Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 AL353149.1-201ENST00000610667 244 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CUL1Q13616 AC005562.2-201ENST00000618264 111 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CUL1Q13616 ST7-OT4_2.1-201ENST00000619089 172 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CUL1Q13616 PRPSAP2-229ENST00000628609 192 ntTSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
CUL1Q13616 Y_RNA.100-201ENST00000363141 102 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CUL1Q13616 Y_RNA.123-201ENST00000363338 102 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CUL1Q13616 RNU6-968P-201ENST00000384076 107 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CUL1Q13616 NPS-201ENST00000398023 270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
CUL1Q13616 ZNF885P-201ENST00000420174 1098 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CUL1Q13616 AL132875.2-201ENST00000436418 325 ntTSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
CUL1Q13616 OR2AQ1P-201ENST00000451972 200 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CUL1Q13616 LINC01077-201ENST00000452288 413 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
CUL1Q13616 AL160162.1-201ENST00000456715 442 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
CUL1Q13616 RPS29P23-201ENST00000458635 123 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CUL1Q13616 AC010409.1-201ENST00000487382 476 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CUL1Q13616 AF186996.7-201ENST00000492781 209 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CUL1Q13616 MTND1P5-201ENST00000517906 940 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CUL1Q13616 IGHVII-53-1-201ENST00000519538 255 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CUL1Q13616 AC109635.3-201ENST00000529536 185 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CUL1Q13616 AL160236.1-201ENST00000556317 195 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CUL1Q13616 MIR4422-201ENST00000581938 83 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CUL1Q13616 AL645939.4-201ENST00000604495 135 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CUL1Q13616 HTN1-205ENST00000610341 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.47□□□□□ -2.17
CUL1Q13616 TCL6_2.1-201ENST00000615162 119 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CUL1Q13616 AC137590.2-201ENST00000619709 240 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CUL1Q13616 AC007370.2-201ENST00000506899 2694 ntTSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
CUL1Q13616 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC1.46□□□□□ -2.17
CUL1Q13616 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.46□□□□□ -2.17
CUL1Q13616 U8.1-201ENST00000362843 134 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CUL1Q13616 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CUL1Q13616 SNORA18.2-201ENST00000383865 132 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CUL1Q13616 RNU6-1026P-201ENST00000384465 108 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CUL1Q13616 RNU6-296P-201ENST00000384608 107 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CUL1Q13616 MIR758-201ENST00000390227 88 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CUL1Q13616 RNA5SP494-201ENST00000410653 129 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CUL1Q13616 NCOR1P3-201ENST00000420479 303 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CUL1Q13616 AL354695.1-201ENST00000427935 228 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CUL1Q13616 MTCO2P7-201ENST00000446518 666 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CUL1Q13616 AC009237.7-201ENST00000447357 229 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CUL1Q13616 AC087477.1-201ENST00000465747 340 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CUL1Q13616 AC108752.1-201ENST00000484679 576 ntTSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.18
CUL1Q13616 AC063944.1-201ENST00000496943 295 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
CUL1Q13616 AC097473.1-201ENST00000508142 408 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CUL1Q13616 SUMO2P18-201ENST00000518873 252 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CUL1Q13616 AC245505.1-201ENST00000556398 224 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CUL1Q13616 AC016727.2-201ENST00000603988 621 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CUL1Q13616 PRR13P7-201ENST00000605538 430 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CUL1Q13616 AL355512.1-202ENST00000607952 209 ntTSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.18
CUL1Q13616 AL138726.1-201ENST00000614873 333 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CUL1Q13616 Y_RNA.38-201ENST00000362617 102 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CUL1Q13616 Y_RNA.67-201ENST00000362870 100 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CUL1Q13616 RNU1-17P-201ENST00000363022 152 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CUL1Q13616 RNU4-13P-201ENST00000364019 141 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CUL1Q13616 Y_RNA.212-201ENST00000364177 102 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CUL1Q13616 Y_RNA.436-201ENST00000384097 102 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CUL1Q13616 RNU6-933P-201ENST00000384424 107 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CUL1Q13616 SNORA67.6-201ENST00000391093 99 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CUL1Q13616 MIR1283-1-201ENST00000408494 87 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CUL1Q13616 Y_RNA.615-201ENST00000410769 117 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CUL1Q13616 MS4A4E-203ENST00000425663 350 ntTSL 1 (best) BASIC1.45□□□□□ -2.18
CUL1Q13616 SDAD1P3-201ENST00000427380 333 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CUL1Q13616 DLGAP5P1-201ENST00000430307 464 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CUL1Q13616 MTCO3P18-201ENST00000440206 761 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CUL1Q13616 DAP3P1-201ENST00000441522 278 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CUL1Q13616 AC079354.2-201ENST00000453523 154 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CUL1Q13616 RNU6-720P-201ENST00000516363 108 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CUL1Q13616 SNORA31.17-201ENST00000516953 127 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CUL1Q13616 AP005436.2-201ENST00000528458 252 ntTSL 5 BASIC1.45□□□□□ -2.18
CUL1Q13616 MRPS36P4-201ENST00000534436 298 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CUL1Q13616 AC026765.1-201ENST00000547876 435 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
CUL1Q13616 ZNF519P2-201ENST00000557032 169 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CUL1Q13616 TPRKBP2-201ENST00000565969 475 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CUL1Q13616 AP001496.1-201ENST00000579113 471 ntTSL 4 BASIC1.45□□□□□ -2.18
CUL1Q13616 MIR8074-201ENST00000615081 81 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CUL1Q13616 5S_rRNA.11-201ENST00000618635 84 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CUL1Q13616 SCARNA4-201ENST00000629045 128 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CUL1Q13616 BX322639.1-202ENST00000423987 2213 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CUL1Q13616 RNY4P14-201ENST00000363656 96 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CUL1Q13616 SNORD115-8-201ENST00000363856 82 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CUL1Q13616 RNU6-60P-201ENST00000364792 103 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CUL1Q13616 SNORD115-38-201ENST00000365037 82 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CUL1Q13616 Y_RNA.402-201ENST00000383972 102 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CUL1Q13616 RNU6-95P-201ENST00000384697 107 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CUL1Q13616 TRAJ39-201ENST00000390498 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.44□□□□□ -2.18
CUL1Q13616 RNA5SP213-201ENST00000391031 106 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CUL1Q13616 AL117342.1-201ENST00000404861 406 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CUL1Q13616 AL590002.1-201ENST00000406554 418 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CUL1Q13616 RPL30P13-201ENST00000418873 348 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CUL1Q13616 AC099677.2-201ENST00000436385 175 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CUL1Q13616 SIRPG-AS1-201ENST00000437384 410 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
CUL1Q13616 ATP5J2P3-201ENST00000451550 258 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CUL1Q13616 RNU7-187P-201ENST00000458985 68 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CUL1Q13616 AC096733.1-201ENST00000503844 402 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
CUL1Q13616 AC010420.1-201ENST00000515077 509 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
CUL1Q13616 SNORA31.24-201ENST00000517232 57 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CUL1Q13616 AP005530.1-201ENST00000572608 567 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
CUL1Q13616 MIR4303-201ENST00000581299 66 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CUL1Q13616 AF250324.2-201ENST00000608299 610 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CUL1Q13616 RMST_3.1-201ENST00000611651 109 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CUL1Q13616 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.44□□□□□ -2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124.4 ms