Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 CR936218.1-201ENST00000570454 304 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
GBX1Q14549 RPL12P50-201ENST00000603116 116 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
GBX1Q14549 DLEU2_6.1-201ENST00000610536 112 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
GBX1Q14549 AC083806.3-201ENST00000614016 455 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
GBX1Q14549 AC018692.1-202ENST00000623559 676 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
GBX1Q14549 AC134503.1-201ENST00000633048 54 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
GBX1Q14549 AC245060.5-201ENST00000610778 3293 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
GBX1Q14549 ARHGAP15-202ENST00000409869 2968 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
GBX1Q14549 SYTL2-230ENST00000634661 6672 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
GBX1Q14549 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
GBX1Q14549 Y_RNA.332-201ENST00000365271 113 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
GBX1Q14549 MIR9-1-201ENST00000385198 89 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
GBX1Q14549 NPS-201ENST00000398023 270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
GBX1Q14549 AL078595.1-201ENST00000404458 226 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
GBX1Q14549 AC004866.1-201ENST00000411748 78 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
GBX1Q14549 AC018865.2-201ENST00000423631 129 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
GBX1Q14549 LINC00407-201ENST00000426509 295 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
GBX1Q14549 AC096644.2-201ENST00000429278 159 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
GBX1Q14549 AC087499.2-201ENST00000432861 149 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
GBX1Q14549 AL137792.2-201ENST00000443484 235 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
GBX1Q14549 AC010095.1-201ENST00000443543 144 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
GBX1Q14549 UQCRBP2-201ENST00000447827 297 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
GBX1Q14549 Y_RNA.701-201ENST00000516812 110 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
GBX1Q14549 RNU6-988P-201ENST00000519081 107 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
GBX1Q14549 HSBP1P1-201ENST00000555205 166 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
GBX1Q14549 AC044792.1-201ENST00000593294 196 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
GBX1Q14549 AC022202.1-201ENST00000613515 211 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
GBX1Q14549 AASDH-207ENST00000513376 3241 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
GBX1Q14549 HIF1A-201ENST00000323441 3555 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
GBX1Q14549 ZNF680-202ENST00000447137 2159 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
GBX1Q14549 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC2.66□□□□□ -1.98
GBX1Q14549 SNORA67.1-201ENST00000364749 141 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
GBX1Q14549 MIR1302-11-201ENST00000408051 138 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
GBX1Q14549 MIR1262-201ENST00000408276 93 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
GBX1Q14549 MIR548P-201ENST00000408336 84 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
GBX1Q14549 MIR1302-9-201ENST00000408365 138 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
GBX1Q14549 MIR1302-10-201ENST00000408734 138 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
GBX1Q14549 UBE2E2-AS1-202ENST00000430018 499 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
GBX1Q14549 U8.22-201ENST00000459141 133 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
GBX1Q14549 RNA5SP367-201ENST00000516557 118 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
GBX1Q14549 RNU6-107P-201ENST00000516643 102 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
GBX1Q14549 RN7SKP49-201ENST00000516675 260 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
GBX1Q14549 RN7SKP295-201ENST00000517264 153 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
GBX1Q14549 C18orf54-203ENST00000578138 776 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
GBX1Q14549 AC135178.3-204ENST00000585181 451 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
GBX1Q14549 AC125232.2-201ENST00000592457 143 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
GBX1Q14549 MIR1302-2-201ENST00000607096 138 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
GBX1Q14549 AL606534.2-204ENST00000635008 178 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
GBX1Q14549 AC080100.1-201ENST00000624239 5356 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
GBX1Q14549 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
GBX1Q14549 ZMYM1-203ENST00000373330 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
GBX1Q14549 XRCC4-202ENST00000338635 1579 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
GBX1Q14549 Y_RNA.526-201ENST00000384572 110 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
GBX1Q14549 LINC01509-202ENST00000423523 408 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
GBX1Q14549 AC105272.1-201ENST00000438604 198 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
GBX1Q14549 AL109933.2-201ENST00000452651 260 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
GBX1Q14549 HMGN2P9-201ENST00000476875 229 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
GBX1Q14549 CFAP100-207ENST00000510833 481 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
GBX1Q14549 RN7SKP132-201ENST00000516001 208 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
GBX1Q14549 RNU2-34P-201ENST00000516534 121 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
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GBX1Q14549 AL137790.1-201ENST00000634283 177 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
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GBX1Q14549 MARCH7-203ENST00000409591 2147 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
GBX1Q14549 MACC1-202ENST00000400331 9159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
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GBX1Q14549 ZNF271P-202ENST00000465539 1970 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
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GBX1Q14549 RNU4-76P-201ENST00000364509 141 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
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GBX1Q14549 SNORA25.10-201ENST00000515926 124 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
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GBX1Q14549 LINC02555-201ENST00000563933 1951 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
GBX1Q14549 Y_RNA.394-201ENST00000383942 103 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
GBX1Q14549 SNORD78.2-201ENST00000391076 69 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
GBX1Q14549 SNORD12B-201ENST00000410433 91 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
GBX1Q14549 MCFD2P1-201ENST00000417812 300 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
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