Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ7

USP29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, humanhuman

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Length 922 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP29Q9HBJ7 Y_RNA.715-201ENST00000517082 110 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
USP29Q9HBJ7 MIR2355-201ENST00000517199 87 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
USP29Q9HBJ7 AL442163.3-201ENST00000554110 156 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
USP29Q9HBJ7 AC073410.2-201ENST00000603240 332 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
USP29Q9HBJ7 LUZP4-201ENST00000371920 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
USP29Q9HBJ7 RGPD6-201ENST00000329516 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
USP29Q9HBJ7 RNU6-137P-201ENST00000363680 108 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
USP29Q9HBJ7 RNA5SP201-201ENST00000410316 124 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
USP29Q9HBJ7 AL513477.1-202ENST00000417061 214 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
USP29Q9HBJ7 AC097463.2-201ENST00000421074 142 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
USP29Q9HBJ7 IKZF2-209ENST00000442445 551 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
USP29Q9HBJ7 AC073325.1-201ENST00000443714 542 ntTSL 4 BASIC2.74□□□□□ -1.97
USP29Q9HBJ7 Z96811.1-201ENST00000445880 108 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
USP29Q9HBJ7 AC108938.1-201ENST00000451204 136 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
USP29Q9HBJ7 LINC01032-201ENST00000451690 276 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
USP29Q9HBJ7 MTCO3P8-201ENST00000453691 755 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
USP29Q9HBJ7 SNORA25.11-201ENST00000515935 105 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
USP29Q9HBJ7 RNU6-58P-201ENST00000517143 103 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
USP29Q9HBJ7 CYP4A27P-201ENST00000567218 190 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
USP29Q9HBJ7 AL355297.3-201ENST00000604082 446 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
USP29Q9HBJ7 AL034555.1-201ENST00000604816 211 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
USP29Q9HBJ7 DLEU2_2.2-201ENST00000615474 90 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
USP29Q9HBJ7 AC010297.1-201ENST00000623948 149 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
USP29Q9HBJ7 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
USP29Q9HBJ7 AC026241.1-201ENST00000517873 2142 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
USP29Q9HBJ7 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
USP29Q9HBJ7 Y_RNA.27-201ENST00000362540 103 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
USP29Q9HBJ7 RNU4-15P-201ENST00000362613 141 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
USP29Q9HBJ7 RNU6-1301P-201ENST00000362724 104 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
USP29Q9HBJ7 RNU6-1210P-201ENST00000363775 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
USP29Q9HBJ7 Y_RNA.319-201ENST00000365138 92 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
USP29Q9HBJ7 RNU6-26P-201ENST00000383985 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
USP29Q9HBJ7 Y_RNA.551-201ENST00000384661 102 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
USP29Q9HBJ7 MIR10B-201ENST00000385011 110 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
USP29Q9HBJ7 MIR628-201ENST00000385229 95 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
USP29Q9HBJ7 RNU6-159P-201ENST00000391080 106 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
USP29Q9HBJ7 CBX3P9-201ENST00000402326 552 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
USP29Q9HBJ7 AC026355.1-201ENST00000423466 587 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
USP29Q9HBJ7 EIF4EP4-201ENST00000424916 578 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
USP29Q9HBJ7 AL132875.2-201ENST00000436418 325 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
USP29Q9HBJ7 RPS15AP7-201ENST00000439294 405 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
USP29Q9HBJ7 AL118523.1-201ENST00000444436 480 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
USP29Q9HBJ7 AC073910.1-201ENST00000445047 438 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
USP29Q9HBJ7 FCF1P4-201ENST00000448326 183 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
USP29Q9HBJ7 AC010469.2-201ENST00000496412 480 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
USP29Q9HBJ7 MTCO2P24-201ENST00000515611 426 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
USP29Q9HBJ7 RNU6-1114P-201ENST00000516022 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
USP29Q9HBJ7 AC022784.2-201ENST00000521298 328 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
USP29Q9HBJ7 AL157688.1-201ENST00000555990 369 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
USP29Q9HBJ7 AC084882.1-201ENST00000561254 555 ntTSL 4 BASIC2.73□□□□□ -1.97
USP29Q9HBJ7 AL356575.1-201ENST00000603008 283 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
USP29Q9HBJ7 MIR7515-201ENST00000637837 67 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
USP29Q9HBJ7 Z75746.1-201ENST00000440243 2080 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
USP29Q9HBJ7 N4BP2L2-205ENST00000446957 2071 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
USP29Q9HBJ7 ZMYM1-203ENST00000373330 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
USP29Q9HBJ7 AASDH-207ENST00000513376 3241 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
USP29Q9HBJ7 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
USP29Q9HBJ7 GAGE12B-201ENST00000361446 117 ntAPPRIS P1 BASIC2.72□□□□□ -1.97
USP29Q9HBJ7 RNU6-655P-201ENST00000362858 107 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
USP29Q9HBJ7 Y_RNA.144-201ENST00000363521 113 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
USP29Q9HBJ7 RNY3P4-201ENST00000384428 101 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
USP29Q9HBJ7 Y_RNA.526-201ENST00000384572 110 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
USP29Q9HBJ7 MIR592-201ENST00000384959 97 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
USP29Q9HBJ7 MIR627-201ENST00000384979 97 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
USP29Q9HBJ7 DPH3P2-201ENST00000422618 250 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
USP29Q9HBJ7 OOSP1P1-201ENST00000423265 274 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
USP29Q9HBJ7 USP9YP16-201ENST00000430287 407 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
USP29Q9HBJ7 MTCYBP9-201ENST00000431021 303 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
USP29Q9HBJ7 LINC00459-201ENST00000431656 376 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
USP29Q9HBJ7 LINC02336-201ENST00000434117 330 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
USP29Q9HBJ7 KCNJ6-AS1-201ENST00000435001 357 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
USP29Q9HBJ7 AC096638.1-201ENST00000444678 216 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
USP29Q9HBJ7 EEF1B2P7-201ENST00000451177 676 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
USP29Q9HBJ7 USP9YP23-201ENST00000455085 407 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
USP29Q9HBJ7 AC007215.1-201ENST00000464893 276 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
USP29Q9HBJ7 HYDIN2-201ENST00000493714 554 ntTSL 4 BASIC2.72□□□□□ -1.97
USP29Q9HBJ7 AC074131.1-201ENST00000514662 253 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
USP29Q9HBJ7 RNU2-53P-201ENST00000516257 147 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
USP29Q9HBJ7 RNU6-567P-201ENST00000516746 107 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
USP29Q9HBJ7 AC131281.1-201ENST00000522984 164 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
USP29Q9HBJ7 RRAS2-211ENST00000537760 2034 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
USP29Q9HBJ7 COPS2-203ENST00000542928 1580 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
USP29Q9HBJ7 AC126323.6-201ENST00000561701 451 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
USP29Q9HBJ7 UBL5P4-201ENST00000562584 236 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
USP29Q9HBJ7 MIR3616-201ENST00000584070 92 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
USP29Q9HBJ7 MIR4765-201ENST00000585007 77 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
USP29Q9HBJ7 AC125232.2-201ENST00000592457 143 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
USP29Q9HBJ7 AC130469.1-201ENST00000597256 388 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
USP29Q9HBJ7 TTK-211ENST00000627129 240 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
USP29Q9HBJ7 HMHB1-202ENST00000638299 126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
USP29Q9HBJ7 ERBIN-202ENST00000380935 6692 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.97
USP29Q9HBJ7 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
USP29Q9HBJ7 RNU6-1159P-201ENST00000362933 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
USP29Q9HBJ7 RNU1-72P-201ENST00000362976 153 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
USP29Q9HBJ7 VTRNA1-1-201ENST00000363120 99 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
USP29Q9HBJ7 RNU4-50P-201ENST00000364361 141 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
USP29Q9HBJ7 SNORA63.7-201ENST00000365579 123 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
USP29Q9HBJ7 DEFB119-202ENST00000376315 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
USP29Q9HBJ7 RNU6-318P-201ENST00000384283 103 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
USP29Q9HBJ7 RNU6-378P-201ENST00000384324 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
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