Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

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Length 797 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 AC116562.3-201ENST00000506136 177 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
IMPG1Q17R60 AC068587.5-201ENST00000528506 175 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
IMPG1Q17R60 AC016256.1-201ENST00000547971 354 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
IMPG1Q17R60 AC025030.2-201ENST00000552558 567 ntTSL 2 BASIC0.3□□□□□ -2.36
IMPG1Q17R60 AC022217.4-201ENST00000604389 163 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
IMPG1Q17R60 AC097065.2-201ENST00000608159 533 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
IMPG1Q17R60 AC243829.6-201ENST00000612652 106 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
IMPG1Q17R60 MIR6734-201ENST00000621166 68 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
IMPG1Q17R60 RNU6-1000P-201ENST00000391066 106 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
IMPG1Q17R60 MRPL42P3-201ENST00000401492 326 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
IMPG1Q17R60 CPEB3_ribozyme.1-201ENST00000408115 78 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
IMPG1Q17R60 LINC02263-203ENST00000426240 515 ntTSL 5 BASIC0.29□□□□□ -2.36
IMPG1Q17R60 LINC00844-201ENST00000432535 477 ntTSL 2 BASIC0.29□□□□□ -2.36
IMPG1Q17R60 AC002350.1-201ENST00000490759 375 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
IMPG1Q17R60 AC091874.1-201ENST00000511402 339 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
IMPG1Q17R60 SNORA70.12-201ENST00000516084 153 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
IMPG1Q17R60 RNU6-496P-201ENST00000516145 99 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
IMPG1Q17R60 RNA5SP220-201ENST00000516298 104 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
IMPG1Q17R60 Y_RNA.676-201ENST00000516393 96 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
IMPG1Q17R60 RNA5SP134-201ENST00000516492 96 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
IMPG1Q17R60 AC026470.2-201ENST00000561492 181 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
IMPG1Q17R60 AC007347.1-201ENST00000563879 281 ntTSL 3 BASIC0.29□□□□□ -2.36
IMPG1Q17R60 PWRN1-205ENST00000565295 465 ntTSL 3 BASIC0.29□□□□□ -2.36
IMPG1Q17R60 MIR4778-201ENST00000577635 80 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
IMPG1Q17R60 MIR5006-201ENST00000583027 110 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
IMPG1Q17R60 RNU4-48P-201ENST00000365559 182 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
IMPG1Q17R60 RNU6-163P-201ENST00000384396 106 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
IMPG1Q17R60 SNORA75.2-201ENST00000391138 150 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
IMPG1Q17R60 SNORA75.3-201ENST00000391231 150 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
IMPG1Q17R60 AL117339.3-201ENST00000418733 162 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
IMPG1Q17R60 MTND1P20-201ENST00000430341 950 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
IMPG1Q17R60 PPEF1-AS1-201ENST00000430641 430 ntTSL 5 BASIC0.28□□□□□ -2.36
IMPG1Q17R60 Z68323.1-201ENST00000450365 519 ntTSL 3 BASIC0.28□□□□□ -2.36
IMPG1Q17R60 U7.7-201ENST00000459276 60 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
IMPG1Q17R60 AC022493.2-201ENST00000506122 481 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
IMPG1Q17R60 AC027335.1-201ENST00000515377 543 ntTSL 4 BASIC0.28□□□□□ -2.36
IMPG1Q17R60 RNU6-1178P-201ENST00000516674 107 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
IMPG1Q17R60 DEFB131C-201ENST00000528817 165 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
IMPG1Q17R60 AC090510.1-201ENST00000567456 425 ntTSL 3 BASIC0.28□□□□□ -2.36
IMPG1Q17R60 AP001836.1-201ENST00000604675 523 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
IMPG1Q17R60 AC068787.1-201ENST00000623908 691 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
IMPG1Q17R60 U6.114-201ENST00000636407 96 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
IMPG1Q17R60 Y_RNA.22-201ENST00000362492 102 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
IMPG1Q17R60 RNU5E-10P-201ENST00000363506 118 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
IMPG1Q17R60 LINC01674-201ENST00000427446 504 ntTSL 3 BASIC0.27□□□□□ -2.37
IMPG1Q17R60 AC133865.1-201ENST00000438619 339 ntTSL 3 BASIC0.27□□□□□ -2.37
IMPG1Q17R60 LINC01323-201ENST00000486767 576 ntTSL 3 BASIC0.27□□□□□ -2.37
IMPG1Q17R60 AC025465.4-201ENST00000513422 638 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
IMPG1Q17R60 LRRC34P2-201ENST00000514850 553 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
IMPG1Q17R60 APELA-204ENST00000515275 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC0.27□□□□□ -2.37
IMPG1Q17R60 MIR4711-201ENST00000578274 70 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
IMPG1Q17R60 TCL6_2.1-201ENST00000615162 119 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
IMPG1Q17R60 AC138649.3-201ENST00000622154 254 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
IMPG1Q17R60 MTND4P5-201ENST00000435821 1374 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
IMPG1Q17R60 MT-CO2-201ENST00000361739 684 ntAPPRIS P1 BASIC0.26□□□□□ -2.37
IMPG1Q17R60 RNU6-715P-201ENST00000365204 103 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
IMPG1Q17R60 SNORD115-7-201ENST00000365306 82 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
IMPG1Q17R60 SNORA2.2-201ENST00000365473 135 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
IMPG1Q17R60 RNU6-57P-201ENST00000411348 103 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
IMPG1Q17R60 CDK8P2-201ENST00000415020 547 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
IMPG1Q17R60 MTCO2P21-201ENST00000419780 677 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
IMPG1Q17R60 NDUFA5P4-201ENST00000436704 385 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
IMPG1Q17R60 AC004386.2-201ENST00000441858 148 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
IMPG1Q17R60 AC124854.1-202ENST00000513779 339 ntTSL 3 BASIC0.26□□□□□ -2.37
IMPG1Q17R60 RN7SKP12-201ENST00000516275 143 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
IMPG1Q17R60 RNU6-405P-201ENST00000516637 110 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
IMPG1Q17R60 RNU6-467P-201ENST00000517027 110 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
IMPG1Q17R60 AP003181.2-201ENST00000528941 181 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
IMPG1Q17R60 AC103996.1-201ENST00000555468 102 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
IMPG1Q17R60 PRELID3BP2-201ENST00000605362 201 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
IMPG1Q17R60 AC027514.1-201ENST00000588561 1603 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
IMPG1Q17R60 RNU6-1287P-201ENST00000362914 107 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
IMPG1Q17R60 RNU6-1303P-201ENST00000364841 107 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
IMPG1Q17R60 VTRNA1-3-201ENST00000365645 89 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
IMPG1Q17R60 RNU6-1060P-201ENST00000384664 107 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
IMPG1Q17R60 AC008134.1-201ENST00000420943 193 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
IMPG1Q17R60 MTCO2P12-201ENST00000427426 682 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
IMPG1Q17R60 AC106053.1-201ENST00000431697 368 ntTSL 3 BASIC0.25□□□□□ -2.37
IMPG1Q17R60 AL031313.1-201ENST00000448435 256 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
IMPG1Q17R60 AC245047.8-201ENST00000456455 284 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
IMPG1Q17R60 AC079140.5-201ENST00000507882 310 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
IMPG1Q17R60 SNHG6-202ENST00000520619 479 ntTSL 3 BASIC0.25□□□□□ -2.37
IMPG1Q17R60 AC004584.2-201ENST00000570407 410 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
IMPG1Q17R60 MTND1P15-201ENST00000579262 949 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
IMPG1Q17R60 AC090371.2-202ENST00000582239 644 ntTSL 5 BASIC0.25□□□□□ -2.37
IMPG1Q17R60 AC068792.1-201ENST00000621354 417 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
IMPG1Q17R60 7SK.10-201ENST00000621414 298 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
IMPG1Q17R60 MPP6-209ENST00000625307 126 ntTSL 5 BASIC0.25□□□□□ -2.37
IMPG1Q17R60 SNORA43.4-201ENST00000629559 138 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
IMPG1Q17R60 RNU6-1305P-201ENST00000364353 104 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
IMPG1Q17R60 RNU6-827P-201ENST00000365553 106 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
IMPG1Q17R60 C20orf187-201ENST00000378252 446 ntTSL 2 BASIC0.24□□□□□ -2.37
IMPG1Q17R60 RNU6-42P-201ENST00000384165 107 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
IMPG1Q17R60 Y_RNA.480-201ENST00000384364 102 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
IMPG1Q17R60 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
IMPG1Q17R60 SNAP23-203ENST00000397138 477 ntTSL 1 (best) BASIC0.24□□□□□ -2.37
IMPG1Q17R60 MIR936-201ENST00000401264 98 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
IMPG1Q17R60 RNA5SP193-201ENST00000410353 107 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
IMPG1Q17R60 AC105271.1-202ENST00000411417 445 ntTSL 3 BASIC0.24□□□□□ -2.37
IMPG1Q17R60 MTCO2P23-201ENST00000425216 680 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
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