Protein–RNA interactions for Protein: Q14524

SCN5A, Sodium channel protein type 5 subunit alpha, humanhuman

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Length 2,016 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN5AQ14524 AC074117.2-201ENST00000417130 397 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SCN5AQ14524 AL591043.1-201ENST00000432461 424 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SCN5AQ14524 LINC02501-201ENST00000510420 426 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
SCN5AQ14524 RNU6-1012P-201ENST00000516606 109 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SCN5AQ14524 HMGN2P15-201ENST00000585707 270 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SCN5AQ14524 AC091564.4-201ENST00000533934 2194 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SCN5AQ14524 APC-201ENST00000257430 10701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
SCN5AQ14524 RNU1-76P-201ENST00000362903 159 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SCN5AQ14524 RNU6-1159P-201ENST00000362933 107 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SCN5AQ14524 RNU6-884P-201ENST00000363889 107 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SCN5AQ14524 RNU6-1280P-201ENST00000365211 107 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SCN5AQ14524 SNORD78.2-201ENST00000391076 69 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SCN5AQ14524 RNU1-101P-201ENST00000391171 127 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SCN5AQ14524 RNU2-64P-201ENST00000411315 191 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SCN5AQ14524 AL139397.1-201ENST00000430456 644 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
SCN5AQ14524 MTND5P15-201ENST00000434246 349 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SCN5AQ14524 LINC01399-202ENST00000458450 244 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SCN5AQ14524 RPL30P5-201ENST00000494923 336 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SCN5AQ14524 SNORA43.2-201ENST00000516652 128 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SCN5AQ14524 AP004607.1-201ENST00000524456 203 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SCN5AQ14524 AC005696.2-201ENST00000610120 626 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
SCN5AQ14524 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SCN5AQ14524 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
SCN5AQ14524 AC110491.1-201ENST00000562191 2010 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SCN5AQ14524 Z75746.1-201ENST00000440243 2080 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SCN5AQ14524 IL6ST-205ENST00000381294 2574 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
SCN5AQ14524 MGAT4C-210ENST00000620241 3194 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
SCN5AQ14524 snoU2_19.2-201ENST00000363024 80 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SCN5AQ14524 Y_RNA.143-201ENST00000363520 106 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SCN5AQ14524 SNORD27-201ENST00000363981 72 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SCN5AQ14524 DYNLT3P1-201ENST00000378574 347 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SCN5AQ14524 Y_RNA.539-201ENST00000384635 107 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SCN5AQ14524 SNORA26.7-201ENST00000391288 122 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SCN5AQ14524 MIR548I3-201ENST00000408378 149 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SCN5AQ14524 MIR548I1-201ENST00000408810 149 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SCN5AQ14524 EIF1AXP1-201ENST00000419267 435 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SCN5AQ14524 RPS15AP28-201ENST00000435088 386 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SCN5AQ14524 U8.22-201ENST00000459141 133 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SCN5AQ14524 snoU13.28-201ENST00000459235 104 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SCN5AQ14524 RPS27AP10-201ENST00000496103 208 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SCN5AQ14524 RNU6-1338P-201ENST00000516328 91 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SCN5AQ14524 RN7SKP49-201ENST00000516675 260 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SCN5AQ14524 AC027288.2-201ENST00000553028 243 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SCN5AQ14524 AL136164.4-201ENST00000625013 2135 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SCN5AQ14524 Y_RNA.60-201ENST00000362831 98 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SCN5AQ14524 Y_RNA.288-201ENST00000364854 92 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SCN5AQ14524 LINC02331-201ENST00000418927 602 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
SCN5AQ14524 AC092660.1-201ENST00000420648 371 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
SCN5AQ14524 BPY2DP-201ENST00000422208 265 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SCN5AQ14524 RNU7-87P-201ENST00000459343 62 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SCN5AQ14524 MRPL42P6-201ENST00000486397 371 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SCN5AQ14524 MTND1P19-201ENST00000511780 315 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SCN5AQ14524 LINC02233-201ENST00000513718 358 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
SCN5AQ14524 SNORA31.6-201ENST00000516241 130 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SCN5AQ14524 RNU6-548P-201ENST00000517083 115 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SCN5AQ14524 AC109329.1-201ENST00000518744 317 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SCN5AQ14524 AC007375.1-201ENST00000554513 578 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SCN5AQ14524 MIR5701-3-201ENST00000578890 82 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SCN5AQ14524 MIR5701-1-201ENST00000585138 82 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SCN5AQ14524 MIR5701-2-201ENST00000615634 82 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SCN5AQ14524 ADAM3A-203ENST00000461344 2157 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SCN5AQ14524 FAM35CP-201ENST00000554755 2470 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SCN5AQ14524 DNAH7-201ENST00000312428 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
SCN5AQ14524 MIR21-201ENST00000362134 72 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SCN5AQ14524 RNU6-622P-201ENST00000384272 103 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SCN5AQ14524 SNORD115-46-201ENST00000390982 71 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SCN5AQ14524 Y_RNA.581-201ENST00000391017 97 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SCN5AQ14524 EIF1P2-201ENST00000428233 350 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SCN5AQ14524 WARS2P1-201ENST00000429678 537 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SCN5AQ14524 RPS15AP7-201ENST00000439294 405 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SCN5AQ14524 RPL39P38-201ENST00000467018 153 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SCN5AQ14524 RPL30P1-201ENST00000488676 339 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SCN5AQ14524 PPP2R2B-IT1-201ENST00000505921 447 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
SCN5AQ14524 AC105137.2-201ENST00000569073 466 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SCN5AQ14524 AC009779.6-201ENST00000603972 165 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SCN5AQ14524 AL450472.1-202ENST00000637286 180 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SCN5AQ14524 TSGA10-205ENST00000410001 3036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
SCN5AQ14524 LINC01684-201ENST00000415182 2176 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
SCN5AQ14524 RNU6-1301P-201ENST00000362724 104 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SCN5AQ14524 MIR544A-201ENST00000384855 91 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SCN5AQ14524 FBXO11-201ENST00000402508 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
SCN5AQ14524 RNU6-1132P-201ENST00000459214 107 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SCN5AQ14524 AC073901.1-201ENST00000462471 408 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SCN5AQ14524 AC110009.1-201ENST00000512965 451 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
SCN5AQ14524 RNU6-826P-201ENST00000516827 104 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SCN5AQ14524 SCARNA24.2-201ENST00000516968 130 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SCN5AQ14524 AC012413.1-201ENST00000521294 519 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
SCN5AQ14524 POC1B-211ENST00000549504 581 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
SCN5AQ14524 AC073410.2-201ENST00000603240 332 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SCN5AQ14524 AC067747.1-201ENST00000608026 250 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SCN5AQ14524 LINC01206-214ENST00000610910 456 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
SCN5AQ14524 AL109837.2-201ENST00000632608 295 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
SCN5AQ14524 CATSPERB-201ENST00000256343 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
SCN5AQ14524 HAUS6P2-201ENST00000433254 2404 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SCN5AQ14524 Y_RNA.105-201ENST00000363182 111 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SCN5AQ14524 RNU6-1141P-201ENST00000364520 107 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SCN5AQ14524 Y_RNA.274-201ENST00000364714 101 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SCN5AQ14524 SNORA67.3-201ENST00000384366 140 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SCN5AQ14524 MIR221-201ENST00000385135 110 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SCN5AQ14524 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC2.4□□□□□ -2.03
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