Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIW0

VAX2, Ventral anterior homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAX2Q9UIW0 RNU6-331P-201ENST00000384724 107 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
VAX2Q9UIW0 MIR194-1-201ENST00000384892 85 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
VAX2Q9UIW0 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC0.97□□□□□ -2.25
VAX2Q9UIW0 RNU4-62P-201ENST00000410125 130 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
VAX2Q9UIW0 AC004965.1-201ENST00000413033 213 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
VAX2Q9UIW0 ATP13A5-AS1-201ENST00000414634 476 ntTSL 3 BASIC0.97□□□□□ -2.25
VAX2Q9UIW0 LINC01701-201ENST00000419614 451 ntTSL 2 BASIC0.97□□□□□ -2.25
VAX2Q9UIW0 NAALADL2-AS1-201ENST00000426315 804 ntTSL 5 BASIC0.97□□□□□ -2.25
VAX2Q9UIW0 MTCO2P11-201ENST00000431069 680 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
VAX2Q9UIW0 AC073910.1-201ENST00000445047 438 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
VAX2Q9UIW0 AC009474.2-201ENST00000451383 136 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
VAX2Q9UIW0 RPS26P45-201ENST00000471748 340 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
VAX2Q9UIW0 LEKR1-205ENST00000477399 621 ntTSL 2 BASIC0.97□□□□□ -2.25
VAX2Q9UIW0 MTCYBP18-201ENST00000501056 747 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
VAX2Q9UIW0 AC106744.2-201ENST00000513955 898 ntTSL 5 BASIC0.97□□□□□ -2.25
VAX2Q9UIW0 RNU6-1146P-201ENST00000516282 102 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
VAX2Q9UIW0 RNU6-612P-201ENST00000516909 102 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
VAX2Q9UIW0 AC090115.3-201ENST00000553218 849 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
VAX2Q9UIW0 HIF1AP1-201ENST00000553642 175 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
VAX2Q9UIW0 AL161670.1-201ENST00000554348 137 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
VAX2Q9UIW0 AC015720.1-201ENST00000565251 277 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
VAX2Q9UIW0 AL391840.1-201ENST00000571144 367 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
VAX2Q9UIW0 Z94722.1-201ENST00000604328 474 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
VAX2Q9UIW0 AC104458.1-201ENST00000608243 463 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
VAX2Q9UIW0 MIR8065-201ENST00000620577 100 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
VAX2Q9UIW0 AC091931.1-201ENST00000623488 728 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
VAX2Q9UIW0 LINC01359-207ENST00000634799 487 ntTSL 5 BASIC0.97□□□□□ -2.25
VAX2Q9UIW0 MIR338-201ENST00000636369 67 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
VAX2Q9UIW0 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.96□□□□□ -2.26
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.226-201ENST00000364337 114 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
VAX2Q9UIW0 C20orf187-201ENST00000378252 446 ntTSL 2 BASIC0.96□□□□□ -2.26
VAX2Q9UIW0 RNU6-1235P-201ENST00000384559 107 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
VAX2Q9UIW0 MIR1287-201ENST00000408492 90 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
VAX2Q9UIW0 RPL37P10-201ENST00000412884 288 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
VAX2Q9UIW0 RPS26P42-201ENST00000413485 326 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
VAX2Q9UIW0 TOMM22P2-201ENST00000430735 237 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
VAX2Q9UIW0 AC074290.1-201ENST00000448883 135 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
VAX2Q9UIW0 snoU13.6-201ENST00000458785 104 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
VAX2Q9UIW0 RNU1-123P-201ENST00000458950 160 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
VAX2Q9UIW0 RNU7-63P-201ENST00000459054 62 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
VAX2Q9UIW0 RNU6-498P-201ENST00000459468 107 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
VAX2Q9UIW0 LINC00971-201ENST00000482721 535 ntTSL 2 BASIC0.96□□□□□ -2.26
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.673-201ENST00000516306 88 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
VAX2Q9UIW0 MTND4P7-201ENST00000523876 130 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
VAX2Q9UIW0 AC090124.1-201ENST00000525097 448 ntTSL 3 BASIC0.96□□□□□ -2.26
VAX2Q9UIW0 AP003033.1-201ENST00000527244 415 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
VAX2Q9UIW0 DEFB131C-201ENST00000528817 165 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
VAX2Q9UIW0 CYP3A52P-201ENST00000563326 91 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
VAX2Q9UIW0 AC025887.1-201ENST00000578349 264 ntTSL 3 BASIC0.96□□□□□ -2.26
VAX2Q9UIW0 MTATP6P3-201ENST00000581686 676 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
VAX2Q9UIW0 TCL6_2.1-201ENST00000615162 119 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
VAX2Q9UIW0 uc_338.34-201ENST00000617467 174 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
VAX2Q9UIW0 SRP54-214ENST00000630962 162 ntTSL 5 BASIC0.96□□□□□ -2.26
VAX2Q9UIW0 UBE3A-225ENST00000636667 5726 ntTSL 5 BASIC0.95□□□□□ -2.26
VAX2Q9UIW0 snoU2-30.2-201ENST00000362805 70 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
VAX2Q9UIW0 AL135923.1-201ENST00000413066 196 ntTSL 3 BASIC0.95□□□□□ -2.26
VAX2Q9UIW0 AC009299.3-201ENST00000421122 1072 ntTSL 3 BASIC0.95□□□□□ -2.26
VAX2Q9UIW0 AL591704.2-201ENST00000421658 181 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
VAX2Q9UIW0 Z82205.1-201ENST00000428456 297 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
VAX2Q9UIW0 LINC01073-201ENST00000441659 149 ntTSL 3 BASIC0.95□□□□□ -2.26
VAX2Q9UIW0 RNU7-180P-201ENST00000459240 63 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
VAX2Q9UIW0 U8.21-201ENST00000459536 136 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
VAX2Q9UIW0 RNU6-430P-201ENST00000517078 107 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
VAX2Q9UIW0 AC087518.1-201ENST00000524098 187 ntTSL 3 BASIC0.95□□□□□ -2.26
VAX2Q9UIW0 MDM2-233ENST00000545204 398 ntTSL 5 BASIC0.95□□□□□ -2.26
VAX2Q9UIW0 CR936218.1-201ENST00000570454 304 ntTSL 2 BASIC0.95□□□□□ -2.26
VAX2Q9UIW0 AC002558.3-201ENST00000574021 401 ntTSL 3 BASIC0.95□□□□□ -2.26
VAX2Q9UIW0 MIR5583-1-201ENST00000580941 59 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
VAX2Q9UIW0 MIR5006-201ENST00000583027 110 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
VAX2Q9UIW0 AC040896.1-201ENST00000613819 479 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
VAX2Q9UIW0 MPP6-209ENST00000625307 126 ntTSL 5 BASIC0.95□□□□□ -2.26
VAX2Q9UIW0 AL391987.6-201ENST00000305671 199 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
VAX2Q9UIW0 RNU6-534P-201ENST00000364877 106 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
VAX2Q9UIW0 MIR513A1-201ENST00000385138 129 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
VAX2Q9UIW0 CDK8P2-201ENST00000415020 547 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
VAX2Q9UIW0 USP9YP14-201ENST00000430663 563 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
VAX2Q9UIW0 AL358934.1-201ENST00000432346 324 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
VAX2Q9UIW0 AL122017.1-201ENST00000435858 784 ntTSL 2 BASIC0.94□□□□□ -2.26
VAX2Q9UIW0 AC008080.3-201ENST00000440074 380 ntTSL 3 BASIC0.94□□□□□ -2.26
VAX2Q9UIW0 AL136972.1-201ENST00000443471 351 ntTSL 3 BASIC0.94□□□□□ -2.26
VAX2Q9UIW0 RNU7-95P-201ENST00000459222 64 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
VAX2Q9UIW0 OR2A41P-201ENST00000473586 105 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
VAX2Q9UIW0 AC005840.1-201ENST00000498412 377 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
VAX2Q9UIW0 SNORA14.1-201ENST00000516113 141 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
VAX2Q9UIW0 MTCO2P4-201ENST00000517968 247 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
VAX2Q9UIW0 RNU6-323P-201ENST00000521915 107 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
VAX2Q9UIW0 AL512310.8-201ENST00000550183 120 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
VAX2Q9UIW0 MIR4303-201ENST00000581299 66 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
VAX2Q9UIW0 AC004223.2-201ENST00000590309 544 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
VAX2Q9UIW0 AL365434.2-201ENST00000607979 234 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
VAX2Q9UIW0 AC099654.5-201ENST00000636479 350 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
VAX2Q9UIW0 GAGE12B-201ENST00000361446 117 ntAPPRIS P1 BASIC0.93□□□□□ -2.26
VAX2Q9UIW0 RNU6-1123P-201ENST00000362347 106 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
VAX2Q9UIW0 RNA5SP327-201ENST00000362494 101 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
VAX2Q9UIW0 SNORA25.9-201ENST00000365087 128 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
VAX2Q9UIW0 RNU6-996P-201ENST00000365438 107 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
VAX2Q9UIW0 SNORA70.7-201ENST00000384159 133 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
VAX2Q9UIW0 SNORA29-201ENST00000384183 140 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
VAX2Q9UIW0 RNU6-975P-201ENST00000384296 105 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
VAX2Q9UIW0 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126.7 ms