Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 SNORA74C-2-201ENST00000411179 201 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CLN3Q13286 RPL23AP46-201ENST00000438548 490 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CLN3Q13286 AC008155.2-201ENST00000464337 397 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CLN3Q13286 SNORA18.4-201ENST00000516440 124 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CLN3Q13286 AC110741.2-201ENST00000605278 268 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CLN3Q13286 uc_338.4-201ENST00000616635 176 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CLN3Q13286 AC090517.3-201ENST00000625170 141 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CLN3Q13286 NR5A2-201ENST00000236914 3115 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
CLN3Q13286 CNOT2-231ENST00000551483 4753 ntTSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CLN3Q13286 FAM208A-202ENST00000431842 7119 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
CLN3Q13286 ZNF208-207ENST00000609966 3653 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CLN3Q13286 GPR180-201ENST00000376958 8822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
CLN3Q13286 AC103988.1-201ENST00000566382 2177 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CLN3Q13286 ZFYVE16-201ENST00000338008 6773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
CLN3Q13286 QSER1-201ENST00000399302 9335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
CLN3Q13286 AC046195.1-201ENST00000518973 4171 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CLN3Q13286 HDGFP1-201ENST00000405943 252 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CLN3Q13286 U6atac.2-201ENST00000408644 118 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CLN3Q13286 U91324.1-201ENST00000442864 447 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CLN3Q13286 AC010531.2-201ENST00000465012 153 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CLN3Q13286 MIR449C-201ENST00000516047 92 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CLN3Q13286 SNORD77.4-201ENST00000516158 81 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CLN3Q13286 AC107934.2-201ENST00000518653 310 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CLN3Q13286 LINC02309-201ENST00000553679 207 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CLN3Q13286 AC015720.1-201ENST00000565251 277 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CLN3Q13286 RPL23AP91-201ENST00000569211 455 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CLN3Q13286 MIR2681-201ENST00000581814 105 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CLN3Q13286 AC105245.1-201ENST00000581934 244 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CLN3Q13286 AL929325.1-201ENST00000603096 117 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CLN3Q13286 uc_338.14-201ENST00000613162 166 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CLN3Q13286 MIR7151-201ENST00000617477 60 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CLN3Q13286 AC007546.2-201ENST00000623996 360 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CLN3Q13286 COPS2-202ENST00000388901 6628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
CLN3Q13286 FMO2-201ENST00000209929 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
CLN3Q13286 ZNF266-203ENST00000588933 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
CLN3Q13286 CNTN1-201ENST00000347616 5507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
CLN3Q13286 C6orf10-209ENST00000612031 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CLN3Q13286 N4BP2L2-202ENST00000357505 2917 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CLN3Q13286 LCOR-204ENST00000371103 10342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
CLN3Q13286 OR5H14-202ENST00000641380 7323 ntAPPRIS P1 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CLN3Q13286 DAZ4-202ENST00000382314 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
CLN3Q13286 OR56A3-203ENST00000641160 4438 ntAPPRIS P1 BASIC3.92□□□□□ -1.78
CLN3Q13286 RNA5SP119-201ENST00000362715 117 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CLN3Q13286 RNA5SP151-201ENST00000365632 117 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CLN3Q13286 MIRLET7F2-201ENST00000385277 83 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CLN3Q13286 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC3.92□□□□□ -1.78
CLN3Q13286 SNORA26-201ENST00000391286 122 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CLN3Q13286 RN7SKP284-201ENST00000411002 343 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CLN3Q13286 AC092941.1-201ENST00000415940 427 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
CLN3Q13286 RPL21P10-201ENST00000463521 490 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CLN3Q13286 AC026992.1-202ENST00000558454 421 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
CLN3Q13286 AC097639.2-201ENST00000603159 172 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CLN3Q13286 MIR4727-201ENST00000622232 55 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CLN3Q13286 CCNYL2-203ENST00000638057 730 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
CLN3Q13286 GABRG2-208ENST00000638552 3710 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
CLN3Q13286 MTUS1-216ENST00000519263 4089 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
CLN3Q13286 MCF2-203ENST00000370576 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
CLN3Q13286 ZNF280D-204ENST00000558320 3666 ntTSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
CLN3Q13286 DOCK7-218ENST00000635123 6297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
CLN3Q13286 NLGN1-206ENST00000457714 8242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
CLN3Q13286 LRRC70-201ENST00000334994 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
CLN3Q13286 FAN1-202ENST00000561594 2738 ntTSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
CLN3Q13286 C6orf10-202ENST00000375015 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
CLN3Q13286 RNU6-975P-201ENST00000384296 105 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CLN3Q13286 IGLV5-37-201ENST00000390300 374 ntAPPRIS P1 BASIC3.91□□□□□ -1.78
CLN3Q13286 FO680682.1-201ENST00000421261 345 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
CLN3Q13286 AC016717.1-201ENST00000448918 286 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CLN3Q13286 RPS29P19-201ENST00000479709 171 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CLN3Q13286 RNA5SP446-201ENST00000515955 82 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CLN3Q13286 RNU6-844P-201ENST00000517175 102 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CLN3Q13286 AC020891.1-201ENST00000558785 174 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
CLN3Q13286 AL022345.2-201ENST00000606307 135 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CLN3Q13286 TENM1-201ENST00000371130 12875 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
CLN3Q13286 ORC4-201ENST00000264169 6598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
CLN3Q13286 RNF111-206ENST00000559209 5278 ntTSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
CLN3Q13286 OSBPL6-201ENST00000190611 10513 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
CLN3Q13286 MTND5P18-201ENST00000445624 1801 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CLN3Q13286 AC010680.1-201ENST00000590024 3590 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CLN3Q13286 MBNL1-220ENST00000493459 4205 ntTSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.78
CLN3Q13286 PIK3C2G-203ENST00000535651 2497 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.78
CLN3Q13286 SLC17A4-203ENST00000439485 3699 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.78
CLN3Q13286 CLHC1-201ENST00000401408 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.78
CLN3Q13286 PLCB1-233ENST00000637919 5074 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.78
CLN3Q13286 SGIP1-206ENST00000435165 3646 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
CLN3Q13286 ADAMTS9-AS1-207ENST00000594810 3609 ntTSL 4 BASIC3.9□□□□□ -1.79
CLN3Q13286 FAM169A-203ENST00000510496 5810 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
CLN3Q13286 ATG12-208ENST00000509910 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
CLN3Q13286 Y_RNA.52-201ENST00000362760 96 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CLN3Q13286 Y_RNA.203-201ENST00000364106 102 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CLN3Q13286 MIR93-201ENST00000385024 80 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CLN3Q13286 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CLN3Q13286 AC097463.2-201ENST00000421074 142 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CLN3Q13286 C1orf195-201ENST00000424792 255 ntTSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
CLN3Q13286 LINC01969-201ENST00000514468 455 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
CLN3Q13286 AC006064.5-201ENST00000541782 248 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CLN3Q13286 AC069240.1-201ENST00000548774 375 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CLN3Q13286 AC012314.7-201ENST00000619693 93 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CLN3Q13286 AC106754.2-201ENST00000623006 233 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CLN3Q13286 PROS1-203ENST00000407433 3335 ntTSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
CLN3Q13286 MARCH1-201ENST00000274056 5367 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.9□□□□□ -1.79
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