Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 snoU2_19.2-201ENST00000363024 80 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
ZNF548Q8NEK5 RNU6-137P-201ENST00000363680 108 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
ZNF548Q8NEK5 RNU6-142P-201ENST00000384019 107 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
ZNF548Q8NEK5 RNU6-318P-201ENST00000384283 103 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
ZNF548Q8NEK5 MIR544A-201ENST00000384855 91 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
ZNF548Q8NEK5 MIR32-201ENST00000384965 70 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
ZNF548Q8NEK5 SNORA26.3-201ENST00000391119 136 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
ZNF548Q8NEK5 MRPL35P1-201ENST00000404272 572 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
ZNF548Q8NEK5 RNA5SP390-201ENST00000410191 113 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
ZNF548Q8NEK5 AC078809.1-201ENST00000427601 140 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
ZNF548Q8NEK5 AL135923.2-201ENST00000435444 501 ntTSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
ZNF548Q8NEK5 RPL39P40-201ENST00000445481 146 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
ZNF548Q8NEK5 AC016700.2-201ENST00000446011 156 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
ZNF548Q8NEK5 AC013727.2-201ENST00000447761 545 ntTSL 4 BASIC2.67□□□□□ -1.98
ZNF548Q8NEK5 RPS27P26-201ENST00000494583 239 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
ZNF548Q8NEK5 RPS23P5-201ENST00000495419 428 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
ZNF548Q8NEK5 NKAIN2-205ENST00000546092 148 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
ZNF548Q8NEK5 MIR3605-201ENST00000583214 100 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
ZNF548Q8NEK5 AC240442.1-201ENST00000616055 283 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
ZNF548Q8NEK5 FAM35CP-201ENST00000554755 2470 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
ZNF548Q8NEK5 ZNF626-204ENST00000612591 4404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
ZNF548Q8NEK5 VPS13A-206ENST00000376646 2262 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
ZNF548Q8NEK5 ZNF676-201ENST00000397121 2944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
ZNF548Q8NEK5 AGTR1-204ENST00000418473 2071 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
ZNF548Q8NEK5 CENPE-201ENST00000265148 8612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
ZNF548Q8NEK5 MTND5P6-201ENST00000422338 1798 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ZNF548Q8NEK5 CACNB4-238ENST00000636901 7706 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
ZNF548Q8NEK5 FNBP1L-203ENST00000370253 3889 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
ZNF548Q8NEK5 CFHR4-202ENST00000367416 2178 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
ZNF548Q8NEK5 ADAM3A-203ENST00000461344 2157 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ZNF548Q8NEK5 RNU6-858P-201ENST00000362436 107 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ZNF548Q8NEK5 RNU6-1285P-201ENST00000363480 105 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.478-201ENST00000384358 107 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ZNF548Q8NEK5 MIR215-201ENST00000384858 110 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ZNF548Q8NEK5 SNORD78.2-201ENST00000391076 69 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ZNF548Q8NEK5 AL079342.1-201ENST00000401460 267 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ZNF548Q8NEK5 AC023141.4-201ENST00000412031 328 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ZNF548Q8NEK5 LINC00407-201ENST00000426509 295 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
ZNF548Q8NEK5 EEF1B2P7-201ENST00000451177 676 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ZNF548Q8NEK5 MTND4LP30-201ENST00000454092 297 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ZNF548Q8NEK5 AP000870.1-201ENST00000472927 406 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ZNF548Q8NEK5 AC016632.1-201ENST00000503994 196 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ZNF548Q8NEK5 AC008869.1-201ENST00000510938 442 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
ZNF548Q8NEK5 LINC02233-201ENST00000513718 358 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
ZNF548Q8NEK5 RNU6-1114P-201ENST00000516022 107 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ZNF548Q8NEK5 ACA59.2-201ENST00000517061 156 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ZNF548Q8NEK5 AC093023.1-201ENST00000547375 507 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ZNF548Q8NEK5 AC090897.2-201ENST00000581715 130 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ZNF548Q8NEK5 AC012433.1-201ENST00000588916 398 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.772-201ENST00000606692 102 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ZNF548Q8NEK5 MIR376A1-201ENST00000616574 68 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ZNF548Q8NEK5 AC137590.2-201ENST00000619709 240 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ZNF548Q8NEK5 AC002064.3-201ENST00000623448 346 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ZNF548Q8NEK5 WDR3-201ENST00000349139 9974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
ZNF548Q8NEK5 AL161431.1-201ENST00000618966 4205 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ZNF548Q8NEK5 SENP7-205ENST00000394091 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
ZNF548Q8NEK5 AC092268.1-201ENST00000342691 405 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
ZNF548Q8NEK5 MIR26A1-201ENST00000362205 77 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.20-201ENST00000362479 113 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
ZNF548Q8NEK5 SNORD81.1-201ENST00000363064 77 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
ZNF548Q8NEK5 SNORD115-8-201ENST00000363856 82 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
ZNF548Q8NEK5 SNORD115-38-201ENST00000365037 82 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
ZNF548Q8NEK5 MIR887-201ENST00000401258 79 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
ZNF548Q8NEK5 RNU2-64P-201ENST00000411315 191 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
ZNF548Q8NEK5 RPS15AP5-201ENST00000436276 388 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
ZNF548Q8NEK5 AC096638.1-201ENST00000444678 216 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
ZNF548Q8NEK5 RPS3P1-201ENST00000456781 192 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
ZNF548Q8NEK5 AC116563.1-201ENST00000505454 396 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
ZNF548Q8NEK5 AC096725.1-201ENST00000514266 313 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
ZNF548Q8NEK5 SNORA31.6-201ENST00000516241 130 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
ZNF548Q8NEK5 AC022868.1-201ENST00000517767 391 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
ZNF548Q8NEK5 HSPE1P4-201ENST00000550617 308 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
ZNF548Q8NEK5 AC009120.5-201ENST00000561669 475 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
ZNF548Q8NEK5 MIR6817-201ENST00000615588 66 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
ZNF548Q8NEK5 Clostridiales-1.2-201ENST00000636724 160 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
ZNF548Q8NEK5 AC111000.4-202ENST00000505646 2648 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
ZNF548Q8NEK5 OR5V1-217ENST00000641768 2763 ntAPPRIS P1 BASIC2.65□□□□□ -1.99
ZNF548Q8NEK5 AC099654.7-201ENST00000635788 2127 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
ZNF548Q8NEK5 LINC01938-201ENST00000521341 1864 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
ZNF548Q8NEK5 FGF14-201ENST00000376131 12882 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
ZNF548Q8NEK5 SNORA20.1-201ENST00000364790 130 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.504-201ENST00000384481 104 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
ZNF548Q8NEK5 MIR592-201ENST00000384959 97 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
ZNF548Q8NEK5 MIR10B-201ENST00000385011 110 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.581-201ENST00000391017 97 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
ZNF548Q8NEK5 SNORD58.1-201ENST00000391313 66 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
ZNF548Q8NEK5 RPS26P42-201ENST00000413485 326 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
ZNF548Q8NEK5 LINC02331-201ENST00000418927 602 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
ZNF548Q8NEK5 AC096920.1-201ENST00000423991 241 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
ZNF548Q8NEK5 AC004383.1-201ENST00000438135 289 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
ZNF548Q8NEK5 RPS15AP7-201ENST00000439294 405 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
ZNF548Q8NEK5 AL161651.1-201ENST00000440882 223 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
ZNF548Q8NEK5 AC117462.1-201ENST00000461186 554 ntTSL 4 BASIC2.64□□□□□ -1.99
ZNF548Q8NEK5 RPS27AP9-201ENST00000477681 438 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
ZNF548Q8NEK5 SRI-210ENST00000490437 570 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
ZNF548Q8NEK5 RNU5F-8P-201ENST00000515941 111 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
ZNF548Q8NEK5 SNORD19.2-201ENST00000516978 73 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
ZNF548Q8NEK5 AC021231.3-201ENST00000558497 370 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
ZNF548Q8NEK5 MIR4659A-201ENST00000580269 81 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
ZNF548Q8NEK5 AC008739.2-201ENST00000597006 317 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
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