Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 DEFB113-201ENST00000398718 249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
ANKRD39Q53RE8 RN7SKP156-201ENST00000410308 342 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
ANKRD39Q53RE8 AC006461.1-201ENST00000412637 326 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
ANKRD39Q53RE8 AL135786.1-201ENST00000415892 214 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
ANKRD39Q53RE8 AP001043.2-201ENST00000434589 288 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
ANKRD39Q53RE8 LINC02041-201ENST00000440726 246 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
ANKRD39Q53RE8 AC010531.2-201ENST00000465012 153 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
ANKRD39Q53RE8 RN7SL222P-201ENST00000476452 299 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
ANKRD39Q53RE8 RPL36AP21-201ENST00000490372 323 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
ANKRD39Q53RE8 RN7SL244P-201ENST00000493405 297 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
ANKRD39Q53RE8 RPL31P61-201ENST00000496160 376 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
ANKRD39Q53RE8 SNORA48.11-201ENST00000517015 89 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
ANKRD39Q53RE8 AC006130.2-201ENST00000586202 326 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.778-201ENST00000620203 90 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
ANKRD39Q53RE8 AC091895.1-201ENST00000624494 256 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.215-201ENST00000364204 112 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
ANKRD39Q53RE8 SNORA37-201ENST00000384504 129 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
ANKRD39Q53RE8 AC013248.1-201ENST00000455092 232 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
ANKRD39Q53RE8 RN7SL442P-201ENST00000473804 320 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
ANKRD39Q53RE8 AC098818.1-201ENST00000478593 252 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
ANKRD39Q53RE8 RN7SL319P-201ENST00000480656 221 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
ANKRD39Q53RE8 RPS29P21-201ENST00000496272 170 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
ANKRD39Q53RE8 SAR1B-211ENST00000509937 455 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
ANKRD39Q53RE8 AC016553.1-201ENST00000513283 249 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
ANKRD39Q53RE8 SNORD116-25-201ENST00000516517 92 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
ANKRD39Q53RE8 RPPH1-2P-201ENST00000516688 293 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
ANKRD39Q53RE8 AC090155.2-201ENST00000518854 267 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
ANKRD39Q53RE8 AC138625.2-201ENST00000563968 551 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
ANKRD39Q53RE8 MIR4505-201ENST00000582238 73 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
ANKRD39Q53RE8 AC090115.4-201ENST00000609970 188 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
ANKRD39Q53RE8 AL391903.3-201ENST00000612158 163 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
ANKRD39Q53RE8 OR13C1P-202ENST00000641378 2919 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
ANKRD39Q53RE8 AC008264.2-201ENST00000610193 3731 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
ANKRD39Q53RE8 ZNF483-201ENST00000309235 3655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
ANKRD39Q53RE8 CCSAP-202ENST00000366686 4399 ntTSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
ANKRD39Q53RE8 CEP152-203ENST00000399334 5097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
ANKRD39Q53RE8 USH2A-201ENST00000307340 18883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
ANKRD39Q53RE8 CENPCP1-201ENST00000533085 2578 ntBASIC3.03□□□□□ -1.93
ANKRD39Q53RE8 EYA4-202ENST00000355286 4317 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
ANKRD39Q53RE8 SLC6A15-203ENST00000450363 4229 ntTSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
ANKRD39Q53RE8 SLC16A7-201ENST00000261187 11777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
ANKRD39Q53RE8 CFH-202ENST00000367429 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
ANKRD39Q53RE8 TMPRSS11A-201ENST00000334830 3054 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
ANKRD39Q53RE8 ANP32E-209ENST00000616917 2989 ntTSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
ANKRD39Q53RE8 MBNL1-223ENST00000498502 5258 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
ANKRD39Q53RE8 AC110597.3-202ENST00000583493 3289 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
ANKRD39Q53RE8 ZNF638-203ENST00000409544 6821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
ANKRD39Q53RE8 RNU6-728P-201ENST00000365375 104 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
ANKRD39Q53RE8 MIR627-201ENST00000384979 97 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
ANKRD39Q53RE8 RNU6-220P-201ENST00000390919 107 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP344-201ENST00000411081 104 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
ANKRD39Q53RE8 HMGN2P35-201ENST00000412164 270 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
ANKRD39Q53RE8 AC114755.2-201ENST00000413520 361 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
ANKRD39Q53RE8 AC016909.1-201ENST00000415916 166 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
ANKRD39Q53RE8 AL133268.4-201ENST00000424868 472 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
ANKRD39Q53RE8 MTCO1P44-201ENST00000441935 243 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
ANKRD39Q53RE8 AL357134.1-201ENST00000445848 426 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
ANKRD39Q53RE8 RNU6-437P-201ENST00000459408 95 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
ANKRD39Q53RE8 AC097484.1-201ENST00000471148 389 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
ANKRD39Q53RE8 RN7SL499P-201ENST00000481141 276 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
ANKRD39Q53RE8 AC107934.2-201ENST00000518653 310 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
ANKRD39Q53RE8 AC068657.1-201ENST00000520807 306 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
ANKRD39Q53RE8 AC127455.1-201ENST00000565496 145 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
ANKRD39Q53RE8 AC090616.3-201ENST00000582184 217 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
ANKRD39Q53RE8 MIR3117-201ENST00000584034 78 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
ANKRD39Q53RE8 MIR4438-201ENST00000585271 93 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
ANKRD39Q53RE8 ARF4P1-201ENST00000605447 541 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
ANKRD39Q53RE8 SKIL-203ENST00000426052 2757 ntTSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
ANKRD39Q53RE8 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
ANKRD39Q53RE8 GABRG2-210ENST00000638772 7669 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
ANKRD39Q53RE8 TCF12-203ENST00000343827 3956 ntTSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
ANKRD39Q53RE8 MINDY3-202ENST00000378036 2452 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
ANKRD39Q53RE8 ATP2C1-202ENST00000359644 3401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.337-201ENST00000365312 102 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
ANKRD39Q53RE8 RNU6-376P-201ENST00000384731 106 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
ANKRD39Q53RE8 MIR548I2-201ENST00000408348 149 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
ANKRD39Q53RE8 RPS29P31-201ENST00000446147 164 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP271-201ENST00000516700 88 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
ANKRD39Q53RE8 RNU7-172P-201ENST00000517125 64 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
ANKRD39Q53RE8 IGKV1-32-201ENST00000519290 311 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
ANKRD39Q53RE8 AC025884.1-201ENST00000556034 378 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
ANKRD39Q53RE8 AC010547.6-201ENST00000571789 193 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
ANKRD39Q53RE8 MIR548AI-201ENST00000579940 88 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
ANKRD39Q53RE8 MIR6737-201ENST00000617385 70 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
ANKRD39Q53RE8 KNTC1-201ENST00000333479 6975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
ANKRD39Q53RE8 DCUN1D1-208ENST00000632685 3147 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
ANKRD39Q53RE8 OR5V1-217ENST00000641768 2763 ntAPPRIS P1 BASIC3□□□□□ -1.93
ANKRD39Q53RE8 CP-201ENST00000264613 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
ANKRD39Q53RE8 SNORA17.1-201ENST00000362945 126 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ANKRD39Q53RE8 RNU4-41P-201ENST00000364426 143 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ANKRD39Q53RE8 RNU6-818P-201ENST00000364837 108 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.332-201ENST00000365271 113 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ANKRD39Q53RE8 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP332-201ENST00000391063 115 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ANKRD39Q53RE8 AL512604.1-201ENST00000404812 257 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ANKRD39Q53RE8 AF230666.1-201ENST00000429151 786 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
ANKRD39Q53RE8 AL162725.1-201ENST00000435405 301 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ANKRD39Q53RE8 AC025750.2-201ENST00000442609 450 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ANKRD39Q53RE8 Z73495.1-201ENST00000444982 147 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
ANKRD39Q53RE8 AC012671.1-201ENST00000451912 203 ntBASIC3□□□□□ -1.93
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