Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 ZBTB20-201ENST00000357258 27125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
FXNQ16595 LUZP2-208ENST00000620308 4981 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
FXNQ16595 Y_RNA.65-201ENST00000362846 100 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
FXNQ16595 RNU6-461P-201ENST00000364195 107 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
FXNQ16595 SNORA51.4-201ENST00000364993 124 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
FXNQ16595 MIR548B-201ENST00000385247 97 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
FXNQ16595 RNU6-1199P-201ENST00000411249 104 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
FXNQ16595 AP000235.1-201ENST00000424017 479 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
FXNQ16595 TOMM22P2-201ENST00000430735 237 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
FXNQ16595 CFAP100-207ENST00000510833 481 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
FXNQ16595 AC109329.2-201ENST00000519658 482 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
FXNQ16595 AC087518.1-201ENST00000524098 187 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
FXNQ16595 AC007536.1-201ENST00000533382 349 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
FXNQ16595 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
FXNQ16595 AC004147.3-201ENST00000577709 375 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
FXNQ16595 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
FXNQ16595 DMD-203ENST00000357033 13956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
FXNQ16595 SUCNR1-201ENST00000362032 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
FXNQ16595 TRDN-201ENST00000334268 4770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
FXNQ16595 ZFYVE16-202ENST00000505560 6599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
FXNQ16595 Z82209.1-201ENST00000422141 2135 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
FXNQ16595 MCF2-204ENST00000414978 3813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
FXNQ16595 SUGT1-201ENST00000310528 14131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
FXNQ16595 Y_RNA.44-201ENST00000362676 108 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
FXNQ16595 RNU6-454P-201ENST00000364292 107 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
FXNQ16595 RNU6-546P-201ENST00000383991 107 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
FXNQ16595 RNU6-220P-201ENST00000390919 107 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
FXNQ16595 MIR300-201ENST00000401138 83 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
FXNQ16595 RN7SKP156-201ENST00000410308 342 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
FXNQ16595 RN7SKP220-201ENST00000410611 288 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
FXNQ16595 RNU2-32P-201ENST00000411193 191 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
FXNQ16595 CYCSP19-201ENST00000411715 316 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
FXNQ16595 AL139281.1-201ENST00000422120 335 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
FXNQ16595 AC090617.2-201ENST00000433167 404 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
FXNQ16595 Z96811.1-201ENST00000445880 108 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
FXNQ16595 NDUFB4P10-201ENST00000452541 359 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
FXNQ16595 HMGN1P18-201ENST00000457642 277 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
FXNQ16595 HMGN2P9-201ENST00000476875 229 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
FXNQ16595 LINC02198-202ENST00000505371 526 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
FXNQ16595 ATP5EP1-201ENST00000510257 156 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
FXNQ16595 AC136475.4-201ENST00000534271 280 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
FXNQ16595 MIR4753-201ENST00000585119 83 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
FXNQ16595 PRKACB-217ENST00000610457 4206 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
FXNQ16595 ZBBX-201ENST00000307529 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
FXNQ16595 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
FXNQ16595 NR3C1-212ENST00000504572 3389 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
FXNQ16595 SULT1B1-201ENST00000310613 7115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
FXNQ16595 AL021368.2-201ENST00000606125 5352 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
FXNQ16595 RNA5SP383-201ENST00000362934 120 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
FXNQ16595 RNA5SP240-201ENST00000365355 128 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
FXNQ16595 Y_RNA.418-201ENST00000384029 102 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
FXNQ16595 MIR134-201ENST00000385258 73 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
FXNQ16595 MIR1283-1-201ENST00000408494 87 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
FXNQ16595 RN7SKP202-201ENST00000410439 330 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
FXNQ16595 RNU2-63P-201ENST00000410792 194 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
FXNQ16595 MTCO1P5-201ENST00000433573 344 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
FXNQ16595 AL023693.1-201ENST00000434255 216 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
FXNQ16595 IGKV3D-7-201ENST00000443397 384 ntAPPRIS P1 BASIC3.28□□□□□ -1.88
FXNQ16595 Z75741.1-201ENST00000446793 314 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
FXNQ16595 AL365295.1-201ENST00000454942 514 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
FXNQ16595 SRIP1-201ENST00000489235 288 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
FXNQ16595 AC093893.1-201ENST00000505781 510 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
FXNQ16595 LINC02064-201ENST00000506492 470 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
FXNQ16595 RNU2-12P-201ENST00000517216 168 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
FXNQ16595 AC068657.1-201ENST00000520807 306 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
FXNQ16595 MIR3117-201ENST00000584034 78 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
FXNQ16595 CEP70-211ENST00000484888 1993 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
FXNQ16595 UBA5-201ENST00000264991 2850 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
FXNQ16595 KIAA1109-203ENST00000388738 15574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
FXNQ16595 NEB-204ENST00000409198 20637 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
FXNQ16595 CCSER2-201ENST00000224756 7664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
FXNQ16595 Y_RNA.136-201ENST00000363444 102 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
FXNQ16595 RNU6-324P-201ENST00000363957 106 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
FXNQ16595 MIR95-201ENST00000385072 81 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
FXNQ16595 AL357075.1-201ENST00000404107 726 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
FXNQ16595 RPS29P2-201ENST00000479278 136 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
FXNQ16595 RPL21P129-201ENST00000491732 478 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
FXNQ16595 AC137770.1-201ENST00000504620 530 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
FXNQ16595 AC113383.1-204ENST00000507060 552 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
FXNQ16595 SCARNA20.6-201ENST00000517251 106 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
FXNQ16595 AC107934.2-201ENST00000518653 310 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
FXNQ16595 AC107973.1-201ENST00000530249 576 ntTSL 4 BASIC3.27□□□□□ -1.89
FXNQ16595 AC009803.1-201ENST00000551531 416 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
FXNQ16595 RPL21P9-201ENST00000556149 474 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
FXNQ16595 MIR3145-201ENST00000580727 82 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
FXNQ16595 AL356280.1-201ENST00000603614 379 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
FXNQ16595 AL355297.2-201ENST00000604792 129 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
FXNQ16595 MIR1248-201ENST00000629190 106 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
FXNQ16595 KIAA0586-209ENST00000556134 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
FXNQ16595 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
FXNQ16595 AC017071.1-201ENST00000564407 2204 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
FXNQ16595 PIK3C2G-203ENST00000535651 2497 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
FXNQ16595 IL6ST-201ENST00000336909 8776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
FXNQ16595 RNU1-23P-201ENST00000363361 144 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
FXNQ16595 SNORD56.3-201ENST00000363507 71 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
FXNQ16595 SNORD56.5-201ENST00000364281 72 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
FXNQ16595 U8.11-201ENST00000384699 133 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
FXNQ16595 MIR887-201ENST00000401258 79 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
FXNQ16595 ATP2B2-IT1-201ENST00000440152 472 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
FXNQ16595 U8.18-201ENST00000459285 133 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
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