Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 RNU6-692P-201ENST00000384496 107 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
SMCO1Q147U7 AC104136.1-201ENST00000512969 394 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
SMCO1Q147U7 LRRC34P2-201ENST00000514850 553 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
SMCO1Q147U7 LINC02353-201ENST00000515181 849 ntTSL 1 (best) BASIC-0.38□□□□□ -2.47
SMCO1Q147U7 OR8K2P-201ENST00000524645 927 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
SMCO1Q147U7 AC141557.1-201ENST00000540982 400 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
SMCO1Q147U7 AC112693.2-201ENST00000556538 232 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
SMCO1Q147U7 AL391840.1-201ENST00000571144 367 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
SMCO1Q147U7 Z99497.2-201ENST00000603634 310 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
SMCO1Q147U7 AC097478.2-201ENST00000610572 514 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
SMCO1Q147U7 AL359075.3-201ENST00000613288 217 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
SMCO1Q147U7 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC-0.38□□□□□ -2.47
SMCO1Q147U7 AC091925.1-201ENST00000623204 462 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
SMCO1Q147U7 RNU6-562P-201ENST00000362731 107 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
SMCO1Q147U7 RNU6-236P-201ENST00000363886 106 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
SMCO1Q147U7 snoZ40.1-201ENST00000364540 72 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
SMCO1Q147U7 MIR549A-201ENST00000385268 96 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
SMCO1Q147U7 MIR1185-1-201ENST00000408598 86 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
SMCO1Q147U7 RNU6-293P-201ENST00000411259 106 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
SMCO1Q147U7 AC026616.1-201ENST00000523157 525 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
SMCO1Q147U7 AC087276.4-201ENST00000530042 444 ntTSL 3 BASIC-0.39□□□□□ -2.47
SMCO1Q147U7 AC004584.2-201ENST00000570407 410 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
SMCO1Q147U7 BCRP9-201ENST00000605312 388 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
SMCO1Q147U7 Z99289.3-201ENST00000605586 594 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
SMCO1Q147U7 AC064807.4-201ENST00000607201 407 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
SMCO1Q147U7 AC092574.1-201ENST00000609771 420 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
SMCO1Q147U7 DAOA-AS1_2.1-201ENST00000614829 187 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
SMCO1Q147U7 LINC01515-217ENST00000620859 694 ntTSL 5 BASIC-0.39□□□□□ -2.47
SMCO1Q147U7 AP002782.1-201ENST00000623107 614 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
SMCO1Q147U7 DEUP1-201ENST00000298050 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.39□□□□□ -2.47
SMCO1Q147U7 SNORD114-26-201ENST00000363543 72 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
SMCO1Q147U7 RNU6-468P-201ENST00000384003 109 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
SMCO1Q147U7 RNU2-62P-201ENST00000410868 191 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
SMCO1Q147U7 AL663109.1-201ENST00000411498 844 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
SMCO1Q147U7 AL354692.1-201ENST00000423044 315 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
SMCO1Q147U7 EEF1A1P39-201ENST00000440791 250 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
SMCO1Q147U7 NDUFB4P10-201ENST00000452541 359 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
SMCO1Q147U7 AC093850.1-201ENST00000454121 251 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
SMCO1Q147U7 AHI1-208ENST00000488690 712 ntTSL 5 BASIC-0.4□□□□□ -2.47
SMCO1Q147U7 AC079382.1-201ENST00000493346 557 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
SMCO1Q147U7 RPL23AP54-201ENST00000495129 419 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
SMCO1Q147U7 LINC02462-201ENST00000503009 430 ntTSL 5 BASIC-0.4□□□□□ -2.47
SMCO1Q147U7 AL158032.1-201ENST00000605401 106 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
SMCO1Q147U7 AC005520.5-201ENST00000613926 164 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
SMCO1Q147U7 MIR330-201ENST00000362196 94 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
SMCO1Q147U7 MTATP6P16-201ENST00000434543 526 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
SMCO1Q147U7 Z68323.1-201ENST00000450365 519 ntTSL 3 BASIC-0.41□□□□□ -2.48
SMCO1Q147U7 MTND2P30-201ENST00000456663 382 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
SMCO1Q147U7 AC104137.1-201ENST00000503625 385 ntTSL 3 BASIC-0.41□□□□□ -2.48
SMCO1Q147U7 AC005920.2-201ENST00000509833 332 ntTSL 3 BASIC-0.41□□□□□ -2.48
SMCO1Q147U7 SNORA40.12-201ENST00000516329 111 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
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SMCO1Q147U7 DEFB130C-202ENST00000530001 230 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
SMCO1Q147U7 LINC02442-201ENST00000537732 343 ntTSL 3 BASIC-0.41□□□□□ -2.48
SMCO1Q147U7 AC010620.1-201ENST00000601088 1102 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
SMCO1Q147U7 PART1_2.1-201ENST00000612397 250 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
SMCO1Q147U7 AC122133.1-201ENST00000613964 233 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
SMCO1Q147U7 AL031667.3-201ENST00000620124 655 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
SMCO1Q147U7 IST1-227ENST00000626438 126 ntTSL 5 BASIC-0.41□□□□□ -2.48
SMCO1Q147U7 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.41□□□□□ -2.48
SMCO1Q147U7 STARD6-201ENST00000307844 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.42□□□□□ -2.48
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SMCO1Q147U7 RNU6-552P-201ENST00000362869 119 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
SMCO1Q147U7 Y_RNA.116-201ENST00000363292 103 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
SMCO1Q147U7 U3.4-201ENST00000363352 213 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
SMCO1Q147U7 SNORD32A-201ENST00000364805 84 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
SMCO1Q147U7 RNU6-424P-201ENST00000384367 105 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
SMCO1Q147U7 MIR644A-201ENST00000385262 94 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
SMCO1Q147U7 RPS3AP3-201ENST00000411933 242 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
SMCO1Q147U7 AC019070.1-201ENST00000415008 1024 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
SMCO1Q147U7 AL139396.1-201ENST00000421137 167 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
SMCO1Q147U7 AL355674.1-201ENST00000423681 648 ntTSL 1 (best) BASIC-0.42□□□□□ -2.48
SMCO1Q147U7 CALM2P4-201ENST00000430810 426 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
SMCO1Q147U7 snoU13.18-201ENST00000459483 104 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
SMCO1Q147U7 AC091917.1-201ENST00000506330 566 ntTSL 4 BASIC-0.42□□□□□ -2.48
SMCO1Q147U7 VCAN-AS1-201ENST00000512090 424 ntTSL 3 BASIC-0.42□□□□□ -2.48
SMCO1Q147U7 MIR4305-201ENST00000583252 102 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
SMCO1Q147U7 AC073544.1-201ENST00000600110 1595 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
SMCO1Q147U7 U8.7-201ENST00000364940 136 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
SMCO1Q147U7 RNU6-679P-201ENST00000391003 106 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
SMCO1Q147U7 MIR208B-201ENST00000401172 77 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
SMCO1Q147U7 SNORD83.1-201ENST00000411362 77 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
SMCO1Q147U7 MTND3P17-201ENST00000416968 344 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
SMCO1Q147U7 AC106883.1-201ENST00000418805 562 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
SMCO1Q147U7 PLCH1-AS2-201ENST00000472913 408 ntTSL 2 BASIC-0.43□□□□□ -2.48
SMCO1Q147U7 AC120042.2-201ENST00000521556 667 ntTSL 2 BASIC-0.43□□□□□ -2.48
SMCO1Q147U7 RPL23AP91-201ENST00000569211 455 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
SMCO1Q147U7 MIR3612-201ENST00000579753 87 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
SMCO1Q147U7 RN7SL793P-201ENST00000583259 296 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
SMCO1Q147U7 SNORA25.18-201ENST00000607153 114 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
SMCO1Q147U7 AL450472.1-202ENST00000637286 180 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
SMCO1Q147U7 SNORD118-201ENST00000363593 134 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
SMCO1Q147U7 U8.16-201ENST00000391279 133 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
SMCO1Q147U7 AC121342.1-201ENST00000423914 550 ntTSL 3 BASIC-0.44□□□□□ -2.48
SMCO1Q147U7 AL512656.1-201ENST00000427492 401 ntTSL 2 BASIC-0.44□□□□□ -2.48
SMCO1Q147U7 AL133396.1-201ENST00000432048 687 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
SMCO1Q147U7 AC004854.1-201ENST00000440356 349 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
SMCO1Q147U7 AL157373.1-201ENST00000456036 276 ntTSL 3 BASIC-0.44□□□□□ -2.48
SMCO1Q147U7 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
SMCO1Q147U7 LINC02061-201ENST00000514225 335 ntTSL 3 BASIC-0.44□□□□□ -2.48
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