Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 RNU7-57P-201ENST00000459540 60 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPREP23469 AC096725.1-201ENST00000514266 313 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPREP23469 RNU6-830P-201ENST00000516353 107 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPREP23469 RNA5SP360-201ENST00000516555 118 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPREP23469 AC092747.1-201ENST00000538920 351 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPREP23469 AC084364.2-201ENST00000546924 395 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPREP23469 MIR5685-201ENST00000579080 79 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPREP23469 CR392039.5-201ENST00000623201 510 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPREP23469 AC068254.2-201ENST00000623938 3577 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPREP23469 FLJ46284-201ENST00000504861 3421 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPREP23469 AC058791.1-201ENST00000608412 3198 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPREP23469 FAN1-202ENST00000561594 2738 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPREP23469 SMG1P1-206ENST00000431681 2913 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPREP23469 AKAP4-201ENST00000358526 2881 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPREP23469 SLAIN2-205ENST00000512093 4219 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPREP23469 N4BP2L2-202ENST00000357505 2917 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPREP23469 MS4A1-201ENST00000345732 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPREP23469 Y_RNA.213-201ENST00000364178 111 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPREP23469 SNORA63D-201ENST00000364359 132 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPREP23469 RNU6-1292P-201ENST00000383856 107 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPREP23469 RNA5SP354-201ENST00000391247 136 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPREP23469 AC018634.1-201ENST00000437554 401 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPREP23469 RPL23AP46-201ENST00000438548 490 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPREP23469 AL359853.2-201ENST00000442108 353 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPREP23469 AC025554.1-201ENST00000505641 188 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPREP23469 RNU6-504P-201ENST00000516568 104 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPREP23469 AC107934.2-201ENST00000518653 310 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPREP23469 AL160314.2-204ENST00000554730 380 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPREP23469 AC022655.2-201ENST00000577280 318 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPREP23469 MIR7151-201ENST00000617477 60 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPREP23469 RDM1-221ENST00000617591 432 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPREP23469 MIR7702-201ENST00000621931 59 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPREP23469 PLCB1-233ENST00000637919 5074 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPREP23469 GPAM-201ENST00000348367 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPREP23469 LDHAL6CP-202ENST00000550738 3224 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPREP23469 TUSC7-203ENST00000477539 2415 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPREP23469 RAPGEF6-201ENST00000296859 5618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPREP23469 MAP3K19-203ENST00000375845 4369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPREP23469 PTCD2-202ENST00000380639 11151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPREP23469 ZFYVE16-201ENST00000338008 6773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPREP23469 ATP8B4-201ENST00000284509 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPREP23469 TUG1-201ENST00000519077 5673 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPREP23469 QSER1-201ENST00000399302 9335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPREP23469 snoU2_19.1-201ENST00000362361 80 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPREP23469 RNU6-748P-201ENST00000384648 107 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPREP23469 MIR200C-201ENST00000384980 68 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPREP23469 GOT2P5-201ENST00000433995 546 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPREP23469 AL133547.1-201ENST00000448546 220 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPREP23469 RPS29P19-201ENST00000479709 171 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPREP23469 AC093663.1-201ENST00000497190 394 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPREP23469 AC131956.1-201ENST00000506420 258 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPREP23469 KRTAP13-6P-201ENST00000508999 371 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPREP23469 RNU6-240P-201ENST00000516098 97 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPREP23469 AC104393.1-201ENST00000517495 255 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPREP23469 AC079466.2-201ENST00000585394 185 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPREP23469 RPL17P51-201ENST00000605218 238 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPREP23469 RNU6-91P-201ENST00000607774 107 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPREP23469 MIR6500-201ENST00000622700 86 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPREP23469 AC012442.3-202ENST00000636742 206 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPREP23469 AC080128.1-201ENST00000474389 1917 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPREP23469 PTPN22-202ENST00000420377 2726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPREP23469 RIMS2-201ENST00000262231 3854 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPREP23469 QSER1-204ENST00000527788 5052 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPREP23469 CFL2-202ENST00000341223 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPREP23469 FAM107B-229ENST00000622567 3510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPREP23469 LINC00890-202ENST00000569275 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPREP23469 C1orf112-203ENST00000413811 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPREP23469 VPS13C-202ENST00000261517 13400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPREP23469 MIR208A-201ENST00000362287 71 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPREP23469 RNU6-1210P-201ENST00000363775 107 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPREP23469 RNY1P1-201ENST00000364372 112 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPREP23469 RNU6-117P-201ENST00000365415 107 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPREP23469 AL500522.2-201ENST00000448562 343 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPREP23469 AC008155.2-201ENST00000464337 397 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPREP23469 RN7SL807P-201ENST00000470923 297 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPREP23469 AC022081.1-201ENST00000537327 433 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPREP23469 AC020891.1-201ENST00000558785 174 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPREP23469 AC008739.3-201ENST00000603262 127 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPREP23469 AC091152.3-201ENST00000604227 325 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPREP23469 AL161912.2-201ENST00000565707 3007 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPREP23469 AC016588.2-201ENST00000632484 3021 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPREP23469 AGTR2-201ENST00000371906 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPREP23469 ZNF700-202ENST00000482090 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPREP23469 AL157396.1-201ENST00000630034 8444 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
PTPREP23469 OR56A1-203ENST00000641900 8448 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
PTPREP23469 RNF111-212ENST00000561186 4536 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
PTPREP23469 AC026241.1-201ENST00000517873 2142 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PTPREP23469 RNU6-497P-201ENST00000365316 104 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PTPREP23469 YME1L1P1-201ENST00000429435 297 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PTPREP23469 AL121760.1-201ENST00000447206 346 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
PTPREP23469 RNY4P20-201ENST00000516678 93 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PTPREP23469 RNU6-1098P-201ENST00000516772 96 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PTPREP23469 SCARNA15-202ENST00000516881 127 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PTPREP23469 RNA5SP490-201ENST00000517141 136 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PTPREP23469 HMGN2P15-201ENST00000585707 270 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PTPREP23469 COPS2-202ENST00000388901 6628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
PTPREP23469 SLC17A4-203ENST00000439485 3699 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
PTPREP23469 OTOGL-202ENST00000458043 8083 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
PTPREP23469 PTRH2-203ENST00000470557 4114 ntAPPRIS P3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
PTPREP23469 ITCH-202ENST00000374864 6401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.6 ms