Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 AC022336.2-201ENST00000568966 2538 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
COL9A3Q14050 UBE3A-202ENST00000397954 2873 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
COL9A3Q14050 Y_RNA.243-201ENST00000364481 109 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
COL9A3Q14050 Y_RNA.294-201ENST00000364916 102 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
COL9A3Q14050 AL359195.1-201ENST00000416657 339 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
COL9A3Q14050 AL158147.1-201ENST00000443970 75 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
COL9A3Q14050 AC093663.1-201ENST00000497190 394 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
COL9A3Q14050 SNORA70.12-201ENST00000516084 153 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
COL9A3Q14050 RNU6-1061P-201ENST00000516530 99 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
COL9A3Q14050 SNORA31.16-201ENST00000516773 139 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
COL9A3Q14050 SCARNA20.6-201ENST00000517251 106 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
COL9A3Q14050 RNU6-537P-201ENST00000517277 103 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
COL9A3Q14050 AC099793.1-201ENST00000567538 285 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
COL9A3Q14050 AC104564.2-201ENST00000581240 270 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
COL9A3Q14050 OR51A7-202ENST00000641490 2186 ntAPPRIS P1 BASIC4.01□□□□□ -1.77
COL9A3Q14050 SUGT1-201ENST00000310528 14131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
COL9A3Q14050 KRR1-201ENST00000229214 10118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
COL9A3Q14050 BCLAF1-205ENST00000527536 5371 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
COL9A3Q14050 PTAR1-202ENST00000377200 9876 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
COL9A3Q14050 SLC30A6-203ENST00000379343 2354 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
COL9A3Q14050 ABCC9-201ENST00000261200 8293 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
COL9A3Q14050 CACNB4-257ENST00000637547 7658 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
COL9A3Q14050 DNAH12-202ENST00000351747 9542 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
COL9A3Q14050 RBBP6-203ENST00000381039 3384 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
COL9A3Q14050 ZNF99-202ENST00000596209 7817 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
COL9A3Q14050 U8.7-201ENST00000364940 136 ntBASIC4□□□□□ -1.77
COL9A3Q14050 Y_RNA.310-201ENST00000365063 113 ntBASIC4□□□□□ -1.77
COL9A3Q14050 RNU6-217P-201ENST00000384164 104 ntBASIC4□□□□□ -1.77
COL9A3Q14050 MIR184-201ENST00000384962 84 ntBASIC4□□□□□ -1.77
COL9A3Q14050 EI24P2-201ENST00000397776 1076 ntBASIC4□□□□□ -1.77
COL9A3Q14050 AC099548.1-201ENST00000421443 426 ntBASIC4□□□□□ -1.77
COL9A3Q14050 AC018495.1-201ENST00000440266 452 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
COL9A3Q14050 AL031737.1-201ENST00000450125 223 ntBASIC4□□□□□ -1.77
COL9A3Q14050 AC092162.2-204ENST00000451851 566 ntTSL 4 BASIC4□□□□□ -1.77
COL9A3Q14050 RNU2-27P-201ENST00000516185 142 ntBASIC4□□□□□ -1.77
COL9A3Q14050 SNORD33.1-201ENST00000516213 88 ntBASIC4□□□□□ -1.77
COL9A3Q14050 AC009623.2-201ENST00000522524 465 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
COL9A3Q14050 MIR3923-201ENST00000579521 83 ntBASIC4□□□□□ -1.77
COL9A3Q14050 SNRPGP15-201ENST00000600149 222 ntBASIC4□□□□□ -1.77
COL9A3Q14050 SNORD11B-201ENST00000607707 90 ntBASIC4□□□□□ -1.77
COL9A3Q14050 MIR6715A-201ENST00000615929 79 ntBASIC4□□□□□ -1.77
COL9A3Q14050 VPS13C-202ENST00000261517 13400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
COL9A3Q14050 PCDH11X-205ENST00000373094 9179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
COL9A3Q14050 SLC2A2-201ENST00000314251 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
COL9A3Q14050 AC002543.1-201ENST00000299783 1954 ntBASIC4□□□□□ -1.77
COL9A3Q14050 DDX60L-207ENST00000505890 4568 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
COL9A3Q14050 ABCG2-204ENST00000515655 4276 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
COL9A3Q14050 Y_RNA.116-201ENST00000363292 103 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
COL9A3Q14050 RNY1P11-201ENST00000363759 113 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
COL9A3Q14050 RNU6-487P-201ENST00000365430 104 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
COL9A3Q14050 RNY4P30-201ENST00000410216 95 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
COL9A3Q14050 NDUFS5P4-201ENST00000412983 318 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
COL9A3Q14050 AL365496.1-201ENST00000426885 215 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
COL9A3Q14050 AC017083.1-201ENST00000428093 483 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
COL9A3Q14050 AC005300.1-201ENST00000428401 373 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
COL9A3Q14050 TOMM22P2-201ENST00000430735 237 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
COL9A3Q14050 Z75741.1-201ENST00000446793 314 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
COL9A3Q14050 HMGB1P22-201ENST00000505315 124 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
COL9A3Q14050 Y_RNA.677-201ENST00000516401 85 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
COL9A3Q14050 PPP1R12A-204ENST00000546369 2977 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
COL9A3Q14050 AL121890.5-201ENST00000620848 304 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
COL9A3Q14050 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
COL9A3Q14050 MIR6715B-201ENST00000637172 77 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
COL9A3Q14050 PKN2-AS1-202ENST00000458097 3542 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
COL9A3Q14050 LINC01938-201ENST00000521341 1864 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
COL9A3Q14050 TNPO1P3-201ENST00000436471 2662 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
COL9A3Q14050 TOPORSLP1-203ENST00000493279 2871 ntTSL 4 BASIC3.98□□□□□ -1.77
COL9A3Q14050 ZNF804A-202ENST00000613975 3986 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
COL9A3Q14050 RNU6-1082P-201ENST00000364574 107 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
COL9A3Q14050 AC115115.1-201ENST00000449927 248 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
COL9A3Q14050 AC103975.1-201ENST00000482506 483 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
COL9A3Q14050 RNU6-344P-201ENST00000516635 111 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
COL9A3Q14050 MIR378D2-201ENST00000580636 98 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
COL9A3Q14050 AC090897.2-201ENST00000581715 130 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
COL9A3Q14050 MSMB-202ENST00000582163 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
COL9A3Q14050 AL137843.1-201ENST00000605078 385 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
COL9A3Q14050 SNORD98-201ENST00000636377 67 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
COL9A3Q14050 SLC30A6-204ENST00000406369 4589 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
COL9A3Q14050 ZCCHC10-201ENST00000324170 2178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
COL9A3Q14050 AC138915.1-201ENST00000565427 1685 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
COL9A3Q14050 ARID2-205ENST00000444670 7316 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
COL9A3Q14050 AC058791.1-201ENST00000608412 3198 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
COL9A3Q14050 RPAP2-203ENST00000610020 16993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
COL9A3Q14050 Y_RNA.35-201ENST00000362601 101 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
COL9A3Q14050 Y_RNA.120-201ENST00000363304 110 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
COL9A3Q14050 RNU6-1197P-201ENST00000391183 107 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
COL9A3Q14050 MIR1289-1-201ENST00000408836 144 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
COL9A3Q14050 RNA5SP229-201ENST00000410809 99 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
COL9A3Q14050 LINC02559-201ENST00000420391 188 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
COL9A3Q14050 AL138900.1-201ENST00000449345 399 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
COL9A3Q14050 AL392086.1-201ENST00000457632 299 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
COL9A3Q14050 AC010401.1-201ENST00000463867 348 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
COL9A3Q14050 RPL32P34-201ENST00000486380 400 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
COL9A3Q14050 RPL30P5-201ENST00000494923 336 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
COL9A3Q14050 AC025281.1-201ENST00000567026 265 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
COL9A3Q14050 MIR4425-201ENST00000580572 84 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
COL9A3Q14050 AL451007.1-201ENST00000595491 289 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
COL9A3Q14050 AC012640.5-201ENST00000623897 319 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
COL9A3Q14050 AC068205.3-201ENST00000636385 468 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
COL9A3Q14050 OR4M1-202ENST00000641200 3493 ntAPPRIS P1 BASIC3.97□□□□□ -1.77
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