Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 AC027288.2-201ENST00000553028 243 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 AC020891.3-201ENST00000560011 363 ntTSL 3 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 AC022523.2-201ENST00000561045 150 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 AC011195.1-201ENST00000578177 177 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 MIR3923-201ENST00000579521 83 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 AL606834.3-201ENST00000602615 496 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 AC018889.1-201ENST00000605372 397 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 AC012467.1-201ENST00000607740 256 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 AC092574.1-201ENST00000609771 420 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 AC122133.1-201ENST00000613964 233 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 AC090517.2-201ENST00000614966 680 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 TCL6_2.1-201ENST00000615162 119 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 AL031667.3-201ENST00000620124 655 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 AC093875.1-201ENST00000623688 504 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 BX322639.1-202ENST00000423987 2213 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 MIRLET7C-201ENST00000362160 84 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 RNU6-212P-201ENST00000362642 104 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 RNA5SP264-201ENST00000363115 107 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 SNORD114-31-201ENST00000363219 75 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 Y_RNA.311-201ENST00000365068 96 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 RNU6-1031P-201ENST00000384773 107 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 MIR660-201ENST00000385235 97 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 SNORD105-201ENST00000386910 85 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 SNAP23-203ENST00000397138 477 ntTSL 1 (best) BASIC-0.04□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 RNA5SP95-201ENST00000410319 137 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 AC004866.1-201ENST00000411748 78 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 AC123900.1-201ENST00000420390 96 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 ZNF736P7Y-201ENST00000425158 820 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 TIMM9P3-201ENST00000428659 274 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 HSFY7P-201ENST00000432672 318 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 AL353997.1-201ENST00000432936 108 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 HSFY8P-201ENST00000437934 318 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 AC092802.2-202ENST00000444665 371 ntTSL 5 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 AC022364.2-201ENST00000457963 554 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 RPS23P5-201ENST00000495419 428 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 VCAN-AS1-201ENST00000512090 424 ntTSL 3 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 AC008700.1-202ENST00000513657 468 ntTSL 5 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 RNA5SP216-201ENST00000516111 123 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 LINC02155-201ENST00000519215 407 ntTSL 5 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 AK6P2-201ENST00000549020 471 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 AC090049.2-201ENST00000550377 109 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 MIR5006-201ENST00000583027 110 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 RAC1P9-201ENST00000604990 392 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 Z99289.3-201ENST00000605586 594 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 AL355512.1-202ENST00000607952 209 ntTSL 5 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 AL356094.1-201ENST00000624663 1212 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 AC092813.1-201ENST00000635455 969 ntTSL 5 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 U6.108-201ENST00000637764 58 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 AC132825.7-201ENST00000638744 335 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 MIR411-201ENST00000362239 96 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 U3.9-201ENST00000363823 204 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 RNU6-417P-201ENST00000384712 107 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 MIR578-201ENST00000384828 96 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 EEF1A1P40-201ENST00000412883 573 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 AC003985.1-201ENST00000414127 362 ntTSL 3 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 SNX3P1X-201ENST00000414887 175 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 UBE2D3P3-201ENST00000426992 425 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 AC073910.1-201ENST00000445047 438 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 U7.7-201ENST00000459276 60 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 AL049829.1-201ENST00000465411 156 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 AC091021.1-201ENST00000468051 388 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 SUMO2P5-201ENST00000506790 245 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 AL136537.1-201ENST00000508199 538 ntTSL 3 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 RNU1-86P-201ENST00000516108 154 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 RNU1-107P-201ENST00000516617 154 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 AF235103.2-201ENST00000525753 346 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 AC079917.1-202ENST00000534059 625 ntTSL 3 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 AC023796.2-201ENST00000545410 451 ntTSL 3 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 AC104072.1-201ENST00000568817 668 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 AC092104.1-201ENST00000497346 1441 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 SNORA80D-201ENST00000384488 135 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 RNU6-125P-201ENST00000384505 107 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 RNU6-331P-201ENST00000384724 107 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 MIR891A-201ENST00000401237 79 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 MTCYBP2-201ENST00000407745 171 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 RNU6ATAC33P-201ENST00000408647 126 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 MIR548H2-201ENST00000408874 88 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 RNU2-8P-201ENST00000410727 190 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 RNU2-62P-201ENST00000410868 191 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 RNU6-575P-201ENST00000411326 105 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 RNU6-1304P-201ENST00000411374 106 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 AL391704.1-203ENST00000414903 462 ntTSL 3 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 AL158050.1-201ENST00000416077 457 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 AC006366.1-201ENST00000422002 759 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 AL356583.2-201ENST00000426536 280 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 SEPT7P4-201ENST00000437076 306 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 MTCO3P43-201ENST00000440974 771 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 AL357793.2-201ENST00000447056 850 ntTSL 3 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 ZNF736P5Y-201ENST00000451173 805 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 CCDC39-AS1-201ENST00000495357 283 ntTSL 3 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 Y_RNA.660-201ENST00000516002 120 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 RNU6-1098P-201ENST00000516772 96 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 LINC02267-202ENST00000522173 799 ntTSL 3 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 AC138869.1-201ENST00000568623 124 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 AC091588.1-201ENST00000578504 359 ntTSL 3 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 MIR4764-201ENST00000580680 88 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 AC004223.2-201ENST00000590309 544 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 AL162424.1-201ENST00000602325 221 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
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