Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 AC008739.2-201ENST00000597006 317 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SP140Q13342 AC090517.3-201ENST00000625170 141 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SP140Q13342 HDX-206ENST00000506585 6158 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SP140Q13342 DPY19L2P1-203ENST00000458672 3347 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
SP140Q13342 NEB-220ENST00000618972 26307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SP140Q13342 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
SP140Q13342 KIAA0825-203ENST00000513200 4942 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SP140Q13342 AL355596.1-201ENST00000565399 3996 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SP140Q13342 RNU4-90P-201ENST00000362773 141 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SP140Q13342 VTRNA1-1-201ENST00000363120 99 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SP140Q13342 SNORD46.1-201ENST00000364139 104 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SP140Q13342 Y_RNA.257-201ENST00000364596 102 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SP140Q13342 Y_RNA.552-201ENST00000384665 112 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SP140Q13342 SNORA12-201ENST00000391162 147 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SP140Q13342 MIR548H3-201ENST00000408771 118 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SP140Q13342 IFNA11P-201ENST00000446352 526 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SP140Q13342 AC007395.1-201ENST00000451333 677 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SP140Q13342 HSPE1P25-201ENST00000455484 251 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SP140Q13342 RNU6-625P-201ENST00000459412 107 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SP140Q13342 AC117440.1-201ENST00000474107 571 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SP140Q13342 AC116563.1-201ENST00000505454 396 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SP140Q13342 AC105389.2-201ENST00000506475 435 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SP140Q13342 AC008871.1-201ENST00000510935 398 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SP140Q13342 RNU6-1023P-201ENST00000516137 106 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SP140Q13342 AC008115.2-201ENST00000539988 241 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SP140Q13342 AC022809.1-201ENST00000579247 428 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SP140Q13342 AC245748.3-201ENST00000588710 241 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SP140Q13342 AC005176.2-201ENST00000596933 147 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SP140Q13342 AC011373.1-201ENST00000607270 237 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SP140Q13342 CDKN2B-AS.1-201ENST00000617921 150 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SP140Q13342 AC005562.2-201ENST00000618264 111 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SP140Q13342 HELLS-201ENST00000239026 2740 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SP140Q13342 AC108750.1-201ENST00000637986 2706 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SP140Q13342 PRKACB-207ENST00000394838 4294 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SP140Q13342 AC093831.2-201ENST00000624393 3427 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SP140Q13342 TFEC-202ENST00000320239 6605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
SP140Q13342 ZNF280D-201ENST00000267807 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
SP140Q13342 AC073346.2-201ENST00000624724 2058 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SP140Q13342 MT-CO2-201ENST00000361739 684 ntAPPRIS P1 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SP140Q13342 MIR335-201ENST00000362173 94 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SP140Q13342 Y_RNA.54-201ENST00000362766 105 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SP140Q13342 RNU6-486P-201ENST00000363116 107 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SP140Q13342 SNORD27-201ENST00000363981 72 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SP140Q13342 Y_RNA.286-201ENST00000364813 102 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SP140Q13342 SNORA51.4-201ENST00000364993 124 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SP140Q13342 RNU6-1175P-201ENST00000365200 107 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SP140Q13342 SNORA18.2-201ENST00000383865 132 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SP140Q13342 Y_RNA.498-201ENST00000384460 102 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SP140Q13342 TRAJ48-201ENST00000390489 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SP140Q13342 AL033519.2-201ENST00000403958 392 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SP140Q13342 RN7SKP58-201ENST00000411010 305 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SP140Q13342 AC139712.2-201ENST00000424302 339 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SP140Q13342 AC004386.2-201ENST00000441858 148 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SP140Q13342 SEPT14P8-201ENST00000508026 178 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SP140Q13342 CYCSP23-201ENST00000519781 313 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SP140Q13342 AP003465.1-201ENST00000520575 382 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SP140Q13342 AC107016.2-201ENST00000547968 190 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SP140Q13342 AC018448.1-201ENST00000552843 316 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SP140Q13342 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SP140Q13342 AC026470.2-201ENST00000561492 181 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SP140Q13342 MIR5006-201ENST00000583027 110 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SP140Q13342 AC010900.2-201ENST00000604508 210 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SP140Q13342 AC007179.3-201ENST00000604976 235 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SP140Q13342 SNORD113-5-201ENST00000607261 78 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SP140Q13342 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SP140Q13342 AL445259.1-201ENST00000587106 2984 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SP140Q13342 NEBL-202ENST00000377122 9216 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
SP140Q13342 TPTE2-204ENST00000400103 1652 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SP140Q13342 Y_RNA.230-201ENST00000364348 109 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SP140Q13342 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SP140Q13342 RNU6-290P-201ENST00000365212 101 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SP140Q13342 Y_RNA.570-201ENST00000384750 101 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SP140Q13342 AL590399.1-203ENST00000412631 256 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SP140Q13342 RPL27AP5-201ENST00000469428 449 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SP140Q13342 RPS29P2-201ENST00000479278 136 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SP140Q13342 HMGB3P17-201ENST00000504195 649 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SP140Q13342 LNX1-AS1-203ENST00000511989 488 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SP140Q13342 AC008885.1-201ENST00000514930 301 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SP140Q13342 SCARNA11.3-201ENST00000517276 130 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SP140Q13342 AK6P2-201ENST00000549020 471 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SP140Q13342 ACTG1P17-203ENST00000561222 537 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SP140Q13342 AC233702.2-202ENST00000562547 291 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SP140Q13342 AC024270.4-201ENST00000570202 421 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SP140Q13342 RPL12P50-201ENST00000603116 116 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SP140Q13342 AC096577.2-201ENST00000611455 153 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SP140Q13342 TCL6_2.1-201ENST00000615162 119 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SP140Q13342 AC007318.2-201ENST00000620999 243 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SP140Q13342 AL807742.1-203ENST00000637444 759 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SP140Q13342 MIR7515-201ENST00000637837 67 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SP140Q13342 CHD9-203ENST00000447540 11509 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SP140Q13342 CYSLTR1-201ENST00000373304 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
SP140Q13342 RNU1-62P-201ENST00000362599 164 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SP140Q13342 SNORA71.1-201ENST00000364523 117 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SP140Q13342 SNORA9.2-201ENST00000365361 133 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SP140Q13342 Y_RNA.478-201ENST00000384358 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SP140Q13342 NCKAP5-IT1-201ENST00000416437 554 ntTSL 4 BASIC2.91□□□□□ -1.94
SP140Q13342 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SP140Q13342 RPL39P40-201ENST00000445481 146 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SP140Q13342 AC074133.1-201ENST00000515696 183 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SP140Q13342 RNU6-107P-201ENST00000516643 102 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.4 ms