Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 AASDH-207ENST00000513376 3241 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
TRAPPC9Q96Q05 OGN-202ENST00000375561 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
TRAPPC9Q96Q05 MTND5P16-201ENST00000460269 1703 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TRAPPC9Q96Q05 DNAH7-201ENST00000312428 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
TRAPPC9Q96Q05 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-222P-201ENST00000362438 107 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-280P-201ENST00000364145 104 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TRAPPC9Q96Q05 SNORA67.1-201ENST00000364749 141 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TRAPPC9Q96Q05 MIR10B-201ENST00000385011 110 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TRAPPC9Q96Q05 AL357139.1-201ENST00000407792 426 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TRAPPC9Q96Q05 MRPS18CP6-201ENST00000423587 223 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TRAPPC9Q96Q05 WARS2P1-201ENST00000429678 537 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TRAPPC9Q96Q05 USP9YP16-201ENST00000430287 407 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TRAPPC9Q96Q05 CEP57L1P1-201ENST00000430943 1201 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TRAPPC9Q96Q05 USP9YP23-201ENST00000455085 407 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TRAPPC9Q96Q05 AC079340.1-201ENST00000504799 552 ntTSL 4 BASIC2.49□□□□□ -2.01
TRAPPC9Q96Q05 AC105758.1-201ENST00000506038 399 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TRAPPC9Q96Q05 AC008413.1-201ENST00000511864 177 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TRAPPC9Q96Q05 LINC01337-201ENST00000515871 440 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-1114P-201ENST00000516022 107 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-976P-201ENST00000516086 111 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TRAPPC9Q96Q05 RNU7-4P-201ENST00000516961 62 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TRAPPC9Q96Q05 AC121758.2-201ENST00000553271 193 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TRAPPC9Q96Q05 UBL5P4-201ENST00000562584 236 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TRAPPC9Q96Q05 AC090617.3-201ENST00000573670 475 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TRAPPC9Q96Q05 MIR5694-201ENST00000581190 76 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TRAPPC9Q96Q05 MIR5006-201ENST00000583027 110 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TRAPPC9Q96Q05 MIR5092-201ENST00000583139 88 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TRAPPC9Q96Q05 AL355512.1-202ENST00000607952 209 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
TRAPPC9Q96Q05 AL359314.1-201ENST00000616913 261 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TRAPPC9Q96Q05 TAB3-205ENST00000378933 6671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
TRAPPC9Q96Q05 PARPBP-201ENST00000327680 3014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
TRAPPC9Q96Q05 RNU5F-3P-201ENST00000363767 117 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-873P-201ENST00000363833 107 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
TRAPPC9Q96Q05 RNU1-91P-201ENST00000364746 163 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
TRAPPC9Q96Q05 SNORD42.2-201ENST00000365570 69 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
TRAPPC9Q96Q05 RNA5SP213-201ENST00000391031 106 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
TRAPPC9Q96Q05 AC009237.7-201ENST00000447357 229 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
TRAPPC9Q96Q05 HMGN2P18-201ENST00000450680 270 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
TRAPPC9Q96Q05 PRELID3BP1-201ENST00000457142 540 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
TRAPPC9Q96Q05 RNU7-14P-201ENST00000459331 62 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
TRAPPC9Q96Q05 RNU7-87P-201ENST00000459343 62 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
TRAPPC9Q96Q05 AC010210.1-203ENST00000513905 260 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
TRAPPC9Q96Q05 SNORA25.14-201ENST00000516481 132 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
TRAPPC9Q96Q05 RNA5SP148-201ENST00000516527 94 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
TRAPPC9Q96Q05 RNU1-104P-201ENST00000517280 175 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
TRAPPC9Q96Q05 ANP32BP3-201ENST00000559213 706 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
TRAPPC9Q96Q05 DISC1FP1-204ENST00000563681 466 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
TRAPPC9Q96Q05 SNRPGP17-201ENST00000603780 214 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
TRAPPC9Q96Q05 AC087588.2-201ENST00000617667 426 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
TRAPPC9Q96Q05 AC090971.5-201ENST00000621102 293 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
TRAPPC9Q96Q05 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
TRAPPC9Q96Q05 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
TRAPPC9Q96Q05 ZNF470-202ENST00000391709 6601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.5-201ENST00000362334 102 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.358-201ENST00000365491 99 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.395-201ENST00000383945 109 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.428-201ENST00000384078 102 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
TRAPPC9Q96Q05 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.557-201ENST00000384680 107 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
TRAPPC9Q96Q05 AC004866.1-201ENST00000411748 78 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
TRAPPC9Q96Q05 SRIP3-201ENST00000413200 219 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
TRAPPC9Q96Q05 AL445305.1-201ENST00000432577 575 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.639-201ENST00000458981 102 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
TRAPPC9Q96Q05 APOA2-205ENST00000468465 421 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
TRAPPC9Q96Q05 LEKR1-205ENST00000477399 621 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
TRAPPC9Q96Q05 ATP5EP1-201ENST00000510257 156 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
TRAPPC9Q96Q05 AC096711.1-201ENST00000510967 347 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
TRAPPC9Q96Q05 VCAN-AS1-202ENST00000513899 453 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
TRAPPC9Q96Q05 RNA5SP490-201ENST00000517141 136 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
TRAPPC9Q96Q05 SNORD116.3-201ENST00000517176 78 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
TRAPPC9Q96Q05 AC144568.1-201ENST00000520139 137 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
TRAPPC9Q96Q05 AC021785.1-201ENST00000520780 453 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
TRAPPC9Q96Q05 AP002770.2-201ENST00000543613 532 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
TRAPPC9Q96Q05 AC233702.2-202ENST00000562547 291 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
TRAPPC9Q96Q05 MIR3126-201ENST00000577443 74 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
TRAPPC9Q96Q05 AC020910.1-201ENST00000599404 413 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
TRAPPC9Q96Q05 AC091925.1-201ENST00000623204 462 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
TRAPPC9Q96Q05 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.252-201ENST00000364556 101 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.314-201ENST00000365114 102 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-281P-201ENST00000384212 103 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
TRAPPC9Q96Q05 MIR27B-201ENST00000385129 97 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
TRAPPC9Q96Q05 SNORA69.1-201ENST00000390904 137 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
TRAPPC9Q96Q05 AC007064.1-201ENST00000412238 351 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
TRAPPC9Q96Q05 EIF1P2-201ENST00000428233 350 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
TRAPPC9Q96Q05 AC096638.1-201ENST00000444678 216 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
TRAPPC9Q96Q05 UBE2V1P7-201ENST00000446395 340 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
TRAPPC9Q96Q05 AC093259.1-201ENST00000509755 300 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-991P-201ENST00000516168 107 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-344P-201ENST00000516635 111 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
TRAPPC9Q96Q05 AC108449.1-202ENST00000517632 478 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
TRAPPC9Q96Q05 AC025871.1-202ENST00000518819 432 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
TRAPPC9Q96Q05 AC026271.5-201ENST00000577873 130 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
TRAPPC9Q96Q05 MIR5695-201ENST00000579717 85 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
TRAPPC9Q96Q05 AC005296.1-201ENST00000616145 209 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
TRAPPC9Q96Q05 AL590808.1-201ENST00000618696 141 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
TRAPPC9Q96Q05 ZEB2_AS1_1.1-201ENST00000621504 128 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
TRAPPC9Q96Q05 CAPS2-203ENST00000393284 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
TRAPPC9Q96Q05 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 147 ms