Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 AP003715.1-201ENST00000532109 435 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
GPS1Q13098 TAB2-201ENST00000367456 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
GPS1Q13098 Z82209.1-201ENST00000422141 2135 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
GPS1Q13098 SACS-201ENST00000382292 15324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
GPS1Q13098 MDM2-206ENST00000350057 1401 ntTSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
GPS1Q13098 Y_RNA.27-201ENST00000362540 103 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
GPS1Q13098 RNU5F-3P-201ENST00000363767 117 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
GPS1Q13098 SNORD14.1-201ENST00000365609 90 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
GPS1Q13098 Y_RNA.424-201ENST00000384063 103 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
GPS1Q13098 RNU6-823P-201ENST00000391042 103 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
GPS1Q13098 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
GPS1Q13098 MTND2P23-201ENST00000422990 651 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
GPS1Q13098 AC004386.2-201ENST00000441858 148 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
GPS1Q13098 AC025750.2-201ENST00000442609 450 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
GPS1Q13098 LINC02064-201ENST00000506492 470 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
GPS1Q13098 MIR449C-201ENST00000516047 92 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
GPS1Q13098 RNA5SP367-201ENST00000516557 118 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
GPS1Q13098 Y_RNA.721-201ENST00000517207 102 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
GPS1Q13098 CBX3P7-201ENST00000532876 502 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
GPS1Q13098 PTP4A1-204ENST00000578299 135 ntTSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
GPS1Q13098 AL355297.2-201ENST00000604792 129 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
GPS1Q13098 LINC01206-214ENST00000610910 456 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
GPS1Q13098 TCL6_2.1-201ENST00000615162 119 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
GPS1Q13098 AL449363.1-201ENST00000617815 186 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
GPS1Q13098 KBTBD3-207ENST00000534815 3396 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
GPS1Q13098 DNAH14-210ENST00000439375 13548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
GPS1Q13098 RMDN2-203ENST00000402091 1973 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
GPS1Q13098 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
GPS1Q13098 CCDC148-202ENST00000409187 2523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
GPS1Q13098 MIR6073-201ENST00000352083 89 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
GPS1Q13098 RNU1-76P-201ENST00000362903 159 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
GPS1Q13098 Y_RNA.389-201ENST00000383924 113 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
GPS1Q13098 RNU6-26P-201ENST00000383985 107 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
GPS1Q13098 Y_RNA.455-201ENST00000384230 98 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
GPS1Q13098 SNORA51.11-201ENST00000384442 131 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
GPS1Q13098 Y_RNA.526-201ENST00000384572 110 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
GPS1Q13098 RNU6-985P-201ENST00000410182 104 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
GPS1Q13098 RNU6-101P-201ENST00000410323 104 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
GPS1Q13098 HMGN2P35-201ENST00000412164 270 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
GPS1Q13098 AL353680.1-201ENST00000433788 337 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
GPS1Q13098 RPS12P2-201ENST00000439728 269 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
GPS1Q13098 RNU6-965P-201ENST00000516721 96 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
GPS1Q13098 AC022616.4-201ENST00000522985 181 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
GPS1Q13098 AP003171.1-201ENST00000532770 266 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
GPS1Q13098 AC113192.4-201ENST00000534666 547 ntTSL 4 BASIC2.61□□□□□ -1.99
GPS1Q13098 EIF4BP1-201ENST00000554881 351 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
GPS1Q13098 AC023824.2-201ENST00000566185 400 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
GPS1Q13098 AP005062.1-201ENST00000581502 607 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
GPS1Q13098 MIR7106-201ENST00000612419 65 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
GPS1Q13098 DLEU2_2.2-201ENST00000615474 90 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
GPS1Q13098 U6.92-201ENST00000636464 89 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
GPS1Q13098 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
GPS1Q13098 SKIL-203ENST00000426052 2757 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
GPS1Q13098 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
GPS1Q13098 VPS13A-206ENST00000376646 2262 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
GPS1Q13098 Y_RNA.145-201ENST00000363527 102 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
GPS1Q13098 RNU6-1072P-201ENST00000384703 107 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
GPS1Q13098 RNU6-443P-201ENST00000384780 107 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
GPS1Q13098 MIR329-1-201ENST00000385028 80 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
GPS1Q13098 RNU2-32P-201ENST00000411193 191 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
GPS1Q13098 INTS6-AS1-201ENST00000434512 466 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
GPS1Q13098 AC107083.1-201ENST00000439643 279 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
GPS1Q13098 AC009237.7-201ENST00000447357 229 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
GPS1Q13098 AC091179.3-201ENST00000474761 144 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
GPS1Q13098 LINC02501-201ENST00000510420 426 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
GPS1Q13098 RNU6-327P-201ENST00000516270 127 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
GPS1Q13098 RNU6-764P-201ENST00000516396 105 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
GPS1Q13098 RN7SKP49-201ENST00000516675 260 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
GPS1Q13098 AC022616.8-201ENST00000533569 253 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
GPS1Q13098 AC113195.1-201ENST00000579952 141 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
GPS1Q13098 MIR5006-201ENST00000583027 110 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
GPS1Q13098 AL390123.1-201ENST00000603216 237 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
GPS1Q13098 AC124312.5-201ENST00000604451 268 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
GPS1Q13098 RPL17P51-201ENST00000605218 238 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
GPS1Q13098 AC010999.1-201ENST00000611856 324 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
GPS1Q13098 RNU4-50P-201ENST00000364361 141 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
GPS1Q13098 RNU6-234P-201ENST00000365229 104 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
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GPS1Q13098 RNU6-793P-201ENST00000384233 104 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
GPS1Q13098 SNORD78.2-201ENST00000391076 69 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
GPS1Q13098 RNA5SP181-201ENST00000410246 98 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
GPS1Q13098 AC105272.1-201ENST00000438604 198 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
GPS1Q13098 AC010095.1-201ENST00000443543 144 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
GPS1Q13098 Z68323.1-201ENST00000450365 519 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
GPS1Q13098 AC010469.2-201ENST00000496412 480 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
GPS1Q13098 AC010457.1-201ENST00000510469 458 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
GPS1Q13098 Y_RNA.683-201ENST00000516508 93 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
GPS1Q13098 RNU5F-4P-201ENST00000516581 114 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
GPS1Q13098 RNU6-1098P-201ENST00000516772 96 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
GPS1Q13098 RNU2-44P-201ENST00000516795 194 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
GPS1Q13098 Y_RNA.715-201ENST00000517082 110 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
GPS1Q13098 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
GPS1Q13098 AC126323.6-201ENST00000561701 451 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
GPS1Q13098 RPS29P30-201ENST00000600975 111 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
GPS1Q13098 AC116312.1-201ENST00000606841 314 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
GPS1Q13098 AL355512.1-202ENST00000607952 209 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
GPS1Q13098 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
GPS1Q13098 PART1_1.1-201ENST00000611761 217 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
GPS1Q13098 AC010297.1-201ENST00000623948 149 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
GPS1Q13098 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
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