Protein–RNA interactions for Protein: Q14498

RBM39, RNA-binding protein 39, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39Q14498 HNRNPDLP4-201ENST00000605144 301 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
RBM39Q14498 AC011476.5-201ENST00000615594 130 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
RBM39Q14498 SCARNA4-201ENST00000629045 128 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
RBM39Q14498 ZNF804A-202ENST00000613975 3986 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
RBM39Q14498 ZNF271P-202ENST00000465539 1970 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
RBM39Q14498 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
RBM39Q14498 AL391987.6-201ENST00000305671 199 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RBM39Q14498 SNORD114-19-201ENST00000363072 75 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RBM39Q14498 SNORD32A-201ENST00000364805 84 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RBM39Q14498 RNU6-1180P-201ENST00000364935 107 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RBM39Q14498 RNU6-1286P-201ENST00000383871 107 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RBM39Q14498 RNU6-17P-201ENST00000384245 107 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RBM39Q14498 RNU6-18P-201ENST00000384527 107 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RBM39Q14498 SNORA44-201ENST00000384584 132 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RBM39Q14498 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.29□□□□□ -2.04
RBM39Q14498 UBA52P6-201ENST00000399822 382 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RBM39Q14498 AL079342.1-201ENST00000401460 267 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RBM39Q14498 MIR548I3-201ENST00000408378 149 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RBM39Q14498 U6atac.2-201ENST00000408644 118 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RBM39Q14498 MIR548I1-201ENST00000408810 149 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RBM39Q14498 RNU2-64P-201ENST00000411315 191 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RBM39Q14498 AC096920.1-201ENST00000423991 241 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RBM39Q14498 RPL30P4-201ENST00000429309 333 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RBM39Q14498 AC080013.2-201ENST00000460866 323 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RBM39Q14498 AC112771.1-201ENST00000463581 102 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RBM39Q14498 SNRPGP7-201ENST00000469016 106 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RBM39Q14498 MIR2355-201ENST00000517199 87 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RBM39Q14498 RN7SKP40-201ENST00000517211 242 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RBM39Q14498 DEFB108E-201ENST00000524692 240 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RBM39Q14498 AL356280.1-201ENST00000603614 379 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RBM39Q14498 AC005000.2-201ENST00000605468 310 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RBM39Q14498 AC093732.2-201ENST00000607950 274 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RBM39Q14498 DLX6-AS1_2.1-201ENST00000613701 207 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RBM39Q14498 CENPF-206ENST00000614578 528 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
RBM39Q14498 AC240442.1-201ENST00000616055 283 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RBM39Q14498 PRPSAP2-229ENST00000628609 192 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
RBM39Q14498 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RBM39Q14498 LINC02555-201ENST00000563933 1951 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RBM39Q14498 SLC6A15-202ENST00000309283 3108 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
RBM39Q14498 SLCO1B3-201ENST00000261196 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
RBM39Q14498 MDM2-206ENST00000350057 1401 ntTSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
RBM39Q14498 APCS-201ENST00000255040 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
RBM39Q14498 Y_RNA.16-201ENST00000362421 102 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RBM39Q14498 Y_RNA.20-201ENST00000362479 113 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RBM39Q14498 DEFB119-202ENST00000376315 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
RBM39Q14498 Y_RNA.416-201ENST00000384014 113 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RBM39Q14498 RNU6-926P-201ENST00000384075 107 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RBM39Q14498 SNORA18.3-201ENST00000384122 132 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RBM39Q14498 SNORA29-201ENST00000384183 140 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RBM39Q14498 SNORA9-201ENST00000384215 133 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RBM39Q14498 Y_RNA.478-201ENST00000384358 107 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RBM39Q14498 Y_RNA.539-201ENST00000384635 107 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RBM39Q14498 RNU6-1140P-201ENST00000410517 106 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RBM39Q14498 RNU6-1245P-201ENST00000411130 106 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RBM39Q14498 Z92545.1-201ENST00000411782 234 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RBM39Q14498 AFDN-AS1-202ENST00000417244 182 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
RBM39Q14498 AC087499.2-201ENST00000432861 149 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RBM39Q14498 RAB6C-AS1-202ENST00000433431 123 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RBM39Q14498 AL445687.1-201ENST00000439946 251 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RBM39Q14498 AC087477.1-201ENST00000465747 340 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RBM39Q14498 S100A11P2-201ENST00000467589 312 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RBM39Q14498 LINC02233-201ENST00000513718 358 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
RBM39Q14498 RNU6-138P-201ENST00000515952 107 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RBM39Q14498 VTRNA2-2P-201ENST00000516091 103 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RBM39Q14498 RNU6-1012P-201ENST00000516606 109 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RBM39Q14498 MIR4659A-201ENST00000580269 81 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RBM39Q14498 MIR3199-1-201ENST00000582434 88 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RBM39Q14498 MIR3117-201ENST00000584034 78 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RBM39Q14498 Y_RNA.772-201ENST00000606692 102 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RBM39Q14498 AC006386.2-201ENST00000624491 75 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RBM39Q14498 AC012005.1-201ENST00000624575 75 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RBM39Q14498 SNORA43.4-201ENST00000629559 138 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RBM39Q14498 RRAS2-211ENST00000537760 2034 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
RBM39Q14498 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
RBM39Q14498 EYS-211ENST00000503581 10589 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.05
RBM39Q14498 ZBTB26-202ENST00000373656 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.05
RBM39Q14498 LINC01684-201ENST00000415182 2176 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
RBM39Q14498 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
RBM39Q14498 MIR335-201ENST00000362173 94 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RBM39Q14498 RNU6-338P-201ENST00000383888 105 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RBM39Q14498 RNU6-209P-201ENST00000384118 107 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RBM39Q14498 RNU6-937P-201ENST00000384325 106 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RBM39Q14498 SNORD78.2-201ENST00000391076 69 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RBM39Q14498 MIR548H3-201ENST00000408771 118 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RBM39Q14498 Y_RNA.602-201ENST00000410535 92 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RBM39Q14498 AC138623.1-201ENST00000418060 216 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RBM39Q14498 EIF1AXP1-201ENST00000419267 435 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RBM39Q14498 AL590135.1-201ENST00000422215 156 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RBM39Q14498 COTL1P1-201ENST00000422309 375 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RBM39Q14498 MAGEA8-AS1-201ENST00000427671 476 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
RBM39Q14498 AL139132.1-201ENST00000431587 344 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RBM39Q14498 AL139109.1-201ENST00000455491 297 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RBM39Q14498 AP000870.1-201ENST00000472927 406 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RBM39Q14498 SRIP1-201ENST00000489235 288 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RBM39Q14498 AC116563.1-201ENST00000505454 396 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
RBM39Q14498 AC023141.11-201ENST00000508864 202 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RBM39Q14498 RNU6-1338P-201ENST00000516328 91 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RBM39Q14498 AC068992.1-202ENST00000519280 270 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
RBM39Q14498 AC007347.1-201ENST00000563879 281 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
RBM39Q14498 AC105137.2-201ENST00000569073 466 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 163.6 ms