Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 U91328.3-201ENST00000608931 354 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
AP3B2Q13367 RNVU1-4-201ENST00000612985 164 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
AP3B2Q13367 AC006111.3-201ENST00000622137 383 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
AP3B2Q13367 IL6ST-205ENST00000381294 2574 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
AP3B2Q13367 TUG1-202ENST00000521091 2110 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
AP3B2Q13367 FASTKD1-205ENST00000453929 2791 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
AP3B2Q13367 ZFYVE16-202ENST00000505560 6599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
AP3B2Q13367 SEMG2-201ENST00000372769 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
AP3B2Q13367 SLC9C1-205ENST00000487372 3979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
AP3B2Q13367 AC010889.1-201ENST00000566193 2666 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
AP3B2Q13367 RAPGEF6-210ENST00000512052 3535 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
AP3B2Q13367 CHM-205ENST00000615443 2821 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
AP3B2Q13367 MIR208A-201ENST00000362287 71 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
AP3B2Q13367 RNU4-15P-201ENST00000362613 141 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
AP3B2Q13367 RNU6-1010P-201ENST00000362757 107 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
AP3B2Q13367 Y_RNA.75-201ENST00000362927 97 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
AP3B2Q13367 Y_RNA.121-201ENST00000363309 113 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
AP3B2Q13367 RNU4-84P-201ENST00000364200 139 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
AP3B2Q13367 LINC02337-201ENST00000401043 374 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
AP3B2Q13367 RNU2-51P-201ENST00000410708 197 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
AP3B2Q13367 AC245291.1-201ENST00000419501 328 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
AP3B2Q13367 AIMP1P2-201ENST00000425294 312 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
AP3B2Q13367 AL162725.1-201ENST00000435405 301 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
AP3B2Q13367 AL135790.2-201ENST00000437701 267 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
AP3B2Q13367 AC068580.2-201ENST00000449749 338 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
AP3B2Q13367 RPL23AP70-201ENST00000483361 460 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
AP3B2Q13367 AC145146.1-201ENST00000496370 254 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
AP3B2Q13367 EIF4A1P12-201ENST00000551910 141 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
AP3B2Q13367 IGKV1OR2-6-201ENST00000603485 277 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
AP3B2Q13367 RNU6-91P-201ENST00000607774 107 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
AP3B2Q13367 TCL6_2.1-201ENST00000615162 119 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
AP3B2Q13367 SNHG14-215ENST00000551631 4008 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
AP3B2Q13367 SLC27A2-203ENST00000544960 2025 ntTSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
AP3B2Q13367 AC134026.1-201ENST00000623249 2239 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
AP3B2Q13367 U3.9-201ENST00000363823 204 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
AP3B2Q13367 RNU6-801P-201ENST00000364087 105 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
AP3B2Q13367 RNU6-818P-201ENST00000364837 108 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
AP3B2Q13367 SNORA26.5-201ENST00000391215 123 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
AP3B2Q13367 AL031003.1-201ENST00000404229 172 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
AP3B2Q13367 RNA5SP120-201ENST00000410900 112 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
AP3B2Q13367 AC003988.1-201ENST00000447198 578 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
AP3B2Q13367 RN7SL807P-201ENST00000470923 297 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
AP3B2Q13367 Y_RNA.797-201ENST00000515977 94 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
AP3B2Q13367 SNORD116-25-201ENST00000516517 92 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
AP3B2Q13367 RNU6-344P-201ENST00000516635 111 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
AP3B2Q13367 MIR2276-201ENST00000516886 89 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
AP3B2Q13367 AC090155.2-201ENST00000518854 267 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
AP3B2Q13367 AC010177.1-201ENST00000547819 366 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
AP3B2Q13367 MIR4425-201ENST00000580572 84 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
AP3B2Q13367 MIR8058-201ENST00000615737 89 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
AP3B2Q13367 AC068205.3-201ENST00000636385 468 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
AP3B2Q13367 AC025164.2-202ENST00000499685 5699 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
AP3B2Q13367 OR51A7-202ENST00000641490 2186 ntAPPRIS P1 BASIC3.77□□□□□ -1.81
AP3B2Q13367 MKLN1-201ENST00000352689 11156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
AP3B2Q13367 PRB2-201ENST00000389362 1429 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
AP3B2Q13367 MBNL3-204ENST00000370853 2661 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
AP3B2Q13367 BCLAF1P1-201ENST00000505813 2752 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
AP3B2Q13367 RNU1-70P-201ENST00000362618 164 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
AP3B2Q13367 RNU6-151P-201ENST00000364158 107 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
AP3B2Q13367 Y_RNA.215-201ENST00000364204 112 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
AP3B2Q13367 RNU6-959P-201ENST00000384671 107 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
AP3B2Q13367 RNU6-417P-201ENST00000384712 107 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
AP3B2Q13367 Y_RNA.568-201ENST00000384742 113 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
AP3B2Q13367 RNA5SP504-201ENST00000410676 117 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
AP3B2Q13367 C1orf195-201ENST00000424792 255 ntTSL 2 BASIC3.76□□□□□ -1.81
AP3B2Q13367 AL445490.2-201ENST00000440492 441 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
AP3B2Q13367 snoU13.14-201ENST00000459372 104 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
AP3B2Q13367 snoU13.22-201ENST00000459428 104 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
AP3B2Q13367 AC012312.1-201ENST00000503710 527 ntTSL 2 BASIC3.76□□□□□ -1.81
AP3B2Q13367 SAR1B-211ENST00000509937 455 ntTSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
AP3B2Q13367 RNU6-426P-201ENST00000516464 97 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
AP3B2Q13367 AC012229.1-201ENST00000558699 499 ntTSL 4 BASIC3.76□□□□□ -1.81
AP3B2Q13367 PTP4A1-204ENST00000578299 135 ntTSL 2 BASIC3.76□□□□□ -1.81
AP3B2Q13367 AC012493.2-201ENST00000595083 291 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
AP3B2Q13367 AC096577.2-201ENST00000611455 153 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
AP3B2Q13367 CYLC2-202ENST00000487798 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
AP3B2Q13367 TFEC-201ENST00000265440 6628 ntTSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
AP3B2Q13367 STEAP4-201ENST00000301959 2321 ntTSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
AP3B2Q13367 RNU6-1048P-201ENST00000364054 107 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
AP3B2Q13367 SNORD115-30-201ENST00000364117 82 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
AP3B2Q13367 RNU4-10P-201ENST00000364383 140 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
AP3B2Q13367 SNORA70.4-201ENST00000365509 134 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
AP3B2Q13367 RNU6-22P-201ENST00000384355 107 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
AP3B2Q13367 RNU6-381P-201ENST00000391259 108 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
AP3B2Q13367 RNU6-1077P-201ENST00000410506 102 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
AP3B2Q13367 RNA5SP229-201ENST00000410809 99 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
AP3B2Q13367 AC108488.2-201ENST00000438485 421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
AP3B2Q13367 RNU7-23P-201ENST00000459465 62 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
AP3B2Q13367 AC146507.2-201ENST00000460608 476 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
AP3B2Q13367 AP002884.2-201ENST00000471647 395 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
AP3B2Q13367 AL049830.2-201ENST00000480072 201 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
AP3B2Q13367 RNA5SP272-201ENST00000516095 111 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
AP3B2Q13367 AC136628.3-201ENST00000521868 290 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
AP3B2Q13367 uc_338.1-201ENST00000612113 180 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
AP3B2Q13367 HOTTIP_4.1-201ENST00000618195 165 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
AP3B2Q13367 ADAMTS9-AS1-207ENST00000594810 3609 ntTSL 4 BASIC3.75□□□□□ -1.81
AP3B2Q13367 SERPINI2-207ENST00000476257 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
AP3B2Q13367 MIR30E-201ENST00000362104 92 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
AP3B2Q13367 snoU2_19.1-201ENST00000362361 80 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
AP3B2Q13367 Y_RNA.293-201ENST00000364908 93 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
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