Protein–RNA interactions for Protein: O15078

CEP290, Centrosomal protein of 290 kDa, humanhuman

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Length 2,479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP290O15078 ANKRD20A17P-201ENST00000511745 1330 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
CEP290O15078 MTND4P4-201ENST00000439033 1366 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
CEP290O15078 RNU6-1300P-201ENST00000391046 108 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
CEP290O15078 RNA5SP323-201ENST00000391094 133 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
CEP290O15078 AL663109.1-201ENST00000411498 844 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
CEP290O15078 RPL17P19-201ENST00000489069 552 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
CEP290O15078 AC069528.1-201ENST00000490344 705 ntTSL 3 BASIC-0.62□□□□□ -2.51
CEP290O15078 OR9P1P-201ENST00000496431 281 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
CEP290O15078 SNORA70.12-201ENST00000516084 153 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
CEP290O15078 RNA5SP216-201ENST00000516111 123 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
CEP290O15078 RNU6-703P-201ENST00000516946 107 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
CEP290O15078 ZNF706-202ENST00000517844 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC-0.62□□□□□ -2.51
CEP290O15078 AL355598.1-201ENST00000604169 202 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
CEP290O15078 AC104820.1-201ENST00000624183 307 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
CEP290O15078 MIR3529-201ENST00000637713 78 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
CEP290O15078 ZNF849P-201ENST00000594711 1566 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
CEP290O15078 RNU6-331P-201ENST00000384724 107 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
CEP290O15078 CBX3P9-201ENST00000402326 552 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
CEP290O15078 AL451046.2-201ENST00000403074 277 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
CEP290O15078 AL391704.1-203ENST00000414903 462 ntTSL 3 BASIC-0.63□□□□□ -2.51
CEP290O15078 MTCO3P1-205ENST00000422088 832 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
CEP290O15078 USP9YP11-201ENST00000427537 717 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
CEP290O15078 ZNF736P1Y-201ENST00000440402 1276 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
CEP290O15078 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
CEP290O15078 MDM2-221ENST00000517852 393 ntTSL 1 (best) BASIC-0.63□□□□□ -2.51
CEP290O15078 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
CEP290O15078 MDM2-233ENST00000545204 398 ntTSL 5 BASIC-0.63□□□□□ -2.51
CEP290O15078 MTND1P15-201ENST00000579262 949 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
CEP290O15078 RNU5E-8P-201ENST00000363502 116 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
CEP290O15078 SNORA3B-201ENST00000391305 131 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
CEP290O15078 TPMTP2-201ENST00000414372 726 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
CEP290O15078 MTCO2P1-201ENST00000424648 477 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
CEP290O15078 AC145146.2-202ENST00000508118 326 ntTSL 3 BASIC-0.63□□□□□ -2.51
CEP290O15078 RNU2-53P-201ENST00000516257 147 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
CEP290O15078 HIGD1AP6-201ENST00000521833 279 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
CEP290O15078 AC093012.1-202ENST00000549403 582 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
CEP290O15078 AC012404.2-201ENST00000558572 481 ntTSL 3 BASIC-0.63□□□□□ -2.51
CEP290O15078 LINC01899-202ENST00000583756 575 ntTSL 3 BASIC-0.63□□□□□ -2.51
CEP290O15078 AC246785.4-201ENST00000605374 287 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
CEP290O15078 AL162726.3-218ENST00000636401 95 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
CEP290O15078 MIR499B-201ENST00000636498 73 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
CEP290O15078 AC083799.1-201ENST00000366451 910 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
CEP290O15078 Y_RNA.421-201ENST00000384052 101 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
CEP290O15078 RNU6-878P-201ENST00000384578 110 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
CEP290O15078 Y_RNA.555-201ENST00000384673 110 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
CEP290O15078 RNY1P7-201ENST00000384743 110 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
CEP290O15078 RNY4P36-201ENST00000391116 96 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
CEP290O15078 RNU2-23P-201ENST00000410545 195 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
CEP290O15078 AF127577.1-201ENST00000446301 562 ntTSL 3 BASIC-0.64□□□□□ -2.51
CEP290O15078 AC109445.1-201ENST00000512356 383 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
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CEP290O15078 LINC01378-205ENST00000615833 158 ntTSL 5 BASIC-0.64□□□□□ -2.51
CEP290O15078 SNORD115-2-201ENST00000362842 82 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
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CEP290O15078 AC008440.2-201ENST00000413496 423 ntTSL 5 BASIC-0.64□□□□□ -2.51
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CEP290O15078 AC099520.1-205ENST00000524083 316 ntTSL 3 BASIC-0.64□□□□□ -2.51
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CEP290O15078 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC-0.65□□□□□ -2.51
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CEP290O15078 DEFB130C-202ENST00000530001 230 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
CEP290O15078 AL590491.3-201ENST00000610731 82 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
CEP290O15078 AL357080.1-201ENST00000617394 239 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
CEP290O15078 MT-TY-201ENST00000387409 66 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.51
CEP290O15078 RNU6-57P-201ENST00000411348 103 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.51
CEP290O15078 AC006210.1-201ENST00000424882 111 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.51
CEP290O15078 MED28P2-201ENST00000475771 317 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.51
CEP290O15078 MTND2P33-201ENST00000506452 1031 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.51
CEP290O15078 AC011374.2-201ENST00000607135 526 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.51
CEP290O15078 AC013476.2-201ENST00000614456 459 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.51
CEP290O15078 RNU6-1078P-201ENST00000364522 103 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
CEP290O15078 SNORD32A-201ENST00000364805 84 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
CEP290O15078 Y_RNA.371-201ENST00000365591 113 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
CEP290O15078 SNORA26.3-201ENST00000391119 136 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
CEP290O15078 PSMA6P3-201ENST00000428242 164 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
CEP290O15078 AL139397.1-201ENST00000430456 644 ntTSL 2 BASIC-0.66□□□□□ -2.52
CEP290O15078 AC073910.1-201ENST00000445047 438 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
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