Protein–RNA interactions for Protein: Q15811

ITSN1, Intersectin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,721 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITSN1Q15811 AL161798.1-201ENST00000604630 131 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
ITSN1Q15811 AL391903.3-201ENST00000612158 163 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
ITSN1Q15811 MIR3529-201ENST00000637713 78 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
ITSN1Q15811 MGST1-207ENST00000535309 1331 ntTSL 1 (best) BASIC-0.79□□□□□ -2.54
ITSN1Q15811 Y_RNA.423-201ENST00000384057 113 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
ITSN1Q15811 SNORA12.2-201ENST00000391040 156 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
ITSN1Q15811 RNU6-994P-201ENST00000410507 111 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
ITSN1Q15811 TPMTP2-201ENST00000414372 726 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
ITSN1Q15811 U8.21-201ENST00000459536 136 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
ITSN1Q15811 MIR5697-201ENST00000578045 78 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
ITSN1Q15811 AC016252.1-201ENST00000609721 474 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
ITSN1Q15811 RNU6-512P-201ENST00000364438 103 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
ITSN1Q15811 SNORA12-201ENST00000391162 147 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
ITSN1Q15811 MTND1P21-201ENST00000412991 285 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
ITSN1Q15811 AC013828.2-201ENST00000532487 235 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
ITSN1Q15811 CCDC7-209ENST00000539197 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC-0.8□□□□□ -2.54
ITSN1Q15811 MIR3666-201ENST00000607845 111 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
ITSN1Q15811 AC024940.5-201ENST00000622889 474 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
ITSN1Q15811 RNU6-487P-201ENST00000365430 104 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
ITSN1Q15811 Y_RNA.391-201ENST00000383933 94 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
ITSN1Q15811 Y_RNA.559-201ENST00000384686 107 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
ITSN1Q15811 SNORA40C-201ENST00000391285 128 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
ITSN1Q15811 AL136320.1-201ENST00000417273 430 ntTSL 3 BASIC-0.81□□□□□ -2.54
ITSN1Q15811 LINC00397-201ENST00000422074 344 ntTSL 3 BASIC-0.81□□□□□ -2.54
ITSN1Q15811 AC119618.1-201ENST00000434191 222 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
ITSN1Q15811 MRPL42P4-201ENST00000453267 443 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
ITSN1Q15811 AC091163.3-201ENST00000518269 1144 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
ITSN1Q15811 AP001328.1-201ENST00000528550 176 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
ITSN1Q15811 AC109446.1-201ENST00000566172 220 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
ITSN1Q15811 AC244093.3-201ENST00000615419 411 ntTSL 3 BASIC-0.81□□□□□ -2.54
ITSN1Q15811 AL356596.1-201ENST00000624230 379 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
ITSN1Q15811 VPS35-212ENST00000640313 141 ntTSL 5 BASIC-0.81□□□□□ -2.54
ITSN1Q15811 MIR365A-201ENST00000362260 87 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
ITSN1Q15811 Y_RNA.288-201ENST00000364854 92 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
ITSN1Q15811 Y_RNA.468-201ENST00000384298 102 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
ITSN1Q15811 MIR1207-201ENST00000408249 87 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
ITSN1Q15811 AC003985.1-201ENST00000414127 362 ntTSL 3 BASIC-0.81□□□□□ -2.54
ITSN1Q15811 MTND1P17-201ENST00000448961 204 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
ITSN1Q15811 RNU5F-2P-201ENST00000516066 82 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
ITSN1Q15811 AC108721.1-201ENST00000547088 348 ntTSL 3 BASIC-0.81□□□□□ -2.54
ITSN1Q15811 MIR3612-201ENST00000579753 87 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
ITSN1Q15811 AC004832.4-201ENST00000608952 331 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
ITSN1Q15811 MTND4P4-201ENST00000439033 1366 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
ITSN1Q15811 SMIM11P1-201ENST00000369586 178 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
ITSN1Q15811 MIR587-201ENST00000384845 96 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
ITSN1Q15811 TRIM60P5Y-201ENST00000413946 574 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
ITSN1Q15811 MTCO3P43-201ENST00000440974 771 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
ITSN1Q15811 MTATP6P30-201ENST00000443540 664 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
ITSN1Q15811 AC020550.1-201ENST00000447385 163 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
ITSN1Q15811 LINC01323-201ENST00000486767 576 ntTSL 3 BASIC-0.82□□□□□ -2.54
ITSN1Q15811 AC026782.1-201ENST00000512952 449 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
ITSN1Q15811 RNU6-416P-201ENST00000516265 103 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
ITSN1Q15811 AC010376.1-201ENST00000522101 334 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
ITSN1Q15811 MIR3192-201ENST00000584920 77 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
ITSN1Q15811 BNIP3P30-201ENST00000601184 574 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
ITSN1Q15811 AC009268.2-201ENST00000621925 457 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
ITSN1Q15811 AL359697.1-201ENST00000624879 587 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
ITSN1Q15811 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC-0.83□□□□□ -2.54
ITSN1Q15811 Y_RNA.52-201ENST00000362760 96 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
ITSN1Q15811 MIR520G-201ENST00000385064 90 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
ITSN1Q15811 MIR520H-201ENST00000385126 88 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
ITSN1Q15811 SNORD83.1-201ENST00000411362 77 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
ITSN1Q15811 LINC01934-201ENST00000414750 391 ntTSL 3 BASIC-0.83□□□□□ -2.54
ITSN1Q15811 AL157400.4-201ENST00000455699 667 ntTSL 1 (best) BASIC-0.83□□□□□ -2.54
ITSN1Q15811 AC108733.1-201ENST00000479244 705 ntTSL 3 BASIC-0.83□□□□□ -2.54
ITSN1Q15811 AC079943.1-201ENST00000491909 466 ntTSL 3 BASIC-0.83□□□□□ -2.54
ITSN1Q15811 AC048346.1-201ENST00000510247 144 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
ITSN1Q15811 RNU6-848P-201ENST00000515948 107 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
ITSN1Q15811 RNU6-617P-201ENST00000516147 107 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
ITSN1Q15811 RNU6-473P-201ENST00000516164 107 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
ITSN1Q15811 RNU6-1049P-201ENST00000516414 107 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
ITSN1Q15811 RNU6-143P-201ENST00000516942 93 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
ITSN1Q15811 LRRC6P1-201ENST00000532188 885 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
ITSN1Q15811 LINC01899-202ENST00000583756 575 ntTSL 3 BASIC-0.83□□□□□ -2.54
ITSN1Q15811 RNU6-212P-201ENST00000362642 104 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
ITSN1Q15811 AC083799.1-201ENST00000366451 910 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
ITSN1Q15811 DEFB135-201ENST00000382208 234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.84□□□□□ -2.54
ITSN1Q15811 SNORA8.2-201ENST00000384372 139 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
ITSN1Q15811 AC005482.1-201ENST00000420758 575 ntTSL 4 BASIC-0.84□□□□□ -2.54
ITSN1Q15811 DIAPH3-AS1-201ENST00000422052 428 ntTSL 3 BASIC-0.84□□□□□ -2.54
ITSN1Q15811 AL592466.1-201ENST00000428346 307 ntTSL 5 BASIC-0.84□□□□□ -2.54
ITSN1Q15811 AL359771.1-201ENST00000441809 379 ntTSL 5 BASIC-0.84□□□□□ -2.54
ITSN1Q15811 AL163973.1-201ENST00000484753 577 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
ITSN1Q15811 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC-0.84□□□□□ -2.54
ITSN1Q15811 RNU2-46P-201ENST00000517038 113 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
ITSN1Q15811 AC009902.1-201ENST00000519351 183 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
ITSN1Q15811 AC095057.3-201ENST00000567102 1157 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
ITSN1Q15811 RNU6-657P-201ENST00000383904 107 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
ITSN1Q15811 RNU6-10P-201ENST00000384036 107 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
ITSN1Q15811 RNU6-15P-201ENST00000384534 107 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
ITSN1Q15811 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
ITSN1Q15811 AL136310.1-201ENST00000404926 654 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
ITSN1Q15811 MIR1185-1-201ENST00000408598 86 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
ITSN1Q15811 RNU6-564P-201ENST00000410983 104 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
ITSN1Q15811 AC019178.2-201ENST00000423595 505 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
ITSN1Q15811 ZNF886P-201ENST00000450781 723 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
ITSN1Q15811 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
ITSN1Q15811 AC110760.3-202ENST00000515177 371 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
ITSN1Q15811 SNORA59B-202ENST00000578183 701 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
ITSN1Q15811 AL513423.1-201ENST00000621695 132 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
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