Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
ALCAMQ13740 Y_RNA.72-201ENST00000362894 103 ntBASIC2□□□□□ -2.09
ALCAMQ13740 AL356776.1-201ENST00000406574 447 ntBASIC2□□□□□ -2.09
ALCAMQ13740 RNA5SP489-201ENST00000410986 109 ntBASIC2□□□□□ -2.09
ALCAMQ13740 RNA5SP501-201ENST00000410990 112 ntBASIC2□□□□□ -2.09
ALCAMQ13740 AC091976.1-202ENST00000509211 630 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
ALCAMQ13740 Y_RNA.682-201ENST00000516457 100 ntBASIC2□□□□□ -2.09
ALCAMQ13740 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC2□□□□□ -2.09
ALCAMQ13740 AC084816.1-207ENST00000538317 584 ntTSL 4 BASIC2□□□□□ -2.09
ALCAMQ13740 AC126323.6-201ENST00000561701 451 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
ALCAMQ13740 AC011939.2-201ENST00000567396 428 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
ALCAMQ13740 MIR4742-201ENST00000581069 85 ntBASIC2□□□□□ -2.09
ALCAMQ13740 MIR4448-201ENST00000584360 86 ntBASIC2□□□□□ -2.09
ALCAMQ13740 AL627230.6-201ENST00000611129 280 ntBASIC2□□□□□ -2.09
ALCAMQ13740 KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 116 ntBASIC2□□□□□ -2.09
ALCAMQ13740 CYLC2-204ENST00000612124 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
ALCAMQ13740 RNU6-545P-201ENST00000362681 104 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ALCAMQ13740 MIR32-201ENST00000384965 70 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ALCAMQ13740 MIR549A-201ENST00000385268 96 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ALCAMQ13740 U8.13-201ENST00000390842 128 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ALCAMQ13740 RNA5SP212-201ENST00000391223 107 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ALCAMQ13740 RNU2-40P-201ENST00000410833 196 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ALCAMQ13740 MTND3P8-201ENST00000412909 339 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ALCAMQ13740 RPL30P16-201ENST00000419341 429 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ALCAMQ13740 AC015983.2-201ENST00000446053 472 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
ALCAMQ13740 snoU13.15-201ENST00000459407 104 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ALCAMQ13740 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ALCAMQ13740 LEKR1-205ENST00000477399 621 ntTSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
ALCAMQ13740 AC069528.1-201ENST00000490344 705 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
ALCAMQ13740 HMSD-204ENST00000526932 162 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
ALCAMQ13740 ACTG1P17-203ENST00000561222 537 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
ALCAMQ13740 MIR4299-201ENST00000577899 72 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ALCAMQ13740 MIR4753-201ENST00000585119 83 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ALCAMQ13740 AL109918.3-201ENST00000603072 338 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ALCAMQ13740 AC098657.3-201ENST00000620434 263 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ALCAMQ13740 MPP6-209ENST00000625307 126 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
ALCAMQ13740 VPS13A-206ENST00000376646 2262 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
ALCAMQ13740 KPNA2P1-201ENST00000458289 1591 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ALCAMQ13740 CBX3P1-201ENST00000325243 554 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ALCAMQ13740 SNORD115-32-201ENST00000364079 82 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ALCAMQ13740 RNU6-596P-201ENST00000365395 98 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ALCAMQ13740 U8.10-201ENST00000384260 133 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ALCAMQ13740 SNORA8-201ENST00000384574 139 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ALCAMQ13740 PLCL2-AS1-201ENST00000414844 311 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
ALCAMQ13740 AC244636.1-201ENST00000421152 228 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ALCAMQ13740 MTCO3P46-201ENST00000425787 232 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ALCAMQ13740 AC009237.7-201ENST00000447357 229 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ALCAMQ13740 MTCO3P8-201ENST00000453691 755 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ALCAMQ13740 FO393415.2-201ENST00000480085 343 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ALCAMQ13740 RN7SL274P-201ENST00000492268 272 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ALCAMQ13740 AC008852.1-201ENST00000510198 451 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
ALCAMQ13740 RNU6-1198P-201ENST00000516904 67 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ALCAMQ13740 RNA5SP54-201ENST00000516951 92 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ALCAMQ13740 AC012435.2-201ENST00000562869 361 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
ALCAMQ13740 AC002558.3-201ENST00000574021 401 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
ALCAMQ13740 AC010928.2-201ENST00000588017 287 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ALCAMQ13740 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ALCAMQ13740 GS1-279B7.1-204ENST00000641809 378 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ALCAMQ13740 BX322639.1-202ENST00000423987 2213 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ALCAMQ13740 TEX15-203ENST00000638951 11341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
ALCAMQ13740 ZNF204P-201ENST00000416749 2397 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ALCAMQ13740 MIR340-201ENST00000362125 95 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ALCAMQ13740 Y_RNA.248-201ENST00000364501 109 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ALCAMQ13740 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ALCAMQ13740 MIR153-2-201ENST00000385225 87 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ALCAMQ13740 SNORA48.1-201ENST00000390879 135 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ALCAMQ13740 MIR1283-1-201ENST00000408494 87 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ALCAMQ13740 MS4A4E-203ENST00000425663 350 ntTSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
ALCAMQ13740 Z82188.1-201ENST00000436709 154 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ALCAMQ13740 EHHADH-202ENST00000440662 656 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
ALCAMQ13740 LINC01077-201ENST00000452288 413 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
ALCAMQ13740 snoU13.30-201ENST00000458951 104 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ALCAMQ13740 MTND5P5-201ENST00000503764 376 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ALCAMQ13740 AC145146.2-202ENST00000508118 326 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
ALCAMQ13740 AC116337.1-201ENST00000509680 687 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ALCAMQ13740 LINC02233-201ENST00000513718 358 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
ALCAMQ13740 AL035078.1-202ENST00000531627 413 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
ALCAMQ13740 AC103794.1-201ENST00000531763 197 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
ALCAMQ13740 AL157911.1-202ENST00000554123 502 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
ALCAMQ13740 5S_rRNA.11-201ENST00000618635 84 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ALCAMQ13740 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
ALCAMQ13740 AL359851.1-201ENST00000569460 4997 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ALCAMQ13740 FAM206A-202ENST00000374624 499 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
ALCAMQ13740 MIR487A-201ENST00000385009 80 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ALCAMQ13740 USP9YP30-201ENST00000430729 455 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ALCAMQ13740 PLCB1-IT1-201ENST00000441231 373 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
ALCAMQ13740 MTCO1P44-201ENST00000441935 243 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ALCAMQ13740 AC010531.2-201ENST00000465012 153 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ALCAMQ13740 MRPS17P9-201ENST00000511924 393 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ALCAMQ13740 AC126768.3-201ENST00000514519 560 ntTSL 4 BASIC1.96□□□□□ -2.1
ALCAMQ13740 SUMO2P18-201ENST00000518873 252 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ALCAMQ13740 RRN3P3-201ENST00000549207 578 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ALCAMQ13740 MIR4419B-201ENST00000577260 68 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ALCAMQ13740 MIR5696-201ENST00000578474 85 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ALCAMQ13740 MIR3618-201ENST00000580330 88 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ALCAMQ13740 uc_338.20-201ENST00000621563 178 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ALCAMQ13740 NCBP1-205ENST00000629069 249 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
ALCAMQ13740 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
ALCAMQ13740 CASC19-280ENST00000642102 1351 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ALCAMQ13740 CGGBP1-202ENST00000398392 5298 ntAPPRIS P1 BASIC1.95□□□□□ -2.1
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