Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 RNU6-310P-201ENST00000384655 107 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
HERC3Q15034 Y_RNA.646-201ENST00000410980 101 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
HERC3Q15034 AL589935.1-209ENST00000432050 418 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
HERC3Q15034 Y_RNA.653-201ENST00000459091 95 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
HERC3Q15034 Y_RNA.632-201ENST00000459189 102 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
HERC3Q15034 AC007215.1-201ENST00000464893 276 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
HERC3Q15034 KRTAP13-6P-201ENST00000508999 371 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
HERC3Q15034 RNU7-175P-201ENST00000515915 61 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
HERC3Q15034 SCARNA16.2-201ENST00000516520 172 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
HERC3Q15034 AC034114.1-201ENST00000520293 285 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
HERC3Q15034 AC026462.3-202ENST00000564361 515 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
HERC3Q15034 MIR3126-201ENST00000577443 74 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
HERC3Q15034 AL627230.6-201ENST00000611129 280 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
HERC3Q15034 ST7-OT4_2.1-201ENST00000619089 172 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
HERC3Q15034 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
HERC3Q15034 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.09
HERC3Q15034 AC008555.8-201ENST00000623602 2168 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
HERC3Q15034 RNY1P16-201ENST00000363063 111 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
HERC3Q15034 RNU6-137P-201ENST00000363680 108 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
HERC3Q15034 SNORD115-8-201ENST00000363856 82 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
HERC3Q15034 Y_RNA.259-201ENST00000364619 101 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
HERC3Q15034 SNORD115-38-201ENST00000365037 82 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
HERC3Q15034 RNU6-17P-201ENST00000384245 107 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
HERC3Q15034 RNU6-611P-201ENST00000384276 104 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
HERC3Q15034 SNORD116-29-201ENST00000384516 83 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
HERC3Q15034 RNU6-18P-201ENST00000384527 107 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
HERC3Q15034 MIR32-201ENST00000384965 70 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
HERC3Q15034 MIR153-2-201ENST00000385225 87 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
HERC3Q15034 RNY4P36-201ENST00000391116 96 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
HERC3Q15034 SNORA75.6-201ENST00000391318 127 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
HERC3Q15034 AL358234.1-201ENST00000421132 273 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
HERC3Q15034 MS4A4E-203ENST00000425663 350 ntTSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
HERC3Q15034 AL132875.2-201ENST00000436418 325 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
HERC3Q15034 AC055731.1-201ENST00000474387 401 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
HERC3Q15034 MRPS17P9-201ENST00000511924 393 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
HERC3Q15034 RNU6-965P-201ENST00000516721 96 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
HERC3Q15034 Y_RNA.718-201ENST00000517110 102 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
HERC3Q15034 RNU6-667P-201ENST00000517186 102 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
HERC3Q15034 SNORA31.25-201ENST00000517242 134 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
HERC3Q15034 AC108449.1-202ENST00000517632 478 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
HERC3Q15034 AC093027.1-201ENST00000546698 429 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
HERC3Q15034 AL157688.1-201ENST00000555990 369 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
HERC3Q15034 ANP32BP3-201ENST00000559213 706 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
HERC3Q15034 AC008749.1-201ENST00000597650 306 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
HERC3Q15034 AC013412.1-201ENST00000610687 192 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
HERC3Q15034 AC133104.2-201ENST00000615272 193 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
HERC3Q15034 MTND4LP32-201ENST00000636111 270 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
HERC3Q15034 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
HERC3Q15034 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
HERC3Q15034 AL161668.1-201ENST00000320322 358 ntTSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
HERC3Q15034 Y_RNA.67-201ENST00000362870 100 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
HERC3Q15034 SNORA12.2-201ENST00000391040 156 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
HERC3Q15034 RNU6-1304P-201ENST00000411374 106 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
HERC3Q15034 EDDM3CP-201ENST00000415977 425 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
HERC3Q15034 MTCO2P27-201ENST00000420740 428 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
HERC3Q15034 SMG7-AS1-202ENST00000432837 466 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
HERC3Q15034 AC008154.1-201ENST00000453087 327 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
HERC3Q15034 ELOCP24-201ENST00000456370 334 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
HERC3Q15034 SPAG11B-206ENST00000458665 444 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
HERC3Q15034 SNORD19B-201ENST00000459623 84 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
HERC3Q15034 LINC02233-201ENST00000513718 358 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
HERC3Q15034 RNA5SP137-201ENST00000516833 135 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
HERC3Q15034 RNU6-1198P-201ENST00000516904 67 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
HERC3Q15034 RNA5SP54-201ENST00000516951 92 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
HERC3Q15034 AP003171.1-201ENST00000532770 266 ntTSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
HERC3Q15034 AC022469.2-201ENST00000554759 396 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
HERC3Q15034 AC026470.2-201ENST00000561492 181 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
HERC3Q15034 AC090517.1-201ENST00000569307 266 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
HERC3Q15034 MIR4648-201ENST00000580107 72 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
HERC3Q15034 AP006219.1-201ENST00000580258 472 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
HERC3Q15034 MIR4795-201ENST00000584182 89 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
HERC3Q15034 C8orf59P2-201ENST00000603441 271 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
HERC3Q15034 AC016727.2-201ENST00000603988 621 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
HERC3Q15034 AC091965.1-202ENST00000607662 397 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
HERC3Q15034 SMAD5-AS1_4.1-201ENST00000615561 167 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
HERC3Q15034 AL359697.1-201ENST00000624879 587 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
HERC3Q15034 MIR1248-201ENST00000629190 106 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
HERC3Q15034 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
HERC3Q15034 KNL1-204ENST00000527044 5404 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
HERC3Q15034 RNU6-234P-201ENST00000365229 104 ntBASIC2□□□□□ -2.09
HERC3Q15034 Y_RNA.405-201ENST00000383979 100 ntBASIC2□□□□□ -2.09
HERC3Q15034 Y_RNA.451-201ENST00000384200 100 ntBASIC2□□□□□ -2.09
HERC3Q15034 Y_RNA.524-201ENST00000384564 100 ntBASIC2□□□□□ -2.09
HERC3Q15034 Y_RNA.561-201ENST00000384694 100 ntBASIC2□□□□□ -2.09
HERC3Q15034 SUMO2P12-201ENST00000405924 140 ntBASIC2□□□□□ -2.09
HERC3Q15034 AC022028.1-201ENST00000412054 408 ntBASIC2□□□□□ -2.09
HERC3Q15034 MTCO3P29-201ENST00000432119 779 ntBASIC2□□□□□ -2.09
HERC3Q15034 RPL23AP50-201ENST00000434149 455 ntBASIC2□□□□□ -2.09
HERC3Q15034 AC236972.2-201ENST00000434979 310 ntBASIC2□□□□□ -2.09
HERC3Q15034 TRBV25OR9-2-201ENST00000438417 374 ntBASIC2□□□□□ -2.09
HERC3Q15034 AL035666.1-201ENST00000446195 348 ntBASIC2□□□□□ -2.09
HERC3Q15034 MTCO3P10-201ENST00000455912 772 ntBASIC2□□□□□ -2.09
HERC3Q15034 RPL30P15-201ENST00000457129 321 ntBASIC2□□□□□ -2.09
HERC3Q15034 RPL17P19-201ENST00000489069 552 ntBASIC2□□□□□ -2.09
HERC3Q15034 AC116563.1-201ENST00000505454 396 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
HERC3Q15034 RNU2-19P-201ENST00000517288 84 ntBASIC2□□□□□ -2.09
HERC3Q15034 LINC02293-201ENST00000548335 574 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
HERC3Q15034 MIR4529-201ENST00000578110 78 ntBASIC2□□□□□ -2.09
HERC3Q15034 TEX41-243ENST00000614173 190 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
HERC3Q15034 BX322639.1-202ENST00000423987 2213 ntBASIC2□□□□□ -2.09
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