Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 AC093423.2-201ENST00000429074 437 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
LSAMPQ13449 AL117339.2-201ENST00000430475 180 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
LSAMPQ13449 LINC00375-201ENST00000433074 601 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
LSAMPQ13449 AC108488.2-201ENST00000438485 421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
LSAMPQ13449 UQCRHP3-201ENST00000451503 251 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
LSAMPQ13449 Y_RNA.637-201ENST00000459424 114 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
LSAMPQ13449 SRIP1-201ENST00000489235 288 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
LSAMPQ13449 AC010457.1-201ENST00000510469 458 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
LSAMPQ13449 CFAP100-207ENST00000510833 481 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
LSAMPQ13449 Y_RNA.662-201ENST00000516028 97 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
LSAMPQ13449 SNORA31.26-201ENST00000517250 137 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
LSAMPQ13449 AC103726.1-201ENST00000520785 474 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
LSAMPQ13449 AC012413.1-201ENST00000521294 519 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
LSAMPQ13449 AC009107.1-201ENST00000561923 330 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
LSAMPQ13449 MIR4308-201ENST00000580634 81 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
LSAMPQ13449 MIR6733-201ENST00000635723 61 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
LSAMPQ13449 U6.115-201ENST00000636045 103 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
LSAMPQ13449 AL034408.1-202ENST00000636088 415 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
LSAMPQ13449 TSLP-202ENST00000379706 2411 ntTSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
LSAMPQ13449 VPS13C-203ENST00000395896 14579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
LSAMPQ13449 MGAT4C-210ENST00000620241 3194 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
LSAMPQ13449 ROS1-202ENST00000368508 7435 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
LSAMPQ13449 PTER-201ENST00000298942 3448 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
LSAMPQ13449 FOXP2-206ENST00000393491 6085 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
LSAMPQ13449 CHD9-203ENST00000447540 11509 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
LSAMPQ13449 ERBIN-201ENST00000284037 8647 ntTSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
LSAMPQ13449 RNU6-944P-201ENST00000364023 107 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
LSAMPQ13449 RNU6-1027P-201ENST00000383998 107 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
LSAMPQ13449 RN7SKP156-201ENST00000410308 342 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
LSAMPQ13449 ATP2B2-IT1-201ENST00000440152 472 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
LSAMPQ13449 RNU7-14P-201ENST00000459331 62 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
LSAMPQ13449 RPL23AP67-201ENST00000465341 474 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
LSAMPQ13449 HMGB3P3-201ENST00000510526 400 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
LSAMPQ13449 RNU6-255P-201ENST00000516957 105 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
LSAMPQ13449 U91328.3-201ENST00000608931 354 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
LSAMPQ13449 TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 157 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
LSAMPQ13449 AC023490.1-201ENST00000614584 375 ntTSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
LSAMPQ13449 RDM1-221ENST00000617591 432 ntTSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
LSAMPQ13449 ZYXP1-201ENST00000617638 118 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
LSAMPQ13449 AC011718.1-201ENST00000622906 375 ntTSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
LSAMPQ13449 MIR7515-201ENST00000637837 67 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
LSAMPQ13449 ZNF626-204ENST00000612591 4404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
LSAMPQ13449 RBBP8-202ENST00000360790 2962 ntTSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
LSAMPQ13449 MS4A14-202ENST00000395001 3401 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
LSAMPQ13449 MME-216ENST00000615825 5523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
LSAMPQ13449 RNF6-201ENST00000346166 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
LSAMPQ13449 DMD-203ENST00000357033 13956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
LSAMPQ13449 AL049781.1-201ENST00000623195 3585 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
LSAMPQ13449 MIR372-201ENST00000362225 67 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
LSAMPQ13449 RNU1-72P-201ENST00000362976 153 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
LSAMPQ13449 RNU6-653P-201ENST00000363074 106 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
LSAMPQ13449 RNU6-801P-201ENST00000364087 105 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
LSAMPQ13449 MIR218-1-201ENST00000384999 110 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
LSAMPQ13449 RNU6-763P-201ENST00000390865 106 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
LSAMPQ13449 RPL30P4-201ENST00000429309 333 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
LSAMPQ13449 RN7SL594P-201ENST00000470590 287 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
LSAMPQ13449 HMGN2P9-201ENST00000476875 229 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
LSAMPQ13449 RN7SKP282-201ENST00000516824 299 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
LSAMPQ13449 RNU6-1212P-201ENST00000517023 104 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
LSAMPQ13449 AL713866.2-201ENST00000603579 219 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
LSAMPQ13449 NRDE2-210ENST00000628832 132 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
LSAMPQ13449 U6.106-201ENST00000636360 105 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
LSAMPQ13449 TNNI3K-201ENST00000326637 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
LSAMPQ13449 ANKRD36BP1-201ENST00000358576 1779 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
LSAMPQ13449 ZNF99-202ENST00000596209 7817 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
LSAMPQ13449 CYSLTR1-203ENST00000614798 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
LSAMPQ13449 AC017071.1-201ENST00000564407 2204 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
LSAMPQ13449 ADGRL2-207ENST00000370723 5254 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
LSAMPQ13449 NEB-204ENST00000409198 20637 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
LSAMPQ13449 RNU6-746P-201ENST00000384112 109 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
LSAMPQ13449 AL357075.1-201ENST00000404107 726 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
LSAMPQ13449 RNU6-628P-201ENST00000410675 107 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
LSAMPQ13449 U8.19-201ENST00000459095 133 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
LSAMPQ13449 LINC01969-201ENST00000514468 455 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
LSAMPQ13449 RNU6-586P-201ENST00000517265 104 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
LSAMPQ13449 AC136628.3-201ENST00000521868 290 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
LSAMPQ13449 AC022695.1-201ENST00000522089 237 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
LSAMPQ13449 AC103794.1-201ENST00000531763 197 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
LSAMPQ13449 CARD18-203ENST00000532895 422 ntTSL 2 BASIC3.11□□□□□ -1.91
LSAMPQ13449 MIR5692C2-201ENST00000577959 77 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
LSAMPQ13449 AC023043.3-201ENST00000593113 385 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
LSAMPQ13449 AL606490.9-201ENST00000603331 271 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
LSAMPQ13449 NR3C1-212ENST00000504572 3389 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
LSAMPQ13449 KTN1-206ENST00000413890 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
LSAMPQ13449 SERPINI2-207ENST00000476257 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
LSAMPQ13449 MUM1L1-203ENST00000372552 3957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
LSAMPQ13449 Y_RNA.240-201ENST00000364469 95 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
LSAMPQ13449 RNA5SP283-201ENST00000365604 119 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
LSAMPQ13449 SNORA40.19-201ENST00000390846 128 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
LSAMPQ13449 AL357139.1-201ENST00000407792 426 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
LSAMPQ13449 MIR1283-1-201ENST00000408494 87 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
LSAMPQ13449 MIR1185-2-201ENST00000408687 86 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
LSAMPQ13449 RNU6-710P-201ENST00000410424 105 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
LSAMPQ13449 MICF-203ENST00000432679 129 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
LSAMPQ13449 AL135790.2-201ENST00000437701 267 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
LSAMPQ13449 RPS12P18-201ENST00000442381 270 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
LSAMPQ13449 RPL39P40-201ENST00000445481 146 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
LSAMPQ13449 AC083906.5-201ENST00000503722 328 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
LSAMPQ13449 TRAPPC2P7-201ENST00000509650 231 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
LSAMPQ13449 RNA5SP164-201ENST00000516533 110 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
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