Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD43

PTPRH, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase H, humanhuman

Predictions only

Length 1,115 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRHQ9HD43 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
PTPRHQ9HD43 RNU6-743P-201ENST00000364151 106 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
PTPRHQ9HD43 SNORD31B-201ENST00000364977 69 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
PTPRHQ9HD43 Y_RNA.332-201ENST00000365271 113 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
PTPRHQ9HD43 RNU6-842P-201ENST00000384269 107 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
PTPRHQ9HD43 RNU6-160P-201ENST00000384591 107 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
PTPRHQ9HD43 MIR300-201ENST00000401138 83 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
PTPRHQ9HD43 MIR548P-201ENST00000408336 84 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
PTPRHQ9HD43 RNU6-174P-201ENST00000410406 106 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
PTPRHQ9HD43 AL353148.1-201ENST00000449761 463 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
PTPRHQ9HD43 HMGN2P18-201ENST00000450680 270 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
PTPRHQ9HD43 RPL30P15-201ENST00000457129 321 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
PTPRHQ9HD43 RN7SKP210-201ENST00000459176 261 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
PTPRHQ9HD43 Y_RNA.631-201ENST00000459607 101 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
PTPRHQ9HD43 AF186996.7-201ENST00000492781 209 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
PTPRHQ9HD43 LINC02425-201ENST00000536217 376 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
PTPRHQ9HD43 AC002558.3-201ENST00000574021 401 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
PTPRHQ9HD43 MIR5696-201ENST00000578474 85 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
PTPRHQ9HD43 AL589935.1-202ENST00000612512 393 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
PTPRHQ9HD43 PISRT1.1-201ENST00000616930 107 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
PTPRHQ9HD43 ZEB2_AS1_1.1-201ENST00000621504 128 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
PTPRHQ9HD43 FAR1-204ENST00000532502 5820 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
PTPRHQ9HD43 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
PTPRHQ9HD43 APCS-201ENST00000255040 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
PTPRHQ9HD43 Y_RNA.112-201ENST00000363250 102 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PTPRHQ9HD43 SNORD115-8-201ENST00000363856 82 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PTPRHQ9HD43 SNORD115-38-201ENST00000365037 82 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PTPRHQ9HD43 Y_RNA.473-201ENST00000384333 102 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PTPRHQ9HD43 MIR559-201ENST00000385188 96 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PTPRHQ9HD43 MIR153-2-201ENST00000385225 87 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PTPRHQ9HD43 SNORA75.6-201ENST00000391318 127 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PTPRHQ9HD43 AL590004.1-201ENST00000405321 300 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PTPRHQ9HD43 AC123900.1-201ENST00000420390 96 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PTPRHQ9HD43 AC035139.1-201ENST00000423256 273 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
PTPRHQ9HD43 KCNMA1-AS2-201ENST00000428936 427 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
PTPRHQ9HD43 MTND2P29-201ENST00000438595 412 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PTPRHQ9HD43 AL137792.2-201ENST00000443484 235 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PTPRHQ9HD43 AL035666.1-201ENST00000446195 348 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PTPRHQ9HD43 AP000705.1-201ENST00000454567 350 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PTPRHQ9HD43 snoU13.6-201ENST00000458785 104 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PTPRHQ9HD43 AC055731.1-201ENST00000474387 401 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PTPRHQ9HD43 RPL7P42-201ENST00000481005 679 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PTPRHQ9HD43 RNU6-991P-201ENST00000516168 107 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PTPRHQ9HD43 RNU4ATAC7P-201ENST00000516280 125 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PTPRHQ9HD43 AP005436.2-201ENST00000528458 252 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
PTPRHQ9HD43 AC021269.2-201ENST00000532318 330 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PTPRHQ9HD43 MIR3171-201ENST00000584270 74 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PTPRHQ9HD43 TCL6_2.1-201ENST00000615162 119 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PTPRHQ9HD43 uc_338.22-201ENST00000622722 187 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PTPRHQ9HD43 AL591030.1-201ENST00000626131 627 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
PTPRHQ9HD43 MIR21-201ENST00000362134 72 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PTPRHQ9HD43 Y_RNA.132-201ENST00000363421 102 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PTPRHQ9HD43 RNU6-1059P-201ENST00000363752 98 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PTPRHQ9HD43 RNU6-1040P-201ENST00000383974 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PTPRHQ9HD43 TRAV41-201ENST00000390468 336 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
PTPRHQ9HD43 AL355497.1-201ENST00000406262 551 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PTPRHQ9HD43 MIR1262-201ENST00000408276 93 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PTPRHQ9HD43 AC093382.1-201ENST00000413311 379 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
PTPRHQ9HD43 USMG5P1-201ENST00000425964 177 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PTPRHQ9HD43 AL353743.2-202ENST00000439544 473 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
PTPRHQ9HD43 AL118496.2-201ENST00000448300 230 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PTPRHQ9HD43 RNU1-131P-201ENST00000458943 161 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PTPRHQ9HD43 RNU6-307P-201ENST00000516743 106 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PTPRHQ9HD43 AC087441.2-201ENST00000529141 262 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PTPRHQ9HD43 AP003715.1-201ENST00000532109 435 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
PTPRHQ9HD43 SNORD53-201ENST00000579969 78 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PTPRHQ9HD43 AL355512.1-202ENST00000607952 209 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
PTPRHQ9HD43 ZNRD1-AS1_3.8-201ENST00000611686 104 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PTPRHQ9HD43 AC022202.1-201ENST00000613515 211 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PTPRHQ9HD43 DSCR8-208ENST00000614538 403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
PTPRHQ9HD43 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
PTPRHQ9HD43 BX322639.1-202ENST00000423987 2213 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PTPRHQ9HD43 ZNF299P-201ENST00000406845 1804 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PTPRHQ9HD43 ZNF334-205ENST00000615481 3706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
PTPRHQ9HD43 AC130466.1-201ENST00000636354 4683 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
PTPRHQ9HD43 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
PTPRHQ9HD43 RNU6-1115P-201ENST00000362490 106 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PTPRHQ9HD43 RNU6-245P-201ENST00000384020 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PTPRHQ9HD43 RNU6-890P-201ENST00000384121 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PTPRHQ9HD43 RNU4-53P-201ENST00000410828 140 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PTPRHQ9HD43 AC018634.1-201ENST00000437554 401 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PTPRHQ9HD43 snoU13.30-201ENST00000458951 104 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PTPRHQ9HD43 RNU7-14P-201ENST00000459331 62 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PTPRHQ9HD43 RNA5SP24-201ENST00000516478 95 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PTPRHQ9HD43 RNA5SP384-201ENST00000516615 116 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PTPRHQ9HD43 Y_RNA.711-201ENST00000516993 102 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PTPRHQ9HD43 SNRPGP18-201ENST00000553000 214 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PTPRHQ9HD43 MIR5007-201ENST00000583098 95 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PTPRHQ9HD43 AC005899.2-201ENST00000584353 90 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PTPRHQ9HD43 AC130454.1-201ENST00000622948 401 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PTPRHQ9HD43 AC064859.1-201ENST00000624741 174 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PTPRHQ9HD43 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
PTPRHQ9HD43 E2F5-208ENST00000521429 1551 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
PTPRHQ9HD43 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
PTPRHQ9HD43 Y_RNA.5-201ENST00000362334 102 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PTPRHQ9HD43 RNU1-58P-201ENST00000362413 163 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PTPRHQ9HD43 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PTPRHQ9HD43 Y_RNA.445-201ENST00000384168 102 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PTPRHQ9HD43 snosnR66.1-201ENST00000391095 99 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PTPRHQ9HD43 SNORA3.2-201ENST00000408221 125 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.8 ms