Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 SLC44A5-202ENST00000370859 3896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
PTPRNQ16849 MBNL1-224ENST00000545754 5147 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
PTPRNQ16849 VEZT-201ENST00000261219 3435 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
PTPRNQ16849 RANBP2-201ENST00000283195 11711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
PTPRNQ16849 MANEA-201ENST00000358812 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
PTPRNQ16849 POLR2B-201ENST00000314595 3748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
PTPRNQ16849 FMO2-201ENST00000209929 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
PTPRNQ16849 AL035415.1-201ENST00000447150 289 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
PTPRNQ16849 PPBPP1-201ENST00000510807 373 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
PTPRNQ16849 MIR449C-201ENST00000516047 92 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
PTPRNQ16849 RNU1-104P-201ENST00000517280 175 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
PTPRNQ16849 AC107934.2-201ENST00000518653 310 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
PTPRNQ16849 AC009623.2-201ENST00000522524 465 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
PTPRNQ16849 AC079598.5-201ENST00000547460 117 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
PTPRNQ16849 MIR4286-201ENST00000580651 93 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
PTPRNQ16849 MIR7151-201ENST00000617477 60 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
PTPRNQ16849 MIR6075-201ENST00000620782 95 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
PTPRNQ16849 AC090517.3-201ENST00000625170 141 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
PTPRNQ16849 ADAMTS9-AS1-207ENST00000594810 3609 ntTSL 4 BASIC4.27□□□□□ -1.73
PTPRNQ16849 AC000403.1-201ENST00000613696 3585 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
PTPRNQ16849 MS4A1-201ENST00000345732 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
PTPRNQ16849 R3HCC1L-205ENST00000612478 3337 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
PTPRNQ16849 AC110597.3-202ENST00000583493 3289 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
PTPRNQ16849 PRKAA2-202ENST00000610361 9280 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
PTPRNQ16849 ZNF43-207ENST00000595461 3399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
PTPRNQ16849 AC058791.1-201ENST00000608412 3198 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
PTPRNQ16849 QSER1-204ENST00000527788 5052 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
PTPRNQ16849 CCDC102B-201ENST00000360242 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
PTPRNQ16849 FAN1-202ENST00000561594 2738 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
PTPRNQ16849 OLFM3-206ENST00000536598 2801 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
PTPRNQ16849 RNA5SP513-201ENST00000364648 118 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
PTPRNQ16849 SNORA62.3-201ENST00000365110 153 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
PTPRNQ16849 SNORA70.4-201ENST00000365509 134 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
PTPRNQ16849 RNU6-106P-201ENST00000384405 107 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
PTPRNQ16849 MIR29B2-201ENST00000385055 81 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
PTPRNQ16849 MTATP6P21-201ENST00000440681 189 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
PTPRNQ16849 HMGN2P16-201ENST00000456802 261 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
PTPRNQ16849 AC010531.2-201ENST00000465012 153 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
PTPRNQ16849 RPS29P19-201ENST00000479709 171 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
PTPRNQ16849 UBE3AP2-201ENST00000429033 2259 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
PTPRNQ16849 TUSC7-203ENST00000477539 2415 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
PTPRNQ16849 DGKI-204ENST00000453654 12928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
PTPRNQ16849 FAM133A-202ENST00000332647 3159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
PTPRNQ16849 AF117829.1-206ENST00000621883 3802 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
PTPRNQ16849 ADGRL3-216ENST00000514157 4789 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
PTPRNQ16849 PTGFR-203ENST00000370758 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
PTPRNQ16849 CD80-201ENST00000264246 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
PTPRNQ16849 THEMIS-205ENST00000626040 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
PTPRNQ16849 ABCC9-201ENST00000261200 8293 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
PTPRNQ16849 DTWD1-201ENST00000251250 13776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
PTPRNQ16849 PHF20L1-210ENST00000395390 5900 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
PTPRNQ16849 AC000123.3-201ENST00000624029 4975 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
PTPRNQ16849 Y_RNA.203-201ENST00000364106 102 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
PTPRNQ16849 RNA5SP127-201ENST00000411051 133 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
PTPRNQ16849 CYCSP19-201ENST00000411715 316 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
PTPRNQ16849 AC105398.1-201ENST00000446073 402 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
PTPRNQ16849 S100A11P1-201ENST00000477525 312 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
PTPRNQ16849 RNU1-45P-201ENST00000517191 141 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
PTPRNQ16849 ABI3BP-206ENST00000471714 6783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
PTPRNQ16849 DMXL2-202ENST00000449909 7465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
PTPRNQ16849 DNAH6-201ENST00000237449 12666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
PTPRNQ16849 ZNF638-203ENST00000409544 6821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
PTPRNQ16849 C6orf10-209ENST00000612031 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
PTPRNQ16849 ANKRD30A-202ENST00000374660 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
PTPRNQ16849 LINC01902-202ENST00000636983 4607 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
PTPRNQ16849 LRMP-201ENST00000354454 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
PTPRNQ16849 RAPGEF6-201ENST00000296859 5618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
PTPRNQ16849 DNAH8-202ENST00000359357 13864 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
PTPRNQ16849 SELENOI-201ENST00000260585 8101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
PTPRNQ16849 RNU6-975P-201ENST00000384296 105 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
PTPRNQ16849 MIR1263-201ENST00000408324 86 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
PTPRNQ16849 RNU6-554P-201ENST00000410466 106 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
PTPRNQ16849 C1orf195-201ENST00000424792 255 ntTSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
PTPRNQ16849 AL162151.2-201ENST00000448875 158 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
PTPRNQ16849 AC016717.1-201ENST00000448918 286 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
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PTPRNQ16849 AC096577.2-201ENST00000611455 153 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
PTPRNQ16849 TJP1-204ENST00000400011 6764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
PTPRNQ16849 PIK3C2G-203ENST00000535651 2497 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
PTPRNQ16849 MYOZ2-201ENST00000307128 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
PTPRNQ16849 DMD-230ENST00000620040 13746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
PTPRNQ16849 N4BP2L2-202ENST00000357505 2917 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
PTPRNQ16849 UTRN-204ENST00000367545 12339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
PTPRNQ16849 CNTN6-201ENST00000350110 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
PTPRNQ16849 SNORD73B-201ENST00000364394 72 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
PTPRNQ16849 MIR624-201ENST00000385217 97 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
PTPRNQ16849 RPL21P65-201ENST00000406094 466 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
PTPRNQ16849 HLA-N-201ENST00000437516 135 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
PTPRNQ16849 RPL23AP46-201ENST00000438548 490 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
PTPRNQ16849 AL021397.1-201ENST00000451806 248 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
PTPRNQ16849 LINC02309-201ENST00000553679 207 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
PTPRNQ16849 CYP4A43P-201ENST00000568156 121 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
PTPRNQ16849 AC011824.2-201ENST00000579896 579 ntTSL 4 BASIC4.23□□□□□ -1.73
PTPRNQ16849 uc_338.14-201ENST00000613162 166 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
PTPRNQ16849 Pinc.1-201ENST00000616452 154 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
PTPRNQ16849 MIR6875-201ENST00000617506 72 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
PTPRNQ16849 CCNYL2-203ENST00000638057 730 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
PTPRNQ16849 RASSF6-204ENST00000395777 2735 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
PTPRNQ16849 RIMS2-201ENST00000262231 3854 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
PTPRNQ16849 ORC4-201ENST00000264169 6598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
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