Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Length 200 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 FO393415.2-201ENST00000480085 343 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CDO1Q16878 MRPS17P9-201ENST00000511924 393 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CDO1Q16878 RNVU1-2-201ENST00000516326 135 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CDO1Q16878 RNU6-566P-201ENST00000516790 107 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CDO1Q16878 RNA5SP454-201ENST00000517231 127 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CDO1Q16878 ACTG1P17-203ENST00000561222 537 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
CDO1Q16878 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CDO1Q16878 AC018638.8-201ENST00000588755 281 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CDO1Q16878 7SK.7-201ENST00000603504 247 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CDO1Q16878 BNIP3P10-201ENST00000605360 577 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CDO1Q16878 MIR6845-201ENST00000613182 61 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CDO1Q16878 MIR6128-201ENST00000615528 109 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CDO1Q16878 AC009248.2-201ENST00000619826 254 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CDO1Q16878 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CDO1Q16878 SCARNA4-201ENST00000629045 128 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CDO1Q16878 GS1-279B7.1-204ENST00000641809 378 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CDO1Q16878 VPS13A-206ENST00000376646 2262 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
CDO1Q16878 AL159152.1-201ENST00000635019 2587 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CDO1Q16878 RNU6-418P-201ENST00000384035 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CDO1Q16878 MIR1283-1-201ENST00000408494 87 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CDO1Q16878 MS4A4E-203ENST00000425663 350 ntTSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
CDO1Q16878 Z82188.1-201ENST00000436709 154 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CDO1Q16878 HMGB1P18-201ENST00000438801 619 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CDO1Q16878 snoU13.15-201ENST00000459407 104 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CDO1Q16878 AC010531.2-201ENST00000465012 153 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CDO1Q16878 AC097473.1-201ENST00000508142 408 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CDO1Q16878 AC008852.1-201ENST00000510198 451 ntTSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.11
CDO1Q16878 AC107393.1-201ENST00000512403 346 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CDO1Q16878 AC126768.3-201ENST00000514519 560 ntTSL 4 BASIC1.84□□□□□ -2.11
CDO1Q16878 LINC02055-204ENST00000521034 432 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
CDO1Q16878 AC080078.2-201ENST00000603766 501 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CDO1Q16878 DLEU2_5.1-201ENST00000615567 84 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CDO1Q16878 AC091932.3-201ENST00000624223 323 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CDO1Q16878 AL359697.1-201ENST00000624879 587 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CDO1Q16878 MTND4P5-201ENST00000435821 1374 ntBASIC1.84□□□□□ -2.12
CDO1Q16878 ASPM-202ENST00000367408 3747 ntTSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
CDO1Q16878 RNU6-541P-201ENST00000384709 110 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CDO1Q16878 SNORA48.1-201ENST00000390879 135 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CDO1Q16878 RNU6ATAC25P-201ENST00000408798 117 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CDO1Q16878 EIF4EP2-201ENST00000422816 654 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CDO1Q16878 AC010095.1-201ENST00000443543 144 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CDO1Q16878 AC009237.7-201ENST00000447357 229 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CDO1Q16878 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
CDO1Q16878 snoU13.26-201ENST00000459452 105 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CDO1Q16878 AL627309.4-201ENST00000496488 457 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
CDO1Q16878 AC091976.1-202ENST00000509211 630 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
CDO1Q16878 LINC02061-201ENST00000514225 335 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
CDO1Q16878 Y_RNA.682-201ENST00000516457 100 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CDO1Q16878 AF235103.2-201ENST00000525753 346 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CDO1Q16878 SNORA59B-202ENST00000578183 701 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CDO1Q16878 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CDO1Q16878 AL109918.3-201ENST00000603072 338 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CDO1Q16878 AC104819.3-201ENST00000603264 540 ntTSL 4 BASIC1.83□□□□□ -2.12
CDO1Q16878 MIR8081-201ENST00000611533 95 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CDO1Q16878 AC084782.3-201ENST00000612282 578 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CDO1Q16878 U6atac.1-201ENST00000616025 117 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CDO1Q16878 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
CDO1Q16878 TFEC-204ENST00000457268 6309 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
CDO1Q16878 MIR340-201ENST00000362125 95 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CDO1Q16878 RNU6-510P-201ENST00000391239 108 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CDO1Q16878 SNORA11.2-201ENST00000408318 127 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CDO1Q16878 Y_RNA.619-201ENST00000410951 90 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CDO1Q16878 NCOR1P3-201ENST00000420479 303 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CDO1Q16878 AL359081.1-201ENST00000432083 615 ntTSL 2 BASIC1.82□□□□□ -2.12
CDO1Q16878 PLCB1-IT1-201ENST00000441231 373 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
CDO1Q16878 AC069439.1-201ENST00000494739 167 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CDO1Q16878 AC116337.1-201ENST00000509680 687 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CDO1Q16878 RNU6-295P-201ENST00000516901 104 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CDO1Q16878 RNU1-117P-201ENST00000517041 158 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CDO1Q16878 RRN3P3-201ENST00000549207 578 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CDO1Q16878 AL157911.1-202ENST00000554123 502 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
CDO1Q16878 AL049869.2-201ENST00000556634 365 ntTSL 2 BASIC1.82□□□□□ -2.12
CDO1Q16878 AL121821.1-201ENST00000557067 530 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
CDO1Q16878 MIR3618-201ENST00000580330 88 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CDO1Q16878 MIR4448-201ENST00000584360 86 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CDO1Q16878 AC010928.2-201ENST00000588017 287 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CDO1Q16878 AC011494.1-201ENST00000596454 237 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CDO1Q16878 AGR3-201ENST00000310398 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
CDO1Q16878 RNU6-1305P-201ENST00000364353 104 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CDO1Q16878 AL445305.1-201ENST00000432577 575 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CDO1Q16878 MTCO1P44-201ENST00000441935 243 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CDO1Q16878 AC074290.1-201ENST00000448883 135 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CDO1Q16878 ATP5J2P3-201ENST00000451550 258 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CDO1Q16878 AC007215.1-201ENST00000464893 276 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CDO1Q16878 AC114982.1-201ENST00000469402 321 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CDO1Q16878 CPHL1P-203ENST00000471823 523 ntTSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
CDO1Q16878 AC145146.2-202ENST00000508118 326 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
CDO1Q16878 LINC02233-201ENST00000513718 358 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
CDO1Q16878 AC023200.1-201ENST00000519660 651 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
CDO1Q16878 AC107886.1-201ENST00000526935 516 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
CDO1Q16878 AP001001.1-201ENST00000532422 826 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
CDO1Q16878 AC084816.1-207ENST00000538317 584 ntTSL 4 BASIC1.81□□□□□ -2.12
CDO1Q16878 AC026765.1-201ENST00000547876 435 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
CDO1Q16878 LINC01919-202ENST00000579506 384 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
CDO1Q16878 AL096840.1-201ENST00000603287 93 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CDO1Q16878 uc_338.20-201ENST00000621563 178 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CDO1Q16878 ZRANB2-AS2-222ENST00000625045 1014 ntTSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
CDO1Q16878 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
CDO1Q16878 MUC15-203ENST00000455601 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.8□□□□□ -2.12
CDO1Q16878 FSD1L-201ENST00000374707 7062 ntTSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
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