Protein–RNA interactions for Protein: Q96JJ7

TMX3, Protein disulfide-isomerase TMX3, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMX3Q96JJ7 Y_RNA.439-201ENST00000384119 94 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
TMX3Q96JJ7 Y_RNA.556-201ENST00000384677 113 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
TMX3Q96JJ7 RNU6-713P-201ENST00000384761 107 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
TMX3Q96JJ7 MIR549A-201ENST00000385268 96 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
TMX3Q96JJ7 MIR1289-1-201ENST00000408836 144 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
TMX3Q96JJ7 SNORD12B-201ENST00000410433 91 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
TMX3Q96JJ7 RPL30P4-201ENST00000429309 333 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
TMX3Q96JJ7 AL590422.1-201ENST00000451829 364 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
TMX3Q96JJ7 RNY3P15-201ENST00000516297 97 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
TMX3Q96JJ7 AC026470.2-201ENST00000561492 181 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
TMX3Q96JJ7 Y_RNA.772-201ENST00000606692 102 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
TMX3Q96JJ7 KCNIP4-IT1-201ENST00000627566 9848 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
TMX3Q96JJ7 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
TMX3Q96JJ7 MACC1-202ENST00000400331 9159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
TMX3Q96JJ7 AC108750.1-201ENST00000637986 2706 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.96□□□□□ -1.94
TMX3Q96JJ7 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
TMX3Q96JJ7 Y_RNA.19-201ENST00000362462 99 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
TMX3Q96JJ7 Y_RNA.222-201ENST00000364264 102 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
TMX3Q96JJ7 RNU6-702P-201ENST00000364982 107 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
TMX3Q96JJ7 RNU6-806P-201ENST00000365147 105 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
TMX3Q96JJ7 AL079342.1-201ENST00000401460 267 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
TMX3Q96JJ7 LINC01509-202ENST00000423523 408 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
TMX3Q96JJ7 LINC01399-202ENST00000458450 244 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
TMX3Q96JJ7 SNORA25.14-201ENST00000516481 132 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
TMX3Q96JJ7 AC010620.2-201ENST00000600135 313 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
TMX3Q96JJ7 SNRPGP20-201ENST00000604477 205 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
TMX3Q96JJ7 AL670379.2-201ENST00000604983 252 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
TMX3Q96JJ7 AL137847.3-201ENST00000611521 109 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
TMX3Q96JJ7 AC010999.1-201ENST00000611856 324 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
TMX3Q96JJ7 AL137790.1-201ENST00000634283 177 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
TMX3Q96JJ7 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
TMX3Q96JJ7 ZNF280D-204ENST00000558320 3666 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
TMX3Q96JJ7 CYLC2-201ENST00000374798 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
TMX3Q96JJ7 KIAA1841-211ENST00000612149 4202 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
TMX3Q96JJ7 MRPL42-202ENST00000393128 1983 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
TMX3Q96JJ7 Y_RNA.64-201ENST00000362845 102 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
TMX3Q96JJ7 Y_RNA.105-201ENST00000363182 111 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
TMX3Q96JJ7 RNA5SP456-201ENST00000364002 114 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
TMX3Q96JJ7 MIR29B2-201ENST00000385055 81 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
TMX3Q96JJ7 MIR320B2-201ENST00000408479 138 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
TMX3Q96JJ7 U6atac.2-201ENST00000408644 118 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
TMX3Q96JJ7 RNU6-121P-201ENST00000410525 99 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
TMX3Q96JJ7 AL138962.1-201ENST00000417987 411 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
TMX3Q96JJ7 AC007395.1-201ENST00000451333 677 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
TMX3Q96JJ7 AC073901.1-201ENST00000462471 408 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
TMX3Q96JJ7 AC140059.1-201ENST00000489238 361 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
TMX3Q96JJ7 Y_RNA.668-201ENST00000516233 93 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
TMX3Q96JJ7 SCARNA3-201ENST00000517097 143 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
TMX3Q96JJ7 LINC01533-205ENST00000593056 607 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
TMX3Q96JJ7 AL355376.2-201ENST00000603866 267 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
TMX3Q96JJ7 AC011476.5-201ENST00000615594 130 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
TMX3Q96JJ7 NEBL-202ENST00000377122 9216 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
TMX3Q96JJ7 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
TMX3Q96JJ7 ZBBX-202ENST00000392764 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
TMX3Q96JJ7 WDR3-201ENST00000349139 9974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
TMX3Q96JJ7 MCF2-204ENST00000414978 3813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
TMX3Q96JJ7 ZNF470-202ENST00000391709 6601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
TMX3Q96JJ7 Y_RNA.401-201ENST00000383965 117 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TMX3Q96JJ7 RNU6-926P-201ENST00000384075 107 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TMX3Q96JJ7 RNU6-472P-201ENST00000384299 107 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TMX3Q96JJ7 AC093423.2-201ENST00000429074 437 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
TMX3Q96JJ7 RPL26P26-201ENST00000480251 434 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TMX3Q96JJ7 AC096725.1-201ENST00000514266 313 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TMX3Q96JJ7 Y_RNA.683-201ENST00000516508 93 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TMX3Q96JJ7 AC090124.1-201ENST00000525097 448 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
TMX3Q96JJ7 AC018904.1-201ENST00000560594 542 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
TMX3Q96JJ7 ACTG1P17-203ENST00000561222 537 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
TMX3Q96JJ7 AC023824.2-201ENST00000566185 400 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TMX3Q96JJ7 AC136932.1-201ENST00000574771 208 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TMX3Q96JJ7 AL713866.2-201ENST00000603579 219 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TMX3Q96JJ7 AC005562.2-201ENST00000618264 111 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TMX3Q96JJ7 ZMYM1-201ENST00000359858 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
TMX3Q96JJ7 CYSLTR1-203ENST00000614798 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
TMX3Q96JJ7 TAB3-203ENST00000378930 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
TMX3Q96JJ7 SMARCAD1-206ENST00000509418 2348 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
TMX3Q96JJ7 RPAP3-202ENST00000380650 2149 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
TMX3Q96JJ7 RNU1-62P-201ENST00000362599 164 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TMX3Q96JJ7 SNORD32B-201ENST00000364460 84 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TMX3Q96JJ7 CLDN10-202ENST00000376855 701 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
TMX3Q96JJ7 Y_RNA.396-201ENST00000383949 103 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TMX3Q96JJ7 RNU6-793P-201ENST00000384233 104 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TMX3Q96JJ7 RNU6-505P-201ENST00000384427 107 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TMX3Q96JJ7 MIR128-1-201ENST00000384921 82 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TMX3Q96JJ7 RNU2-52P-201ENST00000410680 190 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TMX3Q96JJ7 AC010095.1-201ENST00000443543 144 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TMX3Q96JJ7 SNORD109B-201ENST00000458961 67 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TMX3Q96JJ7 SNORD109A-201ENST00000459128 67 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TMX3Q96JJ7 AC091179.3-201ENST00000474761 144 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TMX3Q96JJ7 DEFB131C-201ENST00000528817 165 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TMX3Q96JJ7 AP003733.2-201ENST00000529409 171 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TMX3Q96JJ7 MIR4300-201ENST00000581016 96 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TMX3Q96JJ7 AP005062.1-201ENST00000581502 607 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
TMX3Q96JJ7 AC105245.1-201ENST00000581934 244 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TMX3Q96JJ7 MIR3199-1-201ENST00000582434 88 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TMX3Q96JJ7 AC023490.1-201ENST00000614584 375 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
TMX3Q96JJ7 TCL6_2.1-201ENST00000615162 119 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TMX3Q96JJ7 AC011718.1-201ENST00000622906 375 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
TMX3Q96JJ7 HMHB1-202ENST00000638299 126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
TMX3Q96JJ7 RGS18-201ENST00000367460 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
TMX3Q96JJ7 MTND5P35-201ENST00000557537 1720 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.3 ms