Protein–RNA interactions for Protein: Q16473

TNXA, Putative tenascin-XA, humanhuman

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Length 311 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNXAQ16473 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
TNXAQ16473 Y_RNA.159-201ENST00000363674 87 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
TNXAQ16473 RNU6-534P-201ENST00000364877 106 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
TNXAQ16473 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
TNXAQ16473 Y_RNA.381-201ENST00000365666 102 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
TNXAQ16473 SNORA22-201ENST00000383907 134 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
TNXAQ16473 Y_RNA.399-201ENST00000383955 105 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
TNXAQ16473 SNORA22C-201ENST00000384614 134 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
TNXAQ16473 RNU6-1093P-201ENST00000391194 107 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
TNXAQ16473 FGFR1OP2P1-201ENST00000395943 500 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
TNXAQ16473 PIGFP2-201ENST00000421400 651 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
TNXAQ16473 AL592431.2-201ENST00000422198 171 ntTSL 3 BASIC0.89□□□□□ -2.27
TNXAQ16473 AC012306.1-201ENST00000423267 114 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
TNXAQ16473 PCDH9-AS1-201ENST00000430861 532 ntTSL 2 BASIC0.89□□□□□ -2.27
TNXAQ16473 AC106892.1-201ENST00000491608 406 ntTSL 3 BASIC0.89□□□□□ -2.27
TNXAQ16473 ARL2BPP4-201ENST00000506854 471 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
TNXAQ16473 CCDC34P1-201ENST00000507441 517 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
TNXAQ16473 AC005920.2-201ENST00000509833 332 ntTSL 3 BASIC0.89□□□□□ -2.27
TNXAQ16473 RNA5SP384-201ENST00000516615 116 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
TNXAQ16473 CYCSP23-201ENST00000519781 313 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
TNXAQ16473 AP003128.1-201ENST00000531414 448 ntTSL 2 BASIC0.89□□□□□ -2.27
TNXAQ16473 AC023796.2-201ENST00000545410 451 ntTSL 3 BASIC0.89□□□□□ -2.27
TNXAQ16473 AC022596.1-201ENST00000582895 302 ntTSL 5 BASIC0.89□□□□□ -2.27
TNXAQ16473 AC087683.2-201ENST00000611384 326 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
TNXAQ16473 AC010722.1-201ENST00000622595 582 ntTSL 5 BASIC0.89□□□□□ -2.27
TNXAQ16473 CEP57L1-201ENST00000359793 2515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.88□□□□□ -2.27
TNXAQ16473 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC0.88□□□□□ -2.27
TNXAQ16473 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC0.88□□□□□ -2.27
TNXAQ16473 PDCL2-201ENST00000295645 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.88□□□□□ -2.27
TNXAQ16473 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
TNXAQ16473 ZNF705D-201ENST00000400078 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.88□□□□□ -2.27
TNXAQ16473 AC009411.1-202ENST00000412424 548 ntTSL 4 BASIC0.88□□□□□ -2.27
TNXAQ16473 AL589987.2-201ENST00000417426 582 ntTSL 2 BASIC0.88□□□□□ -2.27
TNXAQ16473 USP9YP14-201ENST00000430663 563 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
TNXAQ16473 DMD-AS3-201ENST00000439592 293 ntTSL 3 BASIC0.88□□□□□ -2.27
TNXAQ16473 RPS29P28-201ENST00000446439 141 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
TNXAQ16473 AC016717.1-201ENST00000448918 286 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
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TNXAQ16473 AC025917.1-202ENST00000566344 635 ntTSL 5 BASIC0.88□□□□□ -2.27
TNXAQ16473 AC136932.1-201ENST00000574771 208 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
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TNXAQ16473 MIR4661-201ENST00000582720 75 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
TNXAQ16473 LINC01515-217ENST00000620859 694 ntTSL 5 BASIC0.88□□□□□ -2.27
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TNXAQ16473 MIR338-201ENST00000636369 67 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
TNXAQ16473 BX322639.1-202ENST00000423987 2213 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
TNXAQ16473 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC0.88□□□□□ -2.27
TNXAQ16473 CCDC68-202ENST00000432185 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.87□□□□□ -2.27
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TNXAQ16473 MCHR2-AS1-203ENST00000451220 429 ntTSL 3 BASIC0.86□□□□□ -2.27
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TNXAQ16473 GMFBP1-201ENST00000467831 427 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
TNXAQ16473 MTND3P7-201ENST00000474435 343 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
TNXAQ16473 AC087343.1-201ENST00000477341 475 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
TNXAQ16473 AL163540.1-201ENST00000485382 386 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
TNXAQ16473 RNU6-1146P-201ENST00000516282 102 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
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TNXAQ16473 AC107023.1-201ENST00000552757 356 ntTSL 5 BASIC0.86□□□□□ -2.27
TNXAQ16473 AC138625.2-201ENST00000563968 551 ntTSL 3 BASIC0.86□□□□□ -2.27
TNXAQ16473 MIR4742-201ENST00000581069 85 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
TNXAQ16473 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
TNXAQ16473 AC040904.1-201ENST00000590850 223 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
TNXAQ16473 AC016727.2-201ENST00000603988 621 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
TNXAQ16473 Z94722.1-201ENST00000604328 474 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
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