Protein–RNA interactions for Protein: P11926

ODC1, Ornithine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1P11926 AC005741.1-201ENST00000511094 432 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ODC1P11926 RNU6-250P-201ENST00000516958 103 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ODC1P11926 IGHVII-53-1-201ENST00000519538 255 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ODC1P11926 AC011092.2-201ENST00000533659 586 ntTSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
ODC1P11926 AC027018.1-202ENST00000534723 383 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
ODC1P11926 AL121821.1-201ENST00000557067 530 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
ODC1P11926 ANP32BP3-201ENST00000559213 706 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ODC1P11926 AC099518.4-202ENST00000576433 455 ntTSL 2 BASIC1.89□□□□□ -2.11
ODC1P11926 AC011712.1-201ENST00000588959 234 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ODC1P11926 AC243960.4-201ENST00000600532 288 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ODC1P11926 HOXA11-AS1_4.1-201ENST00000620901 233 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ODC1P11926 uc_338.20-201ENST00000621563 178 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ODC1P11926 SAGE1-202ENST00000370709 2879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
ODC1P11926 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
ODC1P11926 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
ODC1P11926 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
ODC1P11926 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ODC1P11926 Y_RNA.151-201ENST00000363566 112 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ODC1P11926 SNORA29-201ENST00000384183 140 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ODC1P11926 Y_RNA.474-201ENST00000384341 102 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ODC1P11926 AL627390.1-201ENST00000396055 340 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ODC1P11926 MTND4LP11-201ENST00000422184 280 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ODC1P11926 PSPC1-AS2-201ENST00000423023 376 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
ODC1P11926 AC096920.1-201ENST00000423991 241 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ODC1P11926 RPS3AP52-201ENST00000435639 297 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ODC1P11926 RPL23AP6-201ENST00000446637 472 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ODC1P11926 AC069528.1-201ENST00000490344 705 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
ODC1P11926 MTND5P5-201ENST00000503764 376 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ODC1P11926 AC096711.2-201ENST00000510592 454 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
ODC1P11926 AC096711.1-201ENST00000510967 347 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
ODC1P11926 MIR449C-201ENST00000516047 92 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ODC1P11926 RNU6-991P-201ENST00000516168 107 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ODC1P11926 RNU6-875P-201ENST00000516488 106 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ODC1P11926 RNU6-566P-201ENST00000516790 107 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ODC1P11926 RNA5SP454-201ENST00000517231 127 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ODC1P11926 LINC02155-201ENST00000519215 407 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
ODC1P11926 AP003171.1-201ENST00000532770 266 ntTSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
ODC1P11926 AC007450.1-201ENST00000536492 188 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
ODC1P11926 AP003174.2-201ENST00000544663 294 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
ODC1P11926 AC009754.1-201ENST00000566282 540 ntTSL 4 BASIC1.88□□□□□ -2.11
ODC1P11926 MIR3683-201ENST00000580847 82 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ODC1P11926 CERS6-AS1-202ENST00000594898 499 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
ODC1P11926 UBE2E2-206ENST00000613545 282 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
ODC1P11926 Y_RNA.70-201ENST00000362886 110 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ODC1P11926 RNU1-17P-201ENST00000363022 152 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ODC1P11926 RNU5B-2P-201ENST00000363036 113 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ODC1P11926 Y_RNA.166-201ENST00000363730 102 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ODC1P11926 RNU6-968P-201ENST00000384076 107 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ODC1P11926 RNU6-1013P-201ENST00000384180 107 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ODC1P11926 RNU6-790P-201ENST00000384479 105 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ODC1P11926 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC1.87□□□□□ -2.11
ODC1P11926 MIR548K-201ENST00000408406 116 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ODC1P11926 RPS26P42-201ENST00000413485 326 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ODC1P11926 LINC01344-201ENST00000420760 261 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
ODC1P11926 AC098614.3-201ENST00000438957 440 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ODC1P11926 AL353743.2-202ENST00000439544 473 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
ODC1P11926 DAP3P1-201ENST00000441522 278 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ODC1P11926 HMGN2P18-201ENST00000450680 270 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ODC1P11926 PCMTD1P1-201ENST00000455560 355 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ODC1P11926 RNU6-277P-201ENST00000516272 106 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ODC1P11926 Y_RNA.682-201ENST00000516457 100 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ODC1P11926 RNU2-44P-201ENST00000516795 194 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ODC1P11926 RNA5SP490-201ENST00000517141 136 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ODC1P11926 MIR4419B-201ENST00000577260 68 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ODC1P11926 MIR8081-201ENST00000611533 95 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ODC1P11926 ETDC-201ENST00000635820 180 ntAPPRIS P1 BASIC1.87□□□□□ -2.11
ODC1P11926 FSD1L-201ENST00000374707 7062 ntTSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
ODC1P11926 RNU6-1059P-201ENST00000363752 98 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ODC1P11926 RNA5SP190-201ENST00000365222 118 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ODC1P11926 RNU6-306P-201ENST00000384617 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ODC1P11926 RNU6-1093P-201ENST00000391194 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ODC1P11926 RNA5SP465-201ENST00000391195 109 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ODC1P11926 MIR548F5-201ENST00000408421 86 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ODC1P11926 RNA5SP494-201ENST00000410653 129 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ODC1P11926 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ODC1P11926 HMGB1P18-201ENST00000438801 619 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ODC1P11926 MTND4LP16-201ENST00000440828 295 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ODC1P11926 AC092755.1-201ENST00000441746 97 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
ODC1P11926 AL353572.1-201ENST00000442490 417 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ODC1P11926 AL035634.1-201ENST00000446768 372 ntTSL 2 BASIC1.86□□□□□ -2.11
ODC1P11926 AL353148.1-201ENST00000449761 463 ntTSL 2 BASIC1.86□□□□□ -2.11
ODC1P11926 PPP1R2P5-201ENST00000457256 603 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ODC1P11926 AC130509.1-201ENST00000464158 433 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ODC1P11926 Y_RNA.691-201ENST00000516611 103 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ODC1P11926 AC025871.1-202ENST00000518819 432 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
ODC1P11926 LINC02055-204ENST00000521034 432 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
ODC1P11926 AP006219.1-201ENST00000580258 472 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
ODC1P11926 POLR3GP2-201ENST00000588366 668 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ODC1P11926 DSCR8-208ENST00000614538 403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
ODC1P11926 DLEU2_5.1-201ENST00000615567 84 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ODC1P11926 MESTIT1_1.1-201ENST00000618871 140 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ODC1P11926 MUC15-202ENST00000436318 3118 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
ODC1P11926 AC233981.2-201ENST00000611524 1614 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ODC1P11926 RNA5SP276-201ENST00000362580 94 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ODC1P11926 RNU6-1164P-201ENST00000364428 107 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ODC1P11926 Y_RNA.604-201ENST00000410574 102 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ODC1P11926 RNU2-41P-201ENST00000410991 178 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ODC1P11926 snoU13.6-201ENST00000458785 104 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ODC1P11926 AC026765.1-201ENST00000547876 435 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
ODC1P11926 AC090517.1-201ENST00000569307 266 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 148.8 ms