Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTR2

NLRC3, NLR family CARD domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 1,065 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRC3Q7RTR2 ATP5EP1-201ENST00000510257 156 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
NLRC3Q7RTR2 RNA5SP164-201ENST00000516533 110 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
NLRC3Q7RTR2 AC022784.2-201ENST00000521298 328 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
NLRC3Q7RTR2 CYCSP30-201ENST00000546447 172 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
NLRC3Q7RTR2 SNHG14-219ENST00000553134 470 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
NLRC3Q7RTR2 AC090877.1-201ENST00000561418 344 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
NLRC3Q7RTR2 MIR3144-201ENST00000579460 79 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
NLRC3Q7RTR2 AC091167.4-201ENST00000605079 184 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
NLRC3Q7RTR2 RNU2-4P-201ENST00000606190 192 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
NLRC3Q7RTR2 AC025754.2-201ENST00000606491 432 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
NLRC3Q7RTR2 U2.15-201ENST00000611544 191 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
NLRC3Q7RTR2 U2.16-201ENST00000613119 191 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
NLRC3Q7RTR2 U2.12-201ENST00000613778 191 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
NLRC3Q7RTR2 U2.9-201ENST00000615427 191 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
NLRC3Q7RTR2 U2.11-201ENST00000616345 191 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
NLRC3Q7RTR2 U2.2-201ENST00000616535 191 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
NLRC3Q7RTR2 U2.3-201ENST00000617785 191 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
NLRC3Q7RTR2 U2.19-201ENST00000618602 191 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
NLRC3Q7RTR2 RNU2-1-201ENST00000618664 191 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
NLRC3Q7RTR2 U2.6-201ENST00000619225 191 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
NLRC3Q7RTR2 U2.5-201ENST00000619465 191 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
NLRC3Q7RTR2 U2.10-201ENST00000620268 191 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
NLRC3Q7RTR2 AC104971.4-201ENST00000622763 249 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
NLRC3Q7RTR2 NRDE2-210ENST00000628832 132 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
NLRC3Q7RTR2 SEMG2-201ENST00000372769 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
NLRC3Q7RTR2 SUGT1-201ENST00000310528 14131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
NLRC3Q7RTR2 AC134026.1-201ENST00000623249 2239 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NLRC3Q7RTR2 DPP10-205ENST00000410059 6278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
NLRC3Q7RTR2 HELZ-201ENST00000358691 13810 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
NLRC3Q7RTR2 MACF1-201ENST00000289893 19141 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
NLRC3Q7RTR2 FAM35CP-201ENST00000554755 2470 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NLRC3Q7RTR2 STAU2-201ENST00000355780 4061 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
NLRC3Q7RTR2 RNU1-35P-201ENST00000362782 153 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NLRC3Q7RTR2 RNU6-899P-201ENST00000363947 107 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NLRC3Q7RTR2 RNU6-283P-201ENST00000364788 107 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NLRC3Q7RTR2 Y_RNA.293-201ENST00000364908 93 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NLRC3Q7RTR2 SNORD31B-201ENST00000364977 69 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NLRC3Q7RTR2 Y_RNA.310-201ENST00000365063 113 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NLRC3Q7RTR2 RNU6-394P-201ENST00000410735 107 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NLRC3Q7RTR2 AL583835.2-201ENST00000435483 500 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
NLRC3Q7RTR2 RPS20P10-201ENST00000451209 253 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NLRC3Q7RTR2 SRI-210ENST00000490437 570 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
NLRC3Q7RTR2 AC026402.1-201ENST00000513642 170 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NLRC3Q7RTR2 RNU4ATAC17P-201ENST00000517272 120 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NLRC3Q7RTR2 MIR3910-1-201ENST00000580936 111 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NLRC3Q7RTR2 AC069294.1-201ENST00000608397 350 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NLRC3Q7RTR2 snoZ196.1-201ENST00000625269 89 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NLRC3Q7RTR2 MIR7153-201ENST00000637758 57 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NLRC3Q7RTR2 AL160287.1-202ENST00000638113 454 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
NLRC3Q7RTR2 LPP-220ENST00000617246 18220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
NLRC3Q7RTR2 PRKG2-206ENST00000545647 3852 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
NLRC3Q7RTR2 PIK3C2G-203ENST00000535651 2497 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
NLRC3Q7RTR2 TAX1BP1-213ENST00000543117 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
NLRC3Q7RTR2 GLCE-202ENST00000559420 4840 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
NLRC3Q7RTR2 AC058791.1-201ENST00000608412 3198 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NLRC3Q7RTR2 AL157777.2-201ENST00000258070 137 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NLRC3Q7RTR2 Y_RNA.121-201ENST00000363309 113 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NLRC3Q7RTR2 RNA5SP399-201ENST00000364003 117 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NLRC3Q7RTR2 RNY1P5-201ENST00000383890 115 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NLRC3Q7RTR2 Y_RNA.441-201ENST00000384123 112 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NLRC3Q7RTR2 SNORD14D-201ENST00000384390 87 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NLRC3Q7RTR2 SNORA48.5-201ENST00000391143 135 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NLRC3Q7RTR2 RPS29P7-201ENST00000439662 171 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NLRC3Q7RTR2 RN7SKP209-201ENST00000516888 304 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NLRC3Q7RTR2 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
NLRC3Q7RTR2 MIR5685-201ENST00000579080 79 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NLRC3Q7RTR2 AC108706.1-201ENST00000611053 297 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NLRC3Q7RTR2 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
NLRC3Q7RTR2 AC084757.4-201ENST00000616350 526 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NLRC3Q7RTR2 CT45A5-202ENST00000617203 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
NLRC3Q7RTR2 AC034229.5-201ENST00000624258 185 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NLRC3Q7RTR2 AC110597.3-202ENST00000583493 3289 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
NLRC3Q7RTR2 SLC25A46-204ENST00000504098 2345 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
NLRC3Q7RTR2 ERMN-205ENST00000410096 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
NLRC3Q7RTR2 SNORD114-7-201ENST00000362520 77 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
NLRC3Q7RTR2 Y_RNA.182-201ENST00000363880 111 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
NLRC3Q7RTR2 SNORA68.1-201ENST00000364537 132 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
NLRC3Q7RTR2 C6orf10-201ENST00000375007 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
NLRC3Q7RTR2 RNU6-975P-201ENST00000384296 105 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
NLRC3Q7RTR2 SNORA19-201ENST00000384737 128 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
NLRC3Q7RTR2 MIR554-201ENST00000384874 96 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
NLRC3Q7RTR2 MIR873-201ENST00000401120 77 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
NLRC3Q7RTR2 AL355497.1-201ENST00000406262 551 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
NLRC3Q7RTR2 RN7SKP202-201ENST00000410439 330 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
NLRC3Q7RTR2 RNU6-1135P-201ENST00000411083 103 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
NLRC3Q7RTR2 MAGEA8-AS1-201ENST00000427671 476 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
NLRC3Q7RTR2 AC090617.2-201ENST00000433167 404 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
NLRC3Q7RTR2 AC090515.1-201ENST00000465295 476 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
NLRC3Q7RTR2 RAC1P2-201ENST00000511164 579 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
NLRC3Q7RTR2 RNU7-200P-201ENST00000516105 62 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
NLRC3Q7RTR2 MTND5P41-201ENST00000517498 206 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
NLRC3Q7RTR2 AC012435.2-201ENST00000562869 361 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
NLRC3Q7RTR2 AC106785.1-201ENST00000565935 262 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
NLRC3Q7RTR2 AP005271.1-201ENST00000582470 412 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
NLRC3Q7RTR2 AL354798.1-201ENST00000622505 329 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
NLRC3Q7RTR2 TTN-204ENST00000360870 18218 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
NLRC3Q7RTR2 CEP85L-202ENST00000368488 7118 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
NLRC3Q7RTR2 NEB-204ENST00000409198 20637 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
NLRC3Q7RTR2 FAM126A-204ENST00000432176 13177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
NLRC3Q7RTR2 Y_RNA.124-201ENST00000363339 93 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
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