Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 AC010928.2-201ENST00000588017 287 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CDH18Q13634 AC005014.2-201ENST00000607795 599 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CDH18Q13634 AL589935.1-202ENST00000612512 393 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
CDH18Q13634 AC138058.1-201ENST00000620572 449 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
CDH18Q13634 ZNF355P-201ENST00000427301 3216 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CDH18Q13634 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC2.01□□□□□ -2.09
CDH18Q13634 ZNF299P-201ENST00000406845 1804 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CDH18Q13634 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
CDH18Q13634 CCDC30-201ENST00000340612 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
CDH18Q13634 RNU6-595P-201ENST00000363944 107 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CDH18Q13634 U8.10-201ENST00000384260 133 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CDH18Q13634 RNU6-1297P-201ENST00000384415 104 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CDH18Q13634 RNU6-310P-201ENST00000384655 107 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CDH18Q13634 MIR583-201ENST00000384846 75 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CDH18Q13634 MIR208B-201ENST00000401172 77 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CDH18Q13634 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CDH18Q13634 Y_RNA.646-201ENST00000410980 101 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CDH18Q13634 RPS26P42-201ENST00000413485 326 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CDH18Q13634 AL445685.2-201ENST00000422551 342 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CDH18Q13634 USMG5P1-201ENST00000425964 177 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CDH18Q13634 AL137159.1-201ENST00000452808 512 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CDH18Q13634 AC022445.1-201ENST00000457499 408 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
CDH18Q13634 Y_RNA.632-201ENST00000459189 102 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CDH18Q13634 SCARNA16.2-201ENST00000516520 172 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CDH18Q13634 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CDH18Q13634 AC022202.1-201ENST00000613515 211 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CDH18Q13634 PISRT1.1-201ENST00000616930 107 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CDH18Q13634 MTND4LP32-201ENST00000636111 270 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CDH18Q13634 KNL1-204ENST00000527044 5404 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
CDH18Q13634 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
CDH18Q13634 CYLC1-201ENST00000329312 2106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
CDH18Q13634 ZNF644-212ENST00000621077 2056 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
CDH18Q13634 AL356292.1-201ENST00000283110 373 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CDH18Q13634 Y_RNA.67-201ENST00000362870 100 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CDH18Q13634 MIR487A-201ENST00000385009 80 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CDH18Q13634 MT-TD-201ENST00000387419 68 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CDH18Q13634 HMGN2P39-201ENST00000398005 273 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CDH18Q13634 RPL23AP7-203ENST00000449021 469 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CDH18Q13634 OR2AQ1P-201ENST00000451972 200 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CDH18Q13634 RPL30P10-201ENST00000488148 337 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CDH18Q13634 AC084816.1-207ENST00000538317 584 ntTSL 4 BASIC1.99□□□□□ -2.09
CDH18Q13634 EIF4A1P12-201ENST00000551910 141 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CDH18Q13634 PWRN1-203ENST00000564898 389 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
CDH18Q13634 AC022035.1-201ENST00000579923 302 ntTSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
CDH18Q13634 MIR4795-201ENST00000584182 89 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CDH18Q13634 AL031274.2-201ENST00000599419 203 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CDH18Q13634 MESTIT1_1.1-201ENST00000618871 140 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CDH18Q13634 AL359697.1-201ENST00000624879 587 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CDH18Q13634 Clostridiales-1.3-201ENST00000637703 147 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CDH18Q13634 CCDC148-202ENST00000409187 2523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
CDH18Q13634 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
CDH18Q13634 E2F5-208ENST00000521429 1551 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
CDH18Q13634 Y_RNA.58-201ENST00000362807 102 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CDH18Q13634 Y_RNA.154-201ENST00000363624 102 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CDH18Q13634 U3.9-201ENST00000363823 204 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CDH18Q13634 RNU4-9P-201ENST00000364951 139 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CDH18Q13634 RNY3P1-201ENST00000365085 102 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CDH18Q13634 RNY3-201ENST00000365484 102 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CDH18Q13634 Y_RNA.384-201ENST00000383909 102 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CDH18Q13634 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CDH18Q13634 Y_RNA.490-201ENST00000384413 102 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CDH18Q13634 SNORA40.19-201ENST00000390846 128 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CDH18Q13634 RNY4P36-201ENST00000391116 96 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
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CDH18Q13634 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CDH18Q13634 AC073325.1-201ENST00000443714 542 ntTSL 4 BASIC1.98□□□□□ -2.09
CDH18Q13634 MTCO3P10-201ENST00000455912 772 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
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CDH18Q13634 AC097473.1-201ENST00000508142 408 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CDH18Q13634 RNU6-965P-201ENST00000516721 96 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CDH18Q13634 Y_RNA.718-201ENST00000517110 102 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CDH18Q13634 AP003123.1-201ENST00000526041 333 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
CDH18Q13634 AC087463.2-201ENST00000565943 472 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
CDH18Q13634 MIR5701-3-201ENST00000578890 82 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CDH18Q13634 MIR5690-201ENST00000583739 73 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CDH18Q13634 MIR5701-1-201ENST00000585138 82 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CDH18Q13634 C8orf59P2-201ENST00000603441 271 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CDH18Q13634 SNRPGP19-201ENST00000603826 189 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CDH18Q13634 MIR5701-2-201ENST00000615634 82 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CDH18Q13634 AL359314.1-201ENST00000616913 261 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CDH18Q13634 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
CDH18Q13634 RNU4-79P-201ENST00000362764 141 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CDH18Q13634 SNORD115-32-201ENST00000364079 82 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CDH18Q13634 RNA5SP138-201ENST00000365098 114 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CDH18Q13634 MTCYBP4-201ENST00000401524 249 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CDH18Q13634 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CDH18Q13634 SRIP3-201ENST00000413200 219 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CDH18Q13634 MTCO3P29-201ENST00000432119 779 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CDH18Q13634 AL132875.2-201ENST00000436418 325 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
CDH18Q13634 LINC01203-202ENST00000456091 476 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
CDH18Q13634 PRELID3BP1-201ENST00000457142 540 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CDH18Q13634 snoU13.30-201ENST00000458951 104 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CDH18Q13634 SNORD19B-201ENST00000459623 84 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CDH18Q13634 AC132942.1-201ENST00000486753 483 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CDH18Q13634 MIR449C-201ENST00000516047 92 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CDH18Q13634 RNU6-295P-201ENST00000516901 104 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CDH18Q13634 RNU2-19P-201ENST00000517288 84 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CDH18Q13634 AC110588.1-201ENST00000559699 137 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CDH18Q13634 AP006219.1-201ENST00000580258 472 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
CDH18Q13634 SMAD5-AS1_4.1-201ENST00000615561 167 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
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