125 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.515-201ENST00000384535 112 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SH3BP4Q9P0V3 AL355388.1-201ENST00000415726 401 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SH3BP4Q9P0V3 AC138623.1-201ENST00000418060 216 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SH3BP4Q9P0V3 AL353743.2-202ENST00000439544 473 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SH3BP4Q9P0V3 AL592309.2-201ENST00000444647 607 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SH3BP4Q9P0V3 AL139109.1-201ENST00000455491 297 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SH3BP4Q9P0V3 RPL23AP70-201ENST00000483361 460 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SH3BP4Q9P0V3 SERF1AP1-201ENST00000514575 187 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SH3BP4Q9P0V3 VTRNA2-2P-201ENST00000516091 103 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SH3BP4Q9P0V3 RN7SKP40-201ENST00000517211 242 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SH3BP4Q9P0V3 AC130289.1-201ENST00000577321 73 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SH3BP4Q9P0V3 YPEL5P2-201ENST00000605553 359 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SH3BP4Q9P0V3 U2.14-201ENST00000615943 113 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SH3BP4Q9P0V3 PIK3C2G-202ENST00000433979 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SH3BP4Q9P0V3 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SH3BP4Q9P0V3 AL359854.1-201ENST00000614203 1594 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SH3BP4Q9P0V3 AL109809.4-201ENST00000603520 2185 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SH3BP4Q9P0V3 EFCAB3-202ENST00000450662 1694 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SH3BP4Q9P0V3 OR4K2-204ENST00000641885 8681 ntAPPRIS P1 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SH3BP4Q9P0V3 ANKAR-201ENST00000313581 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
SH3BP4Q9P0V3 MIR422A-201ENST00000362286 90 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SH3BP4Q9P0V3 RNU4-90P-201ENST00000362773 141 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-626P-201ENST00000363354 107 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-280P-201ENST00000364145 104 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.277-201ENST00000364754 102 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-20P-201ENST00000384106 107 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-378P-201ENST00000384324 107 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SH3BP4Q9P0V3 CBX3P9-201ENST00000402326 552 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SH3BP4Q9P0V3 RNU4-30P-201ENST00000410245 143 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SH3BP4Q9P0V3 AC007395.1-201ENST00000451333 677 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SH3BP4Q9P0V3 AP001324.2-201ENST00000461163 319 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SH3BP4Q9P0V3 LNX1-AS1-203ENST00000511989 488 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SH3BP4Q9P0V3 AC139720.2-201ENST00000514766 440 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP112-201ENST00000515937 99 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-966P-201ENST00000516479 104 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SH3BP4Q9P0V3 SCARNA24.2-201ENST00000516968 130 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SH3BP4Q9P0V3 AC018904.1-201ENST00000560594 542 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SH3BP4Q9P0V3 LINC02165-201ENST00000563061 443 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SH3BP4Q9P0V3 AC022809.1-201ENST00000579247 428 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SH3BP4Q9P0V3 AC023043.3-201ENST00000593113 385 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SH3BP4Q9P0V3 MZT1P2-201ENST00000604387 248 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SH3BP4Q9P0V3 AL034555.1-201ENST00000604816 211 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SH3BP4Q9P0V3 SNORD113-5-201ENST00000607261 78 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SH3BP4Q9P0V3 AC010999.1-201ENST00000611856 324 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SH3BP4Q9P0V3 FAM214A-204ENST00000546305 3697 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.3 ms