Protein–RNA interactions for Protein: Q96A33

CCDC47, Coiled-coil domain-containing protein 47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC47Q96A33 RPS27P16-201ENST00000425758 201 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CCDC47Q96A33 CST2P1-201ENST00000425770 87 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CCDC47Q96A33 AC027119.1-201ENST00000440877 241 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CCDC47Q96A33 AC016717.1-201ENST00000448918 286 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CCDC47Q96A33 OR2AQ1P-201ENST00000451972 200 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CCDC47Q96A33 AC016885.2-201ENST00000522598 261 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
CCDC47Q96A33 OSBPL9P5-201ENST00000542581 171 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CCDC47Q96A33 AL118558.2-201ENST00000556294 238 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CCDC47Q96A33 AC026470.2-201ENST00000561492 181 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CCDC47Q96A33 AC119751.7-201ENST00000600494 245 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CCDC47Q96A33 Z99497.2-201ENST00000603634 310 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CCDC47Q96A33 AL353149.1-201ENST00000610667 244 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CCDC47Q96A33 TCL6_2.1-201ENST00000615162 119 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CCDC47Q96A33 MPP6-209ENST00000625307 126 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
CCDC47Q96A33 FER-210ENST00000628534 558 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
CCDC47Q96A33 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
CCDC47Q96A33 GAGE12B-201ENST00000361446 117 ntAPPRIS P1 BASIC1.54□□□□□ -2.16
CCDC47Q96A33 RNU4-66P-201ENST00000365199 138 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CCDC47Q96A33 Y_RNA.378-201ENST00000365652 113 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CCDC47Q96A33 RNU6-1286P-201ENST00000383871 107 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CCDC47Q96A33 RNU6-331P-201ENST00000384724 107 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CCDC47Q96A33 MRPL35P1-201ENST00000404272 572 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CCDC47Q96A33 RNU4-55P-201ENST00000410731 137 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CCDC47Q96A33 AF124730.1-201ENST00000430001 327 ntTSL 2 BASIC1.54□□□□□ -2.16
CCDC47Q96A33 AC073910.1-201ENST00000445047 438 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CCDC47Q96A33 AC116666.1-201ENST00000453915 551 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
CCDC47Q96A33 snoU13.27-201ENST00000459278 104 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CCDC47Q96A33 AC098862.1-201ENST00000504991 413 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CCDC47Q96A33 TRAPPC2P7-201ENST00000509650 231 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CCDC47Q96A33 BMPR1B-AS1-201ENST00000510795 511 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
CCDC47Q96A33 NTS-203ENST00000551529 801 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
CCDC47Q96A33 SCOCP1-201ENST00000554676 349 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CCDC47Q96A33 MIR3937-201ENST00000580135 106 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CCDC47Q96A33 AP000907.4-201ENST00000604143 237 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CCDC47Q96A33 AL121757.2-201ENST00000611223 313 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CCDC47Q96A33 DLEU2_1.1-201ENST00000612089 120 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CCDC47Q96A33 DLEU2_1.2-201ENST00000614667 120 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CCDC47Q96A33 AL359697.1-201ENST00000624879 587 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CCDC47Q96A33 MIR338-201ENST00000636369 67 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CCDC47Q96A33 RNU4-13P-201ENST00000364019 141 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CCDC47Q96A33 RNU6-968P-201ENST00000384076 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CCDC47Q96A33 SNORD116-8-201ENST00000384365 95 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CCDC47Q96A33 MIR549A-201ENST00000385268 96 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CCDC47Q96A33 MTCO1P19-201ENST00000443487 500 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CCDC47Q96A33 RNU6-948P-201ENST00000516374 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CCDC47Q96A33 MRPS36P4-201ENST00000534436 298 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CCDC47Q96A33 RRN3P3-201ENST00000549207 578 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CCDC47Q96A33 AC008269.2-201ENST00000561915 1105 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CCDC47Q96A33 MIR5692C1-201ENST00000585309 91 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CCDC47Q96A33 AL645939.4-201ENST00000604495 135 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CCDC47Q96A33 RMST_3.1-201ENST00000611651 109 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CCDC47Q96A33 AC139792.3-201ENST00000623525 224 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CCDC47Q96A33 RNU6-38P-201ENST00000384085 107 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CCDC47Q96A33 Y_RNA.553-201ENST00000384670 102 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CCDC47Q96A33 RPS26P42-201ENST00000413485 326 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CCDC47Q96A33 LINC01412-201ENST00000413525 362 ntTSL 2 BASIC1.52□□□□□ -2.17
CCDC47Q96A33 AL161935.2-201ENST00000414627 60 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CCDC47Q96A33 AC114982.1-201ENST00000469402 321 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CCDC47Q96A33 RPL30P7-201ENST00000479312 323 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CCDC47Q96A33 SNORA19.2-201ENST00000516013 114 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CCDC47Q96A33 RNA5SP61-201ENST00000516453 100 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CCDC47Q96A33 RNU1-92P-201ENST00000517017 135 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CCDC47Q96A33 RAB11AP2-201ENST00000545905 639 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CCDC47Q96A33 EAF1-AS1-207ENST00000599742 772 ntTSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
CCDC47Q96A33 AP003465.2-201ENST00000602571 373 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CCDC47Q96A33 AL078604.3-201ENST00000615580 211 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CCDC47Q96A33 ZNF209P-201ENST00000593450 2304 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CCDC47Q96A33 RNU6-975P-201ENST00000384296 105 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CCDC47Q96A33 RNU6-1235P-201ENST00000384559 107 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CCDC47Q96A33 MIR758-201ENST00000390227 88 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CCDC47Q96A33 TRAJ6-201ENST00000390531 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.51□□□□□ -2.17
CCDC47Q96A33 COX6CP10-201ENST00000416832 224 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CCDC47Q96A33 LINC01701-201ENST00000419614 451 ntTSL 2 BASIC1.51□□□□□ -2.17
CCDC47Q96A33 AL592431.2-201ENST00000422198 171 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
CCDC47Q96A33 AC035139.1-201ENST00000423256 273 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
CCDC47Q96A33 TIMM9P3-201ENST00000428659 274 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CCDC47Q96A33 AP001043.2-201ENST00000434589 288 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
CCDC47Q96A33 AL132875.2-201ENST00000436418 325 ntTSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
CCDC47Q96A33 AL359672.1-201ENST00000442302 409 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CCDC47Q96A33 AC009237.7-201ENST00000447357 229 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CCDC47Q96A33 NFU1P2-201ENST00000448700 469 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CCDC47Q96A33 MTCO3P8-201ENST00000453691 755 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CCDC47Q96A33 RNU6-498P-201ENST00000459468 107 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CCDC47Q96A33 AC010420.1-201ENST00000515077 509 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
CCDC47Q96A33 AL157687.1-201ENST00000554853 619 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CCDC47Q96A33 AC015688.6-201ENST00000577737 104 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CCDC47Q96A33 MTND5P35-201ENST00000557537 1720 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CCDC47Q96A33 ELL2P3-201ENST00000457883 1602 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CCDC47Q96A33 ZNF72P-201ENST00000425869 1908 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CCDC47Q96A33 RNU6-939P-201ENST00000384634 107 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CCDC47Q96A33 RNY3P9-201ENST00000384727 106 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CCDC47Q96A33 DEFB110-202ENST00000393660 189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
CCDC47Q96A33 AC004866.1-201ENST00000411748 78 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CCDC47Q96A33 MRPS10P2-201ENST00000431226 381 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CCDC47Q96A33 AL603839.2-201ENST00000437060 546 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
CCDC47Q96A33 LINC01032-201ENST00000451690 276 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
CCDC47Q96A33 Y_RNA.654-201ENST00000497848 106 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CCDC47Q96A33 AC091133.4-201ENST00000511142 308 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CCDC47Q96A33 AC011092.2-201ENST00000533659 586 ntTSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
CCDC47Q96A33 AC023796.2-201ENST00000545410 451 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
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