Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 AC104581.2-201ENST00000572227 430 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SMC1AQ14683 Z98751.3-201ENST00000604447 521 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SMC1AQ14683 Metazoa_SRP.32-201ENST00000622685 286 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SMC1AQ14683 SNORD115-47-201ENST00000391226 86 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SMC1AQ14683 MTCYBP2-201ENST00000407745 171 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SMC1AQ14683 RNU7-95P-201ENST00000459222 64 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SMC1AQ14683 AC021146.2-201ENST00000504736 556 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SMC1AQ14683 AC096736.2-201ENST00000507972 175 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
SMC1AQ14683 AC099520.1-206ENST00000523434 486 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
SMC1AQ14683 AC100830.2-201ENST00000581636 240 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SMC1AQ14683 U4.5-201ENST00000617137 123 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SMC1AQ14683 UHRF1BP1L-203ENST00000545232 4088 ntTSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
SMC1AQ14683 SEMG1-201ENST00000372781 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
SMC1AQ14683 Y_RNA.89-201ENST00000363031 102 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SMC1AQ14683 SNORD113-7-201ENST00000363762 77 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SMC1AQ14683 RNU6-877P-201ENST00000383868 107 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SMC1AQ14683 RNU6-378P-201ENST00000384324 107 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SMC1AQ14683 MIR521-1-201ENST00000384902 87 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SMC1AQ14683 MIR548F1-201ENST00000408667 84 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SMC1AQ14683 RNA5SP201-201ENST00000410316 124 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SMC1AQ14683 SNRPEP10-201ENST00000420249 274 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SMC1AQ14683 AC123900.1-201ENST00000420390 96 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SMC1AQ14683 AL360091.2-201ENST00000446847 650 ntTSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
SMC1AQ14683 LINC01691-201ENST00000450546 426 ntTSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
SMC1AQ14683 RNU1-131P-201ENST00000458943 161 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SMC1AQ14683 AC092944.1-205ENST00000494885 517 ntTSL 4 BASIC1.78□□□□□ -2.12
SMC1AQ14683 KRTAP13-6P-201ENST00000508999 371 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SMC1AQ14683 AC025465.3-201ENST00000510570 311 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SMC1AQ14683 CYP4A27P-201ENST00000567218 190 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SMC1AQ14683 SNORD53B-201ENST00000577887 78 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SMC1AQ14683 PCGEM1.1-201ENST00000613431 131 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SMC1AQ14683 MIR8070-201ENST00000616510 88 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SMC1AQ14683 AC068137.4-201ENST00000638485 296 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SMC1AQ14683 EFCAB5-213ENST00000638539 168 ntTSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
SMC1AQ14683 AC006026.1-201ENST00000444025 1803 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SMC1AQ14683 Y_RNA.123-201ENST00000363338 102 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SMC1AQ14683 Y_RNA.295-201ENST00000364918 102 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SMC1AQ14683 Y_RNA.453-201ENST00000384223 109 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SMC1AQ14683 RNU6-933P-201ENST00000384424 107 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SMC1AQ14683 DEFB110-202ENST00000393660 189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
SMC1AQ14683 MIR208B-201ENST00000401172 77 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SMC1AQ14683 AC005482.1-201ENST00000420758 575 ntTSL 4 BASIC1.77□□□□□ -2.13
SMC1AQ14683 AC012306.1-201ENST00000423267 114 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SMC1AQ14683 NAALADL2-AS1-201ENST00000426315 804 ntTSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
SMC1AQ14683 USP9YP28-201ENST00000435142 589 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SMC1AQ14683 MTND1P34-201ENST00000438556 671 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SMC1AQ14683 SNRPG-205ENST00000449935 428 ntTSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
SMC1AQ14683 snoU13.6-201ENST00000458785 104 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SMC1AQ14683 snoU13.9-201ENST00000458927 103 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SMC1AQ14683 RNU7-66P-201ENST00000459469 62 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SMC1AQ14683 AC092989.1-201ENST00000481235 277 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SMC1AQ14683 MTCO1P29-201ENST00000496868 288 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SMC1AQ14683 AC110799.1-201ENST00000509098 449 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
SMC1AQ14683 RNU6-718P-201ENST00000516166 105 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SMC1AQ14683 RNU6-567P-201ENST00000516746 107 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SMC1AQ14683 PWRN1-203ENST00000564898 389 ntTSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
SMC1AQ14683 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SMC1AQ14683 AP006219.1-201ENST00000580258 472 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
SMC1AQ14683 AC146944.4-201ENST00000602697 718 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SMC1AQ14683 AC090617.10-201ENST00000624308 134 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SMC1AQ14683 Y_RNA.67-201ENST00000362870 100 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SMC1AQ14683 U3.9-201ENST00000363823 204 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SMC1AQ14683 RNU6-534P-201ENST00000364877 106 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SMC1AQ14683 RNU6-438P-201ENST00000365561 103 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SMC1AQ14683 RNU6-128P-201ENST00000383976 107 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SMC1AQ14683 Y_RNA.530-201ENST00000384587 101 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SMC1AQ14683 Y_RNA.573-201ENST00000384763 105 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SMC1AQ14683 MIR499A-201ENST00000384903 122 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SMC1AQ14683 RNU6-373P-201ENST00000411247 98 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SMC1AQ14683 MTCO3P18-201ENST00000440206 761 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SMC1AQ14683 SNRPEP8-201ENST00000442866 260 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SMC1AQ14683 RNU7-187P-201ENST00000458985 68 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SMC1AQ14683 AC007547.1-201ENST00000462177 490 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SMC1AQ14683 MTCYBP18-201ENST00000501056 747 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SMC1AQ14683 AC114801.2-201ENST00000503825 781 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SMC1AQ14683 AC097473.1-201ENST00000508142 408 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SMC1AQ14683 MTND1P5-201ENST00000517906 940 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SMC1AQ14683 CARD18-203ENST00000532895 422 ntTSL 2 BASIC1.76□□□□□ -2.13
SMC1AQ14683 AC023796.2-201ENST00000545410 451 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
SMC1AQ14683 MIR3976-201ENST00000606807 139 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SMC1AQ14683 AC090517.2-201ENST00000614966 680 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SMC1AQ14683 HOXA11-AS1_4.1-201ENST00000620901 233 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SMC1AQ14683 MIR3688-2-201ENST00000636963 87 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SMC1AQ14683 AC100810.6-201ENST00000638068 285 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SMC1AQ14683 CYLC1-201ENST00000329312 2106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
SMC1AQ14683 Y_RNA.6-201ENST00000362350 114 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SMC1AQ14683 SNORA25.9-201ENST00000365087 128 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SMC1AQ14683 RNU6ATAC2P-201ENST00000387943 126 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SMC1AQ14683 RNU2-41P-201ENST00000410991 178 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SMC1AQ14683 RPL21P111-201ENST00000418453 477 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SMC1AQ14683 AL590632.1-201ENST00000424289 371 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SMC1AQ14683 AC015983.2-201ENST00000446053 472 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
SMC1AQ14683 AC087477.1-201ENST00000465747 340 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SMC1AQ14683 HMGN1P13-201ENST00000505795 138 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SMC1AQ14683 AC096745.1-201ENST00000509945 370 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SMC1AQ14683 IGHVII-53-1-201ENST00000519538 255 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SMC1AQ14683 AC087518.1-201ENST00000524098 187 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
SMC1AQ14683 EIF4A1P12-201ENST00000551910 141 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SMC1AQ14683 AC090371.2-202ENST00000582239 644 ntTSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
SMC1AQ14683 AC068790.6-201ENST00000602558 258 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
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