Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 SNORA40.19-201ENST00000390846 128 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CHAF1AQ13111 SNORA75.4-201ENST00000391278 119 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CHAF1AQ13111 AL357139.1-201ENST00000407792 426 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CHAF1AQ13111 RNU6-1050P-201ENST00000410388 107 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CHAF1AQ13111 MRLN-201ENST00000414264 422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
CHAF1AQ13111 WARS2P1-201ENST00000429678 537 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CHAF1AQ13111 HMGN2P3-201ENST00000433603 273 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CHAF1AQ13111 HMGN2P5-201ENST00000436882 273 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CHAF1AQ13111 AC245102.2-201ENST00000448956 180 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CHAF1AQ13111 LINC01203-202ENST00000456091 476 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
CHAF1AQ13111 PRELID3BP1-201ENST00000457142 540 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CHAF1AQ13111 AC010457.1-201ENST00000510469 458 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
CHAF1AQ13111 Y_RNA.670-201ENST00000516255 105 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CHAF1AQ13111 Y_RNA.718-201ENST00000517110 102 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CHAF1AQ13111 AP003171.1-201ENST00000532770 266 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
CHAF1AQ13111 AC090517.1-201ENST00000569307 266 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CHAF1AQ13111 AP006219.1-201ENST00000580258 472 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
CHAF1AQ13111 7SK.7-201ENST00000603504 247 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CHAF1AQ13111 AL589935.1-202ENST00000612512 393 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
CHAF1AQ13111 AP006437.1-201ENST00000641440 3685 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CHAF1AQ13111 CLLU1-201ENST00000378485 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
CHAF1AQ13111 SIRT1-203ENST00000406900 3295 ntTSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
CHAF1AQ13111 Y_RNA.2-201ENST00000362330 96 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CHAF1AQ13111 SNORD115-32-201ENST00000364079 82 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CHAF1AQ13111 RNA5SP37-201ENST00000365420 130 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CHAF1AQ13111 TRBV25OR9-2-201ENST00000438417 374 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CHAF1AQ13111 AC005703.2-201ENST00000453339 343 ntTSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
CHAF1AQ13111 Y_RNA.653-201ENST00000459091 95 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CHAF1AQ13111 AC108752.1-201ENST00000484679 576 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
CHAF1AQ13111 AC107032.1-201ENST00000485945 480 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CHAF1AQ13111 AC079804.2-201ENST00000490376 200 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CHAF1AQ13111 MIR5690-201ENST00000583739 73 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CHAF1AQ13111 AL031274.2-201ENST00000599419 203 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CHAF1AQ13111 B3GNTL1P2-201ENST00000603673 288 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CHAF1AQ13111 OR8K3-204ENST00000641689 2380 ntAPPRIS P1 BASIC2.67□□□□□ -1.98
CHAF1AQ13111 SCN7A-201ENST00000409855 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
CHAF1AQ13111 ST7-AS2-206ENST00000456577 1351 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
CHAF1AQ13111 RNU6-743P-201ENST00000364151 106 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CHAF1AQ13111 RNU6-842P-201ENST00000384269 107 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CHAF1AQ13111 RNU6-310P-201ENST00000384655 107 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CHAF1AQ13111 RPS20P15-201ENST00000412792 311 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CHAF1AQ13111 MTND1P14-201ENST00000427400 950 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CHAF1AQ13111 LINC01766-201ENST00000453968 362 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
CHAF1AQ13111 AC007215.1-201ENST00000464893 276 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CHAF1AQ13111 FO393415.2-201ENST00000480085 343 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CHAF1AQ13111 AC096711.1-201ENST00000510967 347 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
CHAF1AQ13111 MIR449C-201ENST00000516047 92 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CHAF1AQ13111 AC026470.2-201ENST00000561492 181 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CHAF1AQ13111 AC011494.1-201ENST00000596454 237 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CHAF1AQ13111 AC022202.1-201ENST00000613515 211 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CHAF1AQ13111 AC026523.1-201ENST00000617221 490 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
CHAF1AQ13111 AL160413.1-201ENST00000622780 310 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CHAF1AQ13111 NCBP1-205ENST00000629069 249 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
CHAF1AQ13111 TAB2-205ENST00000538427 4240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
CHAF1AQ13111 OGN-201ENST00000262551 2971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
CHAF1AQ13111 ZNF299P-201ENST00000406845 1804 ntBASIC2.65□□□□□ -1.98
CHAF1AQ13111 CEP57-213ENST00000541150 2911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
CHAF1AQ13111 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
CHAF1AQ13111 Y_RNA.394-201ENST00000383942 103 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CHAF1AQ13111 Y_RNA.404-201ENST00000383978 102 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CHAF1AQ13111 Y_RNA.431-201ENST00000384086 102 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CHAF1AQ13111 MIR29C-201ENST00000385231 88 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CHAF1AQ13111 MIR764-201ENST00000390811 85 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CHAF1AQ13111 Y_RNA.579-201ENST00000390939 94 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CHAF1AQ13111 Y_RNA.646-201ENST00000410980 101 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CHAF1AQ13111 AC243428.1-201ENST00000421099 264 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CHAF1AQ13111 RPL23AP50-201ENST00000434149 455 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CHAF1AQ13111 MTCO3P10-201ENST00000455912 772 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CHAF1AQ13111 AC093259.1-201ENST00000509755 300 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CHAF1AQ13111 RNU7-193P-201ENST00000516723 65 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CHAF1AQ13111 RNU6-1153P-201ENST00000516760 105 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CHAF1AQ13111 RMST_6.1-201ENST00000611980 203 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CHAF1AQ13111 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
CHAF1AQ13111 MTND4P1-201ENST00000457501 1466 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CHAF1AQ13111 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
CHAF1AQ13111 AL161668.1-201ENST00000320322 358 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
CHAF1AQ13111 RNU1-76P-201ENST00000362903 159 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CHAF1AQ13111 RNU6-331P-201ENST00000384724 107 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CHAF1AQ13111 LINC00428-201ENST00000415620 227 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
CHAF1AQ13111 AL035666.1-201ENST00000446195 348 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CHAF1AQ13111 snoU13.30-201ENST00000458951 104 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CHAF1AQ13111 RN7SKP210-201ENST00000459176 261 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CHAF1AQ13111 AC090255.1-201ENST00000495779 349 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CHAF1AQ13111 RNU6ATAC9P-201ENST00000516210 116 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CHAF1AQ13111 RNU5F-4P-201ENST00000516581 114 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CHAF1AQ13111 RNU6-1198P-201ENST00000516904 67 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CHAF1AQ13111 RNA5SP490-201ENST00000517141 136 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CHAF1AQ13111 AC087664.2-201ENST00000522898 551 ntTSL 4 BASIC2.64□□□□□ -1.99
CHAF1AQ13111 AC010928.2-201ENST00000588017 287 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CHAF1AQ13111 AC080078.3-201ENST00000605407 463 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CHAF1AQ13111 MIR6132-201ENST00000622083 109 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CHAF1AQ13111 ETDC-201ENST00000635820 180 ntAPPRIS P1 BASIC2.64□□□□□ -1.99
CHAF1AQ13111 ZNF404-202ENST00000587539 1851 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
CHAF1AQ13111 C6orf10-201ENST00000375007 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
CHAF1AQ13111 Y_RNA.48-201ENST00000362710 103 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CHAF1AQ13111 Y_RNA.99-201ENST00000363138 105 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CHAF1AQ13111 RNU6-595P-201ENST00000363944 107 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CHAF1AQ13111 U8.10-201ENST00000384260 133 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CHAF1AQ13111 Y_RNA.533-201ENST00000384596 114 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CHAF1AQ13111 HMGN2P39-201ENST00000398005 273 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
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