Protein–RNA interactions for Protein: Q12769

NUP160, Nuclear pore complex protein Nup160, humanhuman

Predictions only

Length 1,436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP160Q12769 AC103996.1-201ENST00000555468 102 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
NUP160Q12769 MTND4P33-201ENST00000556706 766 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
NUP160Q12769 AC138749.5-201ENST00000611461 208 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
NUP160Q12769 AC116165.2-201ENST00000616705 206 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
NUP160Q12769 CYLC1-201ENST00000329312 2106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.63□□□□□ -2.31
NUP160Q12769 AC092268.1-201ENST00000342691 405 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
NUP160Q12769 RNU6-1287P-201ENST00000362914 107 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
NUP160Q12769 RNU6-1060P-201ENST00000384664 107 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
NUP160Q12769 MIR100-201ENST00000385259 80 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
NUP160Q12769 SNORA26.3-201ENST00000391119 136 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
NUP160Q12769 MIR208B-201ENST00000401172 77 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
NUP160Q12769 RPS29P13-201ENST00000402041 169 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
NUP160Q12769 AC005009.1-201ENST00000423979 269 ntTSL 2 BASIC0.63□□□□□ -2.31
NUP160Q12769 MTCO2P23-201ENST00000425216 680 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
NUP160Q12769 AL356583.2-201ENST00000426536 280 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
NUP160Q12769 USP9YP28-201ENST00000435142 589 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
NUP160Q12769 AC104850.1-201ENST00000435940 476 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
NUP160Q12769 AL606662.1-201ENST00000445763 553 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
NUP160Q12769 AC092944.1-205ENST00000494885 517 ntTSL 4 BASIC0.63□□□□□ -2.31
NUP160Q12769 RPS3A-208ENST00000509736 576 ntTSL 2 BASIC0.63□□□□□ -2.31
NUP160Q12769 RNU4-57P-201ENST00000515980 135 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
NUP160Q12769 Y_RNA.672-201ENST00000516289 104 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
NUP160Q12769 AC109479.2-201ENST00000517842 174 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
NUP160Q12769 LINC02311-201ENST00000556144 383 ntTSL 3 BASIC0.63□□□□□ -2.31
NUP160Q12769 TPRKBP2-201ENST00000565969 475 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
NUP160Q12769 ST7-OT4_4.1-201ENST00000614993 213 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
NUP160Q12769 AC008250.2-201ENST00000615261 205 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
NUP160Q12769 MESTIT1_1.1-201ENST00000618871 140 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
NUP160Q12769 AL078595.3-201ENST00000623815 1166 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
NUP160Q12769 SNORA50A-201ENST00000384225 134 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
NUP160Q12769 RNU6-733P-201ENST00000410759 104 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
NUP160Q12769 RPL23AP95-201ENST00000426806 265 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
NUP160Q12769 HSFY7P-201ENST00000432672 318 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
NUP160Q12769 HSFY8P-201ENST00000437934 318 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
NUP160Q12769 AC016717.1-201ENST00000448918 286 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
NUP160Q12769 AL031274.1-201ENST00000450334 232 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
NUP160Q12769 LINC01201-202ENST00000451431 401 ntTSL 3 BASIC0.62□□□□□ -2.31
NUP160Q12769 LINC01774-201ENST00000453569 595 ntTSL 2 BASIC0.62□□□□□ -2.31
NUP160Q12769 HMGN1P12-201ENST00000499125 195 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
NUP160Q12769 AC093752.1-212ENST00000500559 453 ntTSL 1 (best) BASIC0.62□□□□□ -2.31
NUP160Q12769 AC016632.1-201ENST00000503994 196 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
NUP160Q12769 NAF1-205ENST00000509434 385 ntTSL 3 BASIC0.62□□□□□ -2.31
NUP160Q12769 AC009558.1-201ENST00000561174 581 ntTSL 4 BASIC0.62□□□□□ -2.31
NUP160Q12769 AC011939.2-201ENST00000567396 428 ntTSL 3 BASIC0.62□□□□□ -2.31
NUP160Q12769 TMF1P1-201ENST00000576058 373 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
NUP160Q12769 AC009994.1-201ENST00000606889 253 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
NUP160Q12769 U6.114-201ENST00000636407 96 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
NUP160Q12769 AC007671.2-201ENST00000637344 619 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
NUP160Q12769 AC099654.13-201ENST00000639774 207 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
NUP160Q12769 BX322639.1-202ENST00000423987 2213 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
NUP160Q12769 RNU6ATAC8P-201ENST00000408460 126 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
NUP160Q12769 AC114482.1-201ENST00000418010 247 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
NUP160Q12769 AC010154.1-201ENST00000425857 269 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
NUP160Q12769 AL136980.1-201ENST00000426764 543 ntTSL 3 BASIC0.61□□□□□ -2.31
NUP160Q12769 AL603839.2-201ENST00000437060 546 ntTSL 5 BASIC0.61□□□□□ -2.31
NUP160Q12769 AL162395.1-201ENST00000457882 422 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
NUP160Q12769 SNORD124-201ENST00000459577 104 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
NUP160Q12769 RAP1BP2-201ENST00000478270 544 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
NUP160Q12769 WDR78-207ENST00000488333 613 ntTSL 3 BASIC0.61□□□□□ -2.31
NUP160Q12769 AC008628.2-201ENST00000502605 298 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
NUP160Q12769 DEFB131C-201ENST00000528817 165 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
NUP160Q12769 AC008147.1-201ENST00000551284 325 ntTSL 3 BASIC0.61□□□□□ -2.31
NUP160Q12769 AC010620.1-201ENST00000601088 1102 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
NUP160Q12769 AL929325.1-201ENST00000603096 117 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
NUP160Q12769 AC091805.2-201ENST00000603848 235 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
NUP160Q12769 AL356157.2-201ENST00000605122 111 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
NUP160Q12769 Z99289.3-201ENST00000605586 594 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
NUP160Q12769 AC091304.9-201ENST00000612091 226 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
NUP160Q12769 AL133173.2-201ENST00000614270 90 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
NUP160Q12769 AC138058.1-201ENST00000620572 449 ntTSL 3 BASIC0.61□□□□□ -2.31
NUP160Q12769 LINC01515-217ENST00000620859 694 ntTSL 5 BASIC0.61□□□□□ -2.31
NUP160Q12769 AC010608.3-201ENST00000625048 527 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
NUP160Q12769 PDCL2-201ENST00000295645 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.6□□□□□ -2.31
NUP160Q12769 RNU5E-5P-201ENST00000365379 116 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
NUP160Q12769 RNU6-827P-201ENST00000365553 106 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
NUP160Q12769 MIR608-201ENST00000384820 100 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
NUP160Q12769 RNA5SP109-201ENST00000391010 116 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
NUP160Q12769 RNU6-1093P-201ENST00000391194 107 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
NUP160Q12769 RNU2-8P-201ENST00000410727 190 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
NUP160Q12769 AC011233.1-201ENST00000422812 283 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
NUP160Q12769 AC002486.1-201ENST00000435098 391 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
NUP160Q12769 USP9YP12-201ENST00000450481 570 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
NUP160Q12769 MTCYBP1-201ENST00000454315 1119 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
NUP160Q12769 UBE2V1P12-201ENST00000503954 474 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
NUP160Q12769 RNU2-46P-201ENST00000517038 113 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
NUP160Q12769 LINC02155-201ENST00000519215 407 ntTSL 5 BASIC0.6□□□□□ -2.31
NUP160Q12769 AC090572.1-201ENST00000519251 160 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
NUP160Q12769 AC022878.1-201ENST00000530684 149 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
NUP160Q12769 APOOP3-201ENST00000536787 586 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
NUP160Q12769 MTCO2P2-201ENST00000591258 225 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
NUP160Q12769 AC064872.1-201ENST00000604823 1072 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
NUP160Q12769 AL353149.1-201ENST00000610667 244 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
NUP160Q12769 AC138649.3-201ENST00000622154 254 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
NUP160Q12769 SNORA43.4-201ENST00000629559 138 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
NUP160Q12769 AC006927.3-201ENST00000638789 384 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
NUP160Q12769 RNU6-910P-201ENST00000390844 107 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
NUP160Q12769 RNA5SP299-201ENST00000391203 116 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
NUP160Q12769 AL117339.3-201ENST00000418733 162 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
NUP160Q12769 AL592431.2-201ENST00000422198 171 ntTSL 3 BASIC0.59□□□□□ -2.31
NUP160Q12769 AC012306.1-201ENST00000423267 114 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.1 ms