| UPP1 | Q16831 | AC242426.3-202 | ENST00000607149 | 2397 nt | TSL 5 BASIC | 1.93 | □□□□□ -2.1 | | |
| UPP1 | Q16831 | ZNF451-208 | ENST00000491832 | 3632 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 1.92 | □□□□□ -2.1 | | |
| UPP1 | Q16831 | Y_RNA.263-201 | ENST00000364659 | 114 nt | BASIC | 1.92 | □□□□□ -2.1 | | |
| UPP1 | Q16831 | SNORA6-201 | ENST00000384033 | 151 nt | BASIC | 1.92 | □□□□□ -2.1 | | |
| UPP1 | Q16831 | MIR487A-201 | ENST00000385009 | 80 nt | BASIC | 1.92 | □□□□□ -2.1 | | |
| UPP1 | Q16831 | SNORA75.4-201 | ENST00000391278 | 119 nt | BASIC | 1.92 | □□□□□ -2.1 | | |
| UPP1 | Q16831 | AL355497.1-201 | ENST00000406262 | 551 nt | BASIC | 1.92 | □□□□□ -2.1 | | |
| UPP1 | Q16831 | MTCYBP2-201 | ENST00000407745 | 171 nt | BASIC | 1.92 | □□□□□ -2.1 | | |
| UPP1 | Q16831 | RNU2-32P-201 | ENST00000411193 | 191 nt | BASIC | 1.92 | □□□□□ -2.1 | | |
| UPP1 | Q16831 | AL357873.1-201 | ENST00000449215 | 282 nt | TSL 3 BASIC | 1.92 | □□□□□ -2.1 | | |
| UPP1 | Q16831 | LINC01755-201 | ENST00000455010 | 453 nt | TSL 2 BASIC | 1.92 | □□□□□ -2.1 | | |
| UPP1 | Q16831 | RPL23AP75-201 | ENST00000491601 | 451 nt | BASIC | 1.92 | □□□□□ -2.1 | | |
| UPP1 | Q16831 | LINC02064-201 | ENST00000506492 | 470 nt | TSL 5 BASIC | 1.92 | □□□□□ -2.1 | | |
| UPP1 | Q16831 | RNA5SP384-201 | ENST00000516615 | 116 nt | BASIC | 1.92 | □□□□□ -2.1 | | |
| UPP1 | Q16831 | AC093027.1-201 | ENST00000546698 | 429 nt | BASIC | 1.92 | □□□□□ -2.1 | | |
| UPP1 | Q16831 | AC016256.1-201 | ENST00000547971 | 354 nt | BASIC | 1.92 | □□□□□ -2.1 | | |
| UPP1 | Q16831 | AC009754.1-201 | ENST00000566282 | 540 nt | TSL 4 BASIC | 1.92 | □□□□□ -2.1 | | |
| UPP1 | Q16831 | AL355375.2-201 | ENST00000574825 | 175 nt | BASIC | 1.92 | □□□□□ -2.1 | | |
| UPP1 | Q16831 | AC036222.2-201 | ENST00000579033 | 333 nt | TSL 3 BASIC | 1.92 | □□□□□ -2.1 | | |
| UPP1 | Q16831 | PCGEM1.1-201 | ENST00000613431 | 131 nt | BASIC | 1.92 | □□□□□ -2.1 | | |
| UPP1 | Q16831 | AC025253.1-201 | ENST00000613623 | 543 nt | BASIC | 1.92 | □□□□□ -2.1 | | |
| UPP1 | Q16831 | ST7-OT4_1.1-201 | ENST00000615322 | 200 nt | BASIC | 1.92 | □□□□□ -2.1 | | |
| UPP1 | Q16831 | PISRT1.1-201 | ENST00000616930 | 107 nt | BASIC | 1.92 | □□□□□ -2.1 | | |
| UPP1 | Q16831 | AP000553.5-201 | ENST00000641933 | 54 nt | BASIC | 1.92 | □□□□□ -2.1 | | |
| UPP1 | Q16831 | CCDC30-201 | ENST00000340612 | 2664 nt | APPRIS P2 TSL 5 BASIC | 1.92 | □□□□□ -2.1 | | |
| UPP1 | Q16831 | SLC9C2-201 | ENST00000367714 | 4428 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 1.91 | □□□□□ -2.1 | | |
| UPP1 | Q16831 | RNU6-743P-201 | ENST00000364151 | 106 nt | BASIC | 1.91 | □□□□□ -2.1 | | |
| UPP1 | Q16831 | SNORA16.1-201 | ENST00000364597 | 132 nt | BASIC | 1.91 | □□□□□ -2.1 | | |
| UPP1 | Q16831 | SNORA16B-201 | ENST00000364674 | 135 nt | BASIC | 1.91 | □□□□□ -2.1 | | |
| UPP1 | Q16831 | RNU5E-4P-201 | ENST00000364931 | 120 nt | BASIC | 1.91 | □□□□□ -2.1 | | |
| UPP1 | Q16831 | RNU6-867P-201 | ENST00000364956 | 107 nt | BASIC | 1.91 | □□□□□ -2.1 | | |
| UPP1 | Q16831 | RNA5SP138-201 | ENST00000365098 | 114 nt | BASIC | 1.91 | □□□□□ -2.1 | | |
| UPP1 | Q16831 | RNU6-596P-201 | ENST00000365395 | 98 nt | BASIC | 1.91 | □□□□□ -2.1 | | |
| UPP1 | Q16831 | RNU4-52P-201 | ENST00000384209 | 138 nt | BASIC | 1.91 | □□□□□ -2.1 | | |
| UPP1 | Q16831 | RNU6-331P-201 | ENST00000384724 | 107 nt | BASIC | 1.91 | □□□□□ -2.1 | | |
| UPP1 | Q16831 | MIR549A-201 | ENST00000385268 | 96 nt | BASIC | 1.91 | □□□□□ -2.1 | | |
| UPP1 | Q16831 | AL627390.1-201 | ENST00000396055 | 340 nt | BASIC | 1.91 | □□□□□ -2.1 | | |
| UPP1 | Q16831 | AC243428.1-201 | ENST00000421099 | 264 nt | BASIC | 1.91 | □□□□□ -2.1 | | |
| UPP1 | Q16831 | NCOA7-AS1-201 | ENST00000429007 | 501 nt | TSL 3 BASIC | 1.91 | □□□□□ -2.1 | | |
| UPP1 | Q16831 | AL353997.1-201 | ENST00000432936 | 108 nt | BASIC | 1.91 | □□□□□ -2.1 | | |
| UPP1 | Q16831 | IPO7P1-201 | ENST00000442031 | 636 nt | BASIC | 1.91 | □□□□□ -2.1 | | |
| UPP1 | Q16831 | AC009238.1-201 | ENST00000442165 | 424 nt | BASIC | 1.91 | □□□□□ -2.1 | | |
| UPP1 | Q16831 | SNRPEP8-201 | ENST00000442866 | 260 nt | BASIC | 1.91 | □□□□□ -2.1 | | |
| UPP1 | Q16831 | AC009237.6-201 | ENST00000446969 | 424 nt | BASIC | 1.91 | □□□□□ -2.1 | | |
| UPP1 | Q16831 | AC018868.1-201 | ENST00000491307 | 315 nt | BASIC | 1.91 | □□□□□ -2.1 | | |
| UPP1 | Q16831 | AC097467.1-201 | ENST00000513660 | 370 nt | TSL 5 BASIC | 1.91 | □□□□□ -2.1 | | |
| UPP1 | Q16831 | SNORA4.4-201 | ENST00000515921 | 135 nt | BASIC | 1.91 | □□□□□ -2.1 | | |
| UPP1 | Q16831 | APOOP3-201 | ENST00000536787 | 586 nt | BASIC | 1.91 | □□□□□ -2.1 | | |
| UPP1 | Q16831 | AL157688.1-201 | ENST00000555990 | 369 nt | TSL 3 BASIC | 1.91 | □□□□□ -2.1 | | |
| UPP1 | Q16831 | PWRN1-203 | ENST00000564898 | 389 nt | TSL 5 BASIC | 1.91 | □□□□□ -2.1 | | |
| UPP1 | Q16831 | FRG2DP-202 | ENST00000566967 | 323 nt | BASIC | 1.91 | □□□□□ -2.1 | | |
| UPP1 | Q16831 | MIR8081-201 | ENST00000611533 | 95 nt | BASIC | 1.91 | □□□□□ -2.1 | | |
| UPP1 | Q16831 | U4atac.1-201 | ENST00000618345 | 95 nt | BASIC | 1.91 | □□□□□ -2.1 | | |
| UPP1 | Q16831 | AL008636.1-201 | ENST00000625038 | 1018 nt | BASIC | 1.91 | □□□□□ -2.1 | | |
| UPP1 | Q16831 | SCARNA4-201 | ENST00000629045 | 128 nt | BASIC | 1.91 | □□□□□ -2.1 | | |
| UPP1 | Q16831 | FSIP2-202 | ENST00000424728 | 20788 nt | APPRIS P2 TSL 5 BASIC | 1.91 | □□□□□ -2.1 | | |
| UPP1 | Q16831 | CYLC1-201 | ENST00000329312 | 2106 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 1.91 | □□□□□ -2.1 | | |
| UPP1 | Q16831 | CALCRL-201 | ENST00000392370 | 5155 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 1.9 | □□□□□ -2.1 | | |
| UPP1 | Q16831 | RMDN2-203 | ENST00000402091 | 1973 nt | TSL 2 BASIC | 1.9 | □□□□□ -2.1 | | |
| UPP1 | Q16831 | CCDC148-202 | ENST00000409187 | 2523 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 1.9 | □□□□□ -2.1 | | |
| UPP1 | Q16831 | MTND4P1-201 | ENST00000457501 | 1466 nt | BASIC | 1.9 | □□□□□ -2.11 | | |
| UPP1 | Q16831 | ZNF299P-201 | ENST00000406845 | 1804 nt | BASIC | 1.9 | □□□□□ -2.11 | | |
| UPP1 | Q16831 | RNU6-1188P-201 | ENST00000363795 | 107 nt | BASIC | 1.9 | □□□□□ -2.11 | | |
| UPP1 | Q16831 | SNORD32B-201 | ENST00000364460 | 84 nt | BASIC | 1.9 | □□□□□ -2.11 | | |
| UPP1 | Q16831 | RNA5SP190-201 | ENST00000365222 | 118 nt | BASIC | 1.9 | □□□□□ -2.11 | | |
| UPP1 | Q16831 | RNU6-546P-201 | ENST00000383991 | 107 nt | BASIC | 1.9 | □□□□□ -2.11 | | |
| UPP1 | Q16831 | SNORA51.11-201 | ENST00000384442 | 131 nt | BASIC | 1.9 | □□□□□ -2.11 | | |
| UPP1 | Q16831 | MIR561-201 | ENST00000385216 | 97 nt | BASIC | 1.9 | □□□□□ -2.11 | | |
| UPP1 | Q16831 | RNU6-1093P-201 | ENST00000391194 | 107 nt | BASIC | 1.9 | □□□□□ -2.11 | | |
| UPP1 | Q16831 | MTCO3P29-201 | ENST00000432119 | 779 nt | BASIC | 1.9 | □□□□□ -2.11 | | |
| UPP1 | Q16831 | AC055764.1-201 | ENST00000454526 | 473 nt | TSL 3 BASIC | 1.9 | □□□□□ -2.11 | | |
| UPP1 | Q16831 | SNORA25.15-201 | ENST00000516487 | 89 nt | BASIC | 1.9 | □□□□□ -2.11 | | |
| UPP1 | Q16831 | SCARNA16.2-201 | ENST00000516520 | 172 nt | BASIC | 1.9 | □□□□□ -2.11 | | |
| UPP1 | Q16831 | MIR5696-201 | ENST00000578474 | 85 nt | BASIC | 1.9 | □□□□□ -2.11 | | |
| UPP1 | Q16831 | MIR4255-201 | ENST00000579351 | 72 nt | BASIC | 1.9 | □□□□□ -2.11 | | |
| UPP1 | Q16831 | AP006219.1-201 | ENST00000580258 | 472 nt | TSL 3 BASIC | 1.9 | □□□□□ -2.11 | | |
| UPP1 | Q16831 | AC010928.2-201 | ENST00000588017 | 287 nt | BASIC | 1.9 | □□□□□ -2.11 | | |
| UPP1 | Q16831 | RNU6ATAC35P-201 | ENST00000609276 | 444 nt | BASIC | 1.9 | □□□□□ -2.11 | | |
| UPP1 | Q16831 | MIR6840-201 | ENST00000611937 | 71 nt | BASIC | 1.9 | □□□□□ -2.11 | | |
| UPP1 | Q16831 | AL589935.1-202 | ENST00000612512 | 393 nt | TSL 5 BASIC | 1.9 | □□□□□ -2.11 | | |
| UPP1 | Q16831 | AC138058.1-201 | ENST00000620572 | 449 nt | TSL 3 BASIC | 1.9 | □□□□□ -2.11 | | |
| UPP1 | Q16831 | MTND4LP32-201 | ENST00000636111 | 270 nt | BASIC | 1.9 | □□□□□ -2.11 | | |
| UPP1 | Q16831 | THOC2-216 | ENST00000491737 | 4452 nt | TSL 5 BASIC | 1.89 | □□□□□ -2.11 | | |
| UPP1 | Q16831 | ST7-AS2-206 | ENST00000456577 | 1351 nt | TSL 1 (best) BASIC | 1.89 | □□□□□ -2.11 | | |
| UPP1 | Q16831 | TBC1D31-206 | ENST00000518805 | 2201 nt | TSL 2 BASIC | 1.89 | □□□□□ -2.11 | | |
| UPP1 | Q16831 | XRCC4-205 | ENST00000511817 | 1636 nt | APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC | 1.89 | □□□□□ -2.11 | | |
| UPP1 | Q16831 | CGGBP1-202 | ENST00000398392 | 5298 nt | APPRIS P1 BASIC | 1.89 | □□□□□ -2.11 | | |
| UPP1 | Q16831 | Y_RNA.67-201 | ENST00000362870 | 100 nt | BASIC | 1.89 | □□□□□ -2.11 | | |
| UPP1 | Q16831 | U3.9-201 | ENST00000363823 | 204 nt | BASIC | 1.89 | □□□□□ -2.11 | | |
| UPP1 | Q16831 | SNORA25B-201 | ENST00000365507 | 128 nt | BASIC | 1.89 | □□□□□ -2.11 | | |
| UPP1 | Q16831 | RNU6-1297P-201 | ENST00000384415 | 104 nt | BASIC | 1.89 | □□□□□ -2.11 | | |
| UPP1 | Q16831 | Y_RNA.604-201 | ENST00000410574 | 102 nt | BASIC | 1.89 | □□□□□ -2.11 | | |
| UPP1 | Q16831 | Y_RNA.646-201 | ENST00000410980 | 101 nt | BASIC | 1.89 | □□□□□ -2.11 | | |
| UPP1 | Q16831 | USMG5P1-201 | ENST00000425964 | 177 nt | BASIC | 1.89 | □□□□□ -2.11 | | |
| UPP1 | Q16831 | RPL30P10-201 | ENST00000488148 | 337 nt | BASIC | 1.89 | □□□□□ -2.11 | | |
| UPP1 | Q16831 | AC116563.1-201 | ENST00000505454 | 396 nt | TSL 3 BASIC | 1.89 | □□□□□ -2.11 | | |
| UPP1 | Q16831 | KRTAP13-6P-201 | ENST00000508999 | 371 nt | BASIC | 1.89 | □□□□□ -2.11 | | |
| UPP1 | Q16831 | RNU4ATAC7P-201 | ENST00000516280 | 125 nt | BASIC | 1.89 | □□□□□ -2.11 | | |
| UPP1 | Q16831 | RNU6-667P-201 | ENST00000517186 | 102 nt | BASIC | 1.89 | □□□□□ -2.11 | | |
| UPP1 | Q16831 | ZNF436-AS1-205 | ENST00000518600 | 376 nt | TSL 5 BASIC | 1.89 | □□□□□ -2.11 | | |