Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 RNU5E-5P-201ENST00000365379 116 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
SYCP1Q15431 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
SYCP1Q15431 AL008987.1-201ENST00000415528 237 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
SYCP1Q15431 AC104850.1-201ENST00000435940 476 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
SYCP1Q15431 HMGN2P34-201ENST00000437647 269 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
SYCP1Q15431 AC016717.1-201ENST00000448918 286 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
SYCP1Q15431 AL009048.1-201ENST00000450437 298 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
SYCP1Q15431 AL162395.1-201ENST00000457882 422 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
SYCP1Q15431 LRRC34P2-201ENST00000514850 553 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
SYCP1Q15431 RNU6-1146P-201ENST00000516282 102 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
SYCP1Q15431 CARD18-202ENST00000530950 652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.7□□□□□ -2.3
SYCP1Q15431 AL133173.2-201ENST00000614270 90 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
SYCP1Q15431 SNORA43.4-201ENST00000629559 138 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
SYCP1Q15431 AC010487.4-201ENST00000637027 61 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
SYCP1Q15431 MGST1-207ENST00000535309 1331 ntTSL 1 (best) BASIC0.69□□□□□ -2.3
SYCP1Q15431 PDCL2-201ENST00000295645 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.69□□□□□ -2.3
SYCP1Q15431 Y_RNA.115-201ENST00000363272 98 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
SYCP1Q15431 Y_RNA.124-201ENST00000363339 93 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
SYCP1Q15431 RNU5F-7P-201ENST00000363696 115 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
SYCP1Q15431 Y_RNA.251-201ENST00000364551 99 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
SYCP1Q15431 Y_RNA.367-201ENST00000365544 101 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
SYCP1Q15431 RNU6-1235P-201ENST00000384559 107 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
SYCP1Q15431 RNU6-417P-201ENST00000384712 107 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
SYCP1Q15431 MIR508-201ENST00000384857 115 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
SYCP1Q15431 AL162411.1-201ENST00000413145 526 ntTSL 2 BASIC0.69□□□□□ -2.3
SYCP1Q15431 RPS3AP1-201ENST00000413190 320 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
SYCP1Q15431 RPS26P5-201ENST00000418544 335 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
SYCP1Q15431 AC011233.1-201ENST00000422812 283 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
SYCP1Q15431 MTCO2P23-201ENST00000425216 680 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
SYCP1Q15431 AC010154.1-201ENST00000425857 269 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
SYCP1Q15431 AL356583.2-201ENST00000426536 280 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
SYCP1Q15431 AC002429.1-201ENST00000437672 148 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
SYCP1Q15431 RNU6-498P-201ENST00000459468 107 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
SYCP1Q15431 AC048334.1-201ENST00000477975 159 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
SYCP1Q15431 AC010486.2-201ENST00000505572 483 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
SYCP1Q15431 DEFB131C-201ENST00000528817 165 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
SYCP1Q15431 AC027544.2-201ENST00000539313 630 ntTSL 5 BASIC0.69□□□□□ -2.3
SYCP1Q15431 AC025423.5-201ENST00000550230 219 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
SYCP1Q15431 AC022432.1-201ENST00000595739 310 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
SYCP1Q15431 AL078595.3-201ENST00000623815 1166 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
SYCP1Q15431 MIR924-201ENST00000638017 53 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
SYCP1Q15431 Y_RNA.480-201ENST00000384364 102 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
SYCP1Q15431 RNU6-1031P-201ENST00000384773 107 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
SYCP1Q15431 MIR605-201ENST00000385078 83 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
SYCP1Q15431 RNA5SP323-201ENST00000391094 133 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
SYCP1Q15431 MTCO2P6-201ENST00000463134 685 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
SYCP1Q15431 AL136537.1-201ENST00000508199 538 ntTSL 3 BASIC0.68□□□□□ -2.3
SYCP1Q15431 AC090572.1-201ENST00000519251 160 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
SYCP1Q15431 AC018554.1-201ENST00000565506 800 ntTSL 2 BASIC0.68□□□□□ -2.3
SYCP1Q15431 AC104458.1-201ENST00000608243 463 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
SYCP1Q15431 AC091304.9-201ENST00000612091 226 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
SYCP1Q15431 AC138058.1-201ENST00000620572 449 ntTSL 3 BASIC0.68□□□□□ -2.3
SYCP1Q15431 AC022418.1-201ENST00000624118 445 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
SYCP1Q15431 E2F5-208ENST00000521429 1551 ntTSL 5 BASIC0.67□□□□□ -2.3
SYCP1Q15431 RNU6-393P-201ENST00000384475 107 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
SYCP1Q15431 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
SYCP1Q15431 MIR92A1-201ENST00000385233 78 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
SYCP1Q15431 SNORD12-201ENST00000391002 90 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
SYCP1Q15431 RNA5SP467-201ENST00000391274 118 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
SYCP1Q15431 UBE2V1P12-201ENST00000503954 474 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
SYCP1Q15431 AC024995.1-201ENST00000523014 93 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
SYCP1Q15431 AC007347.1-201ENST00000563879 281 ntTSL 3 BASIC0.67□□□□□ -2.3
SYCP1Q15431 HOXA11-AS1_4.1-201ENST00000620901 233 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
SYCP1Q15431 AC006001.4-201ENST00000622243 395 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
SYCP1Q15431 TTK-211ENST00000627129 240 ntTSL 5 BASIC0.67□□□□□ -2.3
SYCP1Q15431 AC007671.2-201ENST00000637344 619 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
SYCP1Q15431 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC0.66□□□□□ -2.3
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SYCP1Q15431 MIR936-201ENST00000401264 98 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SYCP1Q15431 RNU6-1054P-201ENST00000411293 104 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SYCP1Q15431 AL669831.2-201ENST00000422528 456 ntTSL 5 BASIC0.66□□□□□ -2.3
SYCP1Q15431 AL136972.1-201ENST00000443471 351 ntTSL 3 BASIC0.66□□□□□ -2.3
SYCP1Q15431 AC069542.1-201ENST00000445235 557 ntTSL 3 BASIC0.66□□□□□ -2.3
SYCP1Q15431 AC073127.1-201ENST00000447336 333 ntTSL 3 BASIC0.66□□□□□ -2.3
SYCP1Q15431 EPS15P1-201ENST00000448836 336 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SYCP1Q15431 AC079382.1-201ENST00000493346 557 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SYCP1Q15431 Vault.3-201ENST00000516676 95 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SYCP1Q15431 RNU6-922P-201ENST00000516753 99 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SYCP1Q15431 RNU6-410P-201ENST00000517006 107 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SYCP1Q15431 RNU2-46P-201ENST00000517038 113 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SYCP1Q15431 AP003484.1-201ENST00000530974 250 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SYCP1Q15431 AC004812.1-201ENST00000540773 146 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SYCP1Q15431 AL121579.1-201ENST00000555129 305 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SYCP1Q15431 AC009145.3-201ENST00000567386 476 ntTSL 3 BASIC0.66□□□□□ -2.3
SYCP1Q15431 AC068790.6-201ENST00000602558 258 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SYCP1Q15431 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SYCP1Q15431 AL359697.1-201ENST00000624879 587 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SYCP1Q15431 MTND4P9-201ENST00000507819 1346 ntBASIC0.65□□□□□ -2.3
SYCP1Q15431 MT-ATP6-201ENST00000361899 681 ntAPPRIS P1 BASIC0.65□□□□□ -2.31
SYCP1Q15431 RNA5SP361-201ENST00000362686 118 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SYCP1Q15431 Y_RNA.85-201ENST00000363014 111 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SYCP1Q15431 Y_RNA.287-201ENST00000364853 94 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SYCP1Q15431 MIR1253-201ENST00000408273 105 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SYCP1Q15431 AC098592.1-201ENST00000419352 333 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SYCP1Q15431 AL135908.1-201ENST00000431394 446 ntTSL 3 BASIC0.65□□□□□ -2.31
SYCP1Q15431 AL606517.2-201ENST00000442855 241 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SYCP1Q15431 AC091212.1-201ENST00000474798 395 ntTSL 5 BASIC0.65□□□□□ -2.31
SYCP1Q15431 SNORD79.1-201ENST00000516069 84 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SYCP1Q15431 SNORA25.17-201ENST00000517184 124 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SYCP1Q15431 AL590705.4-201ENST00000532209 134 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
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