Protein–RNA interactions for Protein: Q16512

PKN1, Serine/threonine-protein kinase N1, humanhuman

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Length 942 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKN1Q16512 AC138623.1-201ENST00000418060 216 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
PKN1Q16512 AL353705.1-201ENST00000433468 480 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
PKN1Q16512 AC013727.2-201ENST00000447761 545 ntTSL 4 BASIC3.74□□□□□ -1.81
PKN1Q16512 AL353705.4-201ENST00000449661 238 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
PKN1Q16512 AC005042.3-201ENST00000453230 174 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
PKN1Q16512 KC877373.1-201ENST00000479066 408 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
PKN1Q16512 AC092185.1-201ENST00000491371 97 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
PKN1Q16512 RNU6-840P-201ENST00000517275 65 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
PKN1Q16512 AC104027.1-201ENST00000521887 300 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
PKN1Q16512 AC021269.2-201ENST00000532318 330 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
PKN1Q16512 HIGD1AP1-201ENST00000550979 275 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
PKN1Q16512 MIR5680-201ENST00000577577 84 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
PKN1Q16512 AC006023.1-201ENST00000603944 259 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
PKN1Q16512 AL161798.1-201ENST00000604630 131 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
PKN1Q16512 RMST_6.1-201ENST00000611980 203 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
PKN1Q16512 AC008555.8-201ENST00000623602 2168 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
PKN1Q16512 LMBR1-222ENST00000638959 93 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
PKN1Q16512 AL596211.1-201ENST00000569873 2277 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
PKN1Q16512 RMDN2-203ENST00000402091 1973 ntTSL 2 BASIC3.74□□□□□ -1.81
PKN1Q16512 RXFP1-201ENST00000307765 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
PKN1Q16512 AGL-205ENST00000370163 7166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
PKN1Q16512 MTND5P35-201ENST00000557537 1720 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
PKN1Q16512 RNU1-75P-201ENST00000347264 129 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
PKN1Q16512 AC006461.1-201ENST00000412637 326 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
PKN1Q16512 NDUFB4P7-201ENST00000423198 363 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
PKN1Q16512 TRIAP1P1-201ENST00000427062 225 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
PKN1Q16512 AL024508.1-201ENST00000432477 505 ntTSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
PKN1Q16512 VDAC1P3-201ENST00000434069 851 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
PKN1Q16512 CST9LP2-201ENST00000437612 320 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
PKN1Q16512 HMGN1P18-201ENST00000457642 277 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
PKN1Q16512 AP002884.2-201ENST00000471647 395 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
PKN1Q16512 UBE2Q2P9-201ENST00000490086 202 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
PKN1Q16512 RNU1-143P-201ENST00000516296 146 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
PKN1Q16512 UTP23-205ENST00000520733 369 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
PKN1Q16512 AC109810.1-201ENST00000534066 224 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
PKN1Q16512 NDUFA5P6-201ENST00000542110 379 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
PKN1Q16512 AC090049.2-201ENST00000550377 109 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
PKN1Q16512 MIR3690-201ENST00000580266 75 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
PKN1Q16512 U1.23-201ENST00000610293 146 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
PKN1Q16512 AC013412.1-201ENST00000610687 192 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
PKN1Q16512 MIR7106-201ENST00000612419 65 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
PKN1Q16512 RNU1-68P-201ENST00000615382 146 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
PKN1Q16512 MUCL1-205ENST00000619042 243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
PKN1Q16512 U1.39-201ENST00000621562 146 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
PKN1Q16512 AP001340.1-201ENST00000624405 217 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
PKN1Q16512 HS1BP3-208ENST00000631166 78 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
PKN1Q16512 AC069528.2-201ENST00000624849 1991 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
PKN1Q16512 RNF128-202ENST00000324342 2654 ntTSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
PKN1Q16512 TDRD15-201ENST00000405799 6135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.72□□□□□ -1.81
PKN1Q16512 MT-ATP8-201ENST00000361851 207 ntAPPRIS P1 BASIC3.72□□□□□ -1.81
PKN1Q16512 MIR412-201ENST00000362142 91 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
PKN1Q16512 RNU6-1048P-201ENST00000364054 107 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
PKN1Q16512 RNU6-1180P-201ENST00000364935 107 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
PKN1Q16512 RNU6-905P-201ENST00000384434 107 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
PKN1Q16512 RNU6-768P-201ENST00000384683 107 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
PKN1Q16512 TRAV24-201ENST00000390453 343 ntAPPRIS P1 BASIC3.72□□□□□ -1.81
PKN1Q16512 AL139095.1-201ENST00000404326 391 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
PKN1Q16512 RNU6-588P-201ENST00000410281 105 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
PKN1Q16512 AC097662.1-205ENST00000433324 241 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
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PKN1Q16512 AC092162.2-204ENST00000451851 566 ntTSL 4 BASIC3.72□□□□□ -1.81
PKN1Q16512 AL445465.2-201ENST00000455530 461 ntTSL 2 BASIC3.72□□□□□ -1.81
PKN1Q16512 snoU109.2-201ENST00000459316 135 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
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PKN1Q16512 AC017015.2-201ENST00000497946 376 ntTSL 2 BASIC3.72□□□□□ -1.81
PKN1Q16512 RNU6-927P-201ENST00000516199 100 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
PKN1Q16512 AP001328.1-201ENST00000528550 176 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
PKN1Q16512 LINC02164-201ENST00000566684 272 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
PKN1Q16512 AC135178.3-204ENST00000585181 451 ntTSL 2 BASIC3.72□□□□□ -1.81
PKN1Q16512 uc_338.28-201ENST00000612082 187 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
PKN1Q16512 AL353748.2-201ENST00000622148 471 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
PKN1Q16512 AC073476.4-201ENST00000628409 72 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
PKN1Q16512 SNORA43.4-201ENST00000629559 138 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
PKN1Q16512 Clostridiales-1.2-201ENST00000636724 160 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
PKN1Q16512 U4.7-201ENST00000638126 106 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
PKN1Q16512 AC241585.2-209ENST00000638217 143 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
PKN1Q16512 AC009541.1-201ENST00000438279 2662 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
PKN1Q16512 AL050331.3-201ENST00000448740 2081 ntTSL 2 BASIC3.72□□□□□ -1.81
PKN1Q16512 AC100800.1-201ENST00000524252 2054 ntTSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
PKN1Q16512 AL353746.1-201ENST00000566293 6881 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
PKN1Q16512 CLCA4-201ENST00000370563 3211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
PKN1Q16512 RMDN2-205ENST00000407257 2280 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
PKN1Q16512 OR56A3-203ENST00000641160 4438 ntAPPRIS P1 BASIC3.71□□□□□ -1.81
PKN1Q16512 FIGNL1-212ENST00000613602 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
PKN1Q16512 RNU6-335P-201ENST00000364563 113 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
PKN1Q16512 RNU6-915P-201ENST00000364943 103 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
PKN1Q16512 SPRR2E-201ENST00000368750 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
PKN1Q16512 SNORA12.1-201ENST00000390873 148 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
PKN1Q16512 SNORA26.5-201ENST00000391215 123 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
PKN1Q16512 AL031121.1-201ENST00000406553 254 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
PKN1Q16512 AL138962.1-201ENST00000417987 411 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
PKN1Q16512 C1orf195-201ENST00000424792 255 ntTSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.82
PKN1Q16512 RPL21P66-201ENST00000426566 466 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
PKN1Q16512 RN7SKP179-201ENST00000516126 217 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
PKN1Q16512 RNU6-638P-201ENST00000516582 104 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
PKN1Q16512 AL121603.1-201ENST00000553815 142 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
PKN1Q16512 MIR4474-201ENST00000579189 78 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
PKN1Q16512 MIR4672-201ENST00000583126 81 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
PKN1Q16512 AL391813.1-201ENST00000603098 260 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
PKN1Q16512 U7.2-201ENST00000607576 63 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
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