Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 AP001318.2-201ENST00000533378 492 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
EHD3Q9NZN3 LINC02309-201ENST00000553679 207 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
EHD3Q9NZN3 LINC01570-201ENST00000561572 434 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
EHD3Q9NZN3 CYP4A27P-201ENST00000567218 190 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
EHD3Q9NZN3 MIR3136-201ENST00000583498 78 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
EHD3Q9NZN3 AL034555.1-201ENST00000604816 211 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
EHD3Q9NZN3 MIR8057-201ENST00000620957 69 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
EHD3Q9NZN3 MIR6733-201ENST00000635723 61 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
EHD3Q9NZN3 AL445259.1-201ENST00000587106 2984 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
EHD3Q9NZN3 PLS1-201ENST00000337777 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
EHD3Q9NZN3 ZNF204P-201ENST00000416749 2397 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
EHD3Q9NZN3 ZBBX-201ENST00000307529 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
EHD3Q9NZN3 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
EHD3Q9NZN3 CEP57L1-223ENST00000523787 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.237-201ENST00000364439 102 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.257-201ENST00000364596 102 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
EHD3Q9NZN3 RNU6-1145P-201ENST00000384246 107 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.541-201ENST00000384640 113 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
EHD3Q9NZN3 MIR181B1-201ENST00000385240 110 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
EHD3Q9NZN3 MIR208B-201ENST00000401172 77 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
EHD3Q9NZN3 CBX3P9-201ENST00000402326 552 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
EHD3Q9NZN3 AC096920.1-201ENST00000423991 241 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
EHD3Q9NZN3 AIMP1P2-201ENST00000425294 312 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
EHD3Q9NZN3 AC009414.1-201ENST00000427200 443 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
EHD3Q9NZN3 U91324.1-201ENST00000442864 447 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
EHD3Q9NZN3 AC117440.1-201ENST00000474107 571 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
EHD3Q9NZN3 RPL26P26-201ENST00000480251 434 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
EHD3Q9NZN3 RNA5SP341-201ENST00000516261 117 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
EHD3Q9NZN3 RNA5SP76-201ENST00000516277 87 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
EHD3Q9NZN3 RNU6-567P-201ENST00000516746 107 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
EHD3Q9NZN3 AC124657.1-201ENST00000527819 429 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
EHD3Q9NZN3 MDM2-232ENST00000544561 213 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
EHD3Q9NZN3 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
EHD3Q9NZN3 AC024270.4-201ENST00000570202 421 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
EHD3Q9NZN3 MIR3200-201ENST00000580767 85 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
EHD3Q9NZN3 AC010900.2-201ENST00000604508 210 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
EHD3Q9NZN3 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
EHD3Q9NZN3 AL162274.2-201ENST00000614406 332 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
EHD3Q9NZN3 AL357075.2-201ENST00000614906 189 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
EHD3Q9NZN3 AC007318.2-201ENST00000620999 243 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
EHD3Q9NZN3 AL161431.1-201ENST00000618966 4205 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
EHD3Q9NZN3 GABRG2-209ENST00000638660 3799 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
EHD3Q9NZN3 CDC27-207ENST00000531206 3177 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
EHD3Q9NZN3 N4BP2L2-205ENST00000446957 2071 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
EHD3Q9NZN3 ZBBX-202ENST00000392764 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
EHD3Q9NZN3 MIR422A-201ENST00000362286 90 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
EHD3Q9NZN3 RNU6-961P-201ENST00000363893 105 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
EHD3Q9NZN3 SNORA20.1-201ENST00000364790 130 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
EHD3Q9NZN3 RNU6-378P-201ENST00000384324 107 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
EHD3Q9NZN3 RNU6-1026P-201ENST00000384465 108 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
EHD3Q9NZN3 MIR186-201ENST00000384988 86 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
EHD3Q9NZN3 U3.26-201ENST00000391236 204 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
EHD3Q9NZN3 SNORD88.1-201ENST00000408684 91 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
EHD3Q9NZN3 SMG7-AS1-202ENST00000432837 466 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
EHD3Q9NZN3 AC005002.2-201ENST00000438228 269 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
EHD3Q9NZN3 AL118523.1-201ENST00000444436 480 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
EHD3Q9NZN3 IFT74-AS1-201ENST00000456198 405 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
EHD3Q9NZN3 snoU13.14-201ENST00000459372 104 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
EHD3Q9NZN3 RPL27AP5-201ENST00000469428 449 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
EHD3Q9NZN3 RPS29P2-201ENST00000479278 136 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
EHD3Q9NZN3 AC103975.1-201ENST00000482506 483 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
EHD3Q9NZN3 AC116563.1-201ENST00000505454 396 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
EHD3Q9NZN3 RNU6-1023P-201ENST00000516137 106 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
EHD3Q9NZN3 SNORA31.6-201ENST00000516241 130 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
EHD3Q9NZN3 RNA5SP54-201ENST00000516951 92 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
EHD3Q9NZN3 Z82195.2-201ENST00000612348 18351 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
EHD3Q9NZN3 PSG1-205ENST00000595124 1692 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
EHD3Q9NZN3 AC009487.2-201ENST00000420969 6821 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
EHD3Q9NZN3 HELLS-201ENST00000239026 2740 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
EHD3Q9NZN3 SLCO1B3-201ENST00000261196 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
EHD3Q9NZN3 AL391987.6-201ENST00000305671 199 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
EHD3Q9NZN3 RNU1-105P-201ENST00000363470 161 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
EHD3Q9NZN3 RNU6-280P-201ENST00000364145 104 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
EHD3Q9NZN3 SNORA71.1-201ENST00000364523 117 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.581-201ENST00000391017 97 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
EHD3Q9NZN3 AC121342.1-201ENST00000423914 550 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
EHD3Q9NZN3 AC139712.2-201ENST00000424302 339 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
EHD3Q9NZN3 AC112220.1-201ENST00000434628 355 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
EHD3Q9NZN3 LINC02041-201ENST00000440726 246 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
EHD3Q9NZN3 AC007215.1-201ENST00000464893 276 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
EHD3Q9NZN3 RPL23AP70-201ENST00000483361 460 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
EHD3Q9NZN3 RPL36AP48-201ENST00000485521 314 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
EHD3Q9NZN3 HMGB3P17-201ENST00000504195 649 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
EHD3Q9NZN3 VTRNA2-2P-201ENST00000516091 103 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
EHD3Q9NZN3 RNU6-496P-201ENST00000516145 99 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
EHD3Q9NZN3 RNU6-1338P-201ENST00000516328 91 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
EHD3Q9NZN3 SNORA25.14-201ENST00000516481 132 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
EHD3Q9NZN3 MIR3923-201ENST00000579521 83 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
EHD3Q9NZN3 AP005062.1-201ENST00000581502 607 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
EHD3Q9NZN3 AC023043.3-201ENST00000593113 385 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
EHD3Q9NZN3 MZT1P2-201ENST00000604387 248 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
EHD3Q9NZN3 AC103858.1-201ENST00000607019 476 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
EHD3Q9NZN3 ST7-AS1_1.1-201ENST00000611142 116 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
EHD3Q9NZN3 AC010999.1-201ENST00000611856 324 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
EHD3Q9NZN3 NPPA-AS1_3.1-201ENST00000617059 108 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
EHD3Q9NZN3 TBC1D31-214ENST00000522420 3167 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
EHD3Q9NZN3 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
EHD3Q9NZN3 TCF12-203ENST00000343827 3956 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
EHD3Q9NZN3 RNU4-15P-201ENST00000362613 141 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
EHD3Q9NZN3 SNORD27-201ENST00000363981 72 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 130.8 ms