Protein–RNA interactions for Protein: Q15628

TRADD, Tumor necrosis factor receptor type 1-associated DEATH domain protein, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRADDQ15628 TRAJ23-201ENST00000390514 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.73□□□□□ -2.13
TRADDQ15628 AC139712.2-201ENST00000424302 339 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TRADDQ15628 MYCBP2-AS1-203ENST00000450627 349 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
TRADDQ15628 AC069439.1-201ENST00000494739 167 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TRADDQ15628 RPS23P5-201ENST00000495419 428 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TRADDQ15628 MTCO2P30-201ENST00000503662 364 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TRADDQ15628 YWHAEP4-201ENST00000505390 198 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TRADDQ15628 AC091944.1-201ENST00000521984 449 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
TRADDQ15628 AC099518.4-202ENST00000576433 455 ntTSL 2 BASIC1.73□□□□□ -2.13
TRADDQ15628 AC090371.2-202ENST00000582239 644 ntTSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
TRADDQ15628 TP73-AS1.1-201ENST00000611447 161 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TRADDQ15628 RMST_6.1-201ENST00000611980 203 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TRADDQ15628 AC002553.4-201ENST00000616896 331 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TRADDQ15628 MESTIT1_1.1-201ENST00000618871 140 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TRADDQ15628 AC006504.8-201ENST00000621046 635 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TRADDQ15628 CEP57L1-216ENST00000521522 2259 ntTSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
TRADDQ15628 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC1.73□□□□□ -2.13
TRADDQ15628 SEMG2-201ENST00000372769 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
TRADDQ15628 RNU6-545P-201ENST00000362681 104 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
TRADDQ15628 RNU4-42P-201ENST00000364738 142 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
TRADDQ15628 RNU6-790P-201ENST00000384479 105 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
TRADDQ15628 MIR1277-201ENST00000408536 78 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
TRADDQ15628 OOSP1P1-201ENST00000423265 274 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
TRADDQ15628 Z82188.1-201ENST00000436709 154 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
TRADDQ15628 AL353572.1-201ENST00000442490 417 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
TRADDQ15628 AC010531.2-201ENST00000465012 153 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
TRADDQ15628 AC087477.1-201ENST00000465747 340 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
TRADDQ15628 AC096711.2-201ENST00000510592 454 ntTSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
TRADDQ15628 AC011939.2-201ENST00000567396 428 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
TRADDQ15628 B3GNTL1P2-201ENST00000603673 288 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
TRADDQ15628 RPL17P51-201ENST00000605218 238 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
TRADDQ15628 AL161716.1-201ENST00000606365 273 ntTSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
TRADDQ15628 AC009318.2-201ENST00000610917 651 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
TRADDQ15628 AL589935.1-202ENST00000612512 393 ntTSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
TRADDQ15628 ST7-OT4_2.1-201ENST00000619089 172 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
TRADDQ15628 VPS13A-206ENST00000376646 2262 ntTSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.13
TRADDQ15628 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC1.71□□□□□ -2.14
TRADDQ15628 RNU6-192P-201ENST00000391253 100 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
TRADDQ15628 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
TRADDQ15628 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
TRADDQ15628 AL358453.1-201ENST00000422522 250 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
TRADDQ15628 Z82205.1-201ENST00000428456 297 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
TRADDQ15628 AC004386.2-201ENST00000441858 148 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
TRADDQ15628 MTCO3P8-201ENST00000453691 755 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
TRADDQ15628 HMGN2P23-201ENST00000456759 269 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
TRADDQ15628 HMGN1P13-201ENST00000505795 138 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
TRADDQ15628 RNU6-970P-201ENST00000516312 107 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
TRADDQ15628 RNU6-273P-201ENST00000516937 96 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
TRADDQ15628 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
TRADDQ15628 AC009754.1-201ENST00000566282 540 ntTSL 4 BASIC1.71□□□□□ -2.14
TRADDQ15628 DEFB122-202ENST00000569013 197 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
TRADDQ15628 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
TRADDQ15628 AC100781.1-201ENST00000597142 383 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
TRADDQ15628 AC080078.2-201ENST00000603766 501 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
TRADDQ15628 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
TRADDQ15628 AC005562.2-201ENST00000618264 111 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
TRADDQ15628 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
TRADDQ15628 KIAA1107-201ENST00000370378 4622 ntTSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
TRADDQ15628 TRAJ6-201ENST00000390531 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.7□□□□□ -2.14
TRADDQ15628 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
TRADDQ15628 FCF1P9-201ENST00000412546 282 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
TRADDQ15628 RPS20P15-201ENST00000412792 311 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
TRADDQ15628 PLCL2-AS1-201ENST00000414844 311 ntTSL 2 BASIC1.7□□□□□ -2.14
TRADDQ15628 EIF1P1-201ENST00000421436 341 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
TRADDQ15628 MTCO3P46-201ENST00000425787 232 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
TRADDQ15628 RNU6-566P-201ENST00000516790 107 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
TRADDQ15628 CBX3P4-201ENST00000538909 354 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
TRADDQ15628 AC092490.2-202ENST00000544922 462 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
TRADDQ15628 POLR3GP2-201ENST00000588366 668 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
TRADDQ15628 AC010900.2-201ENST00000604508 210 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
TRADDQ15628 AL357054.2-201ENST00000607644 423 ntTSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
TRADDQ15628 AL355512.1-202ENST00000607952 209 ntTSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
TRADDQ15628 AC019193.3-201ENST00000609144 554 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
TRADDQ15628 MIR8081-201ENST00000611533 95 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
TRADDQ15628 MIR8074-201ENST00000615081 81 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
TRADDQ15628 LINC01515-217ENST00000620859 694 ntTSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
TRADDQ15628 AC098679.4-201ENST00000624241 654 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
TRADDQ15628 ZRANB2-AS2-222ENST00000625045 1014 ntTSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
TRADDQ15628 AL133216.2-202ENST00000634512 349 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
TRADDQ15628 MTND5P9-201ENST00000503854 1755 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
TRADDQ15628 RNU6-661P-201ENST00000362409 107 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
TRADDQ15628 RNU6-306P-201ENST00000384617 107 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
TRADDQ15628 TRAJ39-201ENST00000390498 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.69□□□□□ -2.14
TRADDQ15628 PIGP-205ENST00000399103 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
TRADDQ15628 DAP3P1-201ENST00000441522 278 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
TRADDQ15628 snoU13.15-201ENST00000459407 104 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
TRADDQ15628 RNU4-49P-201ENST00000516080 140 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
TRADDQ15628 RNA5SP454-201ENST00000517231 127 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
TRADDQ15628 AL157688.1-201ENST00000555990 369 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
TRADDQ15628 SUB1P4-201ENST00000566062 339 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
TRADDQ15628 AC002558.3-201ENST00000574021 401 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
TRADDQ15628 MIR5696-201ENST00000578474 85 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
TRADDQ15628 AC018638.8-201ENST00000588755 281 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
TRADDQ15628 AC016925.2-201ENST00000605108 242 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
TRADDQ15628 AC124303.1-201ENST00000605703 360 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
TRADDQ15628 TCL6_2.1-201ENST00000615162 119 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
TRADDQ15628 SCARNA4-201ENST00000629045 128 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
TRADDQ15628 AC008781.2-201ENST00000502205 2480 ntTSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
TRADDQ15628 MIR424-201ENST00000362227 98 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
TRADDQ15628 RNU6-418P-201ENST00000384035 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 145.1 ms