Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 RNU6-11P-201ENST00000364234 107 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
TAF1AQ15573 Y_RNA.355-201ENST00000365462 98 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
TAF1AQ15573 RNU6-417P-201ENST00000384712 107 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
TAF1AQ15573 MIR660-201ENST00000385235 97 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
TAF1AQ15573 SNORA75.2-201ENST00000391138 150 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
TAF1AQ15573 SNORA75.3-201ENST00000391231 150 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
TAF1AQ15573 TIMM9P3-201ENST00000428659 274 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
TAF1AQ15573 PPEF1-AS1-201ENST00000430641 430 ntTSL 5 BASIC0.23□□□□□ -2.37
TAF1AQ15573 SNAP23P1-201ENST00000433229 246 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
TAF1AQ15573 U7.7-201ENST00000459276 60 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
TAF1AQ15573 snoU13.18-201ENST00000459483 104 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
TAF1AQ15573 RNU6-947P-201ENST00000516264 106 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
TAF1AQ15573 RNU6-685P-201ENST00000517088 95 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
TAF1AQ15573 AP003969.1-201ENST00000531846 400 ntTSL 2 BASIC0.23□□□□□ -2.37
TAF1AQ15573 NR2F2-AS1-208ENST00000560395 441 ntTSL 5 BASIC0.23□□□□□ -2.37
TAF1AQ15573 AC069114.1-201ENST00000580927 287 ntTSL 2 BASIC0.23□□□□□ -2.37
TAF1AQ15573 MIR4753-201ENST00000585119 83 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
TAF1AQ15573 AC022217.4-201ENST00000604389 163 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
TAF1AQ15573 PART1_2.1-201ENST00000612397 250 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
TAF1AQ15573 MIR8054-201ENST00000620877 86 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
TAF1AQ15573 Y_RNA.796-201ENST00000364268 102 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
TAF1AQ15573 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
TAF1AQ15573 RNU6-61P-201ENST00000365528 109 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
TAF1AQ15573 RNU6-25P-201ENST00000383873 107 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
TAF1AQ15573 RNU6-48P-201ENST00000384161 107 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
TAF1AQ15573 RNU6-975P-201ENST00000384296 105 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
TAF1AQ15573 RNU6-15P-201ENST00000384534 107 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
TAF1AQ15573 RNU6-29P-201ENST00000384637 107 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
TAF1AQ15573 RNU1-119P-201ENST00000391122 165 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
TAF1AQ15573 RNA5SP467-201ENST00000391274 118 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
TAF1AQ15573 SNORD99-201ENST00000408612 74 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
TAF1AQ15573 MTCO2P12-201ENST00000427426 682 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
TAF1AQ15573 AC137499.1-201ENST00000427602 88 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
TAF1AQ15573 AC012445.1-201ENST00000442831 607 ntTSL 3 BASIC0.22□□□□□ -2.37
TAF1AQ15573 RPS20P10-201ENST00000451209 253 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
TAF1AQ15573 WDR78-207ENST00000488333 613 ntTSL 3 BASIC0.22□□□□□ -2.37
TAF1AQ15573 CCDC7-208ENST00000537047 657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.22□□□□□ -2.37
TAF1AQ15573 AC023050.3-201ENST00000541142 333 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
TAF1AQ15573 MTND1P15-201ENST00000579262 949 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
TAF1AQ15573 MIR5093-201ENST00000583199 100 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
TAF1AQ15573 AC104458.1-201ENST00000608243 463 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
TAF1AQ15573 SATB1-AS1-227ENST00000625533 743 ntTSL 5 BASIC0.22□□□□□ -2.37
TAF1AQ15573 U6.108-201ENST00000637764 58 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
TAF1AQ15573 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.21□□□□□ -2.38
TAF1AQ15573 Y_RNA.324-201ENST00000365165 102 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
TAF1AQ15573 C20orf187-201ENST00000378252 446 ntTSL 2 BASIC0.21□□□□□ -2.38
TAF1AQ15573 RNU6-39P-201ENST00000384344 107 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
TAF1AQ15573 MIR598-201ENST00000384868 97 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
TAF1AQ15573 SNORA12.1-201ENST00000390873 148 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
TAF1AQ15573 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
TAF1AQ15573 RNA5SP323-201ENST00000391094 133 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
TAF1AQ15573 MIR208B-201ENST00000401172 77 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
TAF1AQ15573 RNU2-39P-201ENST00000410604 198 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
TAF1AQ15573 MED13P1-201ENST00000428342 171 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
TAF1AQ15573 PLCH1-AS2-201ENST00000472913 408 ntTSL 2 BASIC0.21□□□□□ -2.38
TAF1AQ15573 AC008628.2-201ENST00000502605 298 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
TAF1AQ15573 NAF1-205ENST00000509434 385 ntTSL 3 BASIC0.21□□□□□ -2.38
TAF1AQ15573 MDM2-221ENST00000517852 393 ntTSL 1 (best) BASIC0.21□□□□□ -2.38
TAF1AQ15573 AC106038.2-201ENST00000520706 568 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
TAF1AQ15573 DEFB131C-201ENST00000528817 165 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
TAF1AQ15573 FAM19A1-204ENST00000617084 159 ntTSL 5 BASIC0.21□□□□□ -2.38
TAF1AQ15573 AC073349.3-201ENST00000617616 186 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
TAF1AQ15573 PDCL2-201ENST00000295645 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.2□□□□□ -2.38
TAF1AQ15573 CCDC73-201ENST00000335185 3849 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.2□□□□□ -2.38
TAF1AQ15573 RNU6-428P-201ENST00000362942 107 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
TAF1AQ15573 RNU6-199P-201ENST00000362954 107 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
TAF1AQ15573 RNU4-48P-201ENST00000365559 182 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
TAF1AQ15573 RNU6-348P-201ENST00000384386 107 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
TAF1AQ15573 RNU6-1257P-201ENST00000384625 110 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
TAF1AQ15573 AL451046.2-201ENST00000403074 277 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
TAF1AQ15573 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
TAF1AQ15573 RNA5SP511-201ENST00000410487 115 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
TAF1AQ15573 MTATP6P20-201ENST00000414147 562 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
TAF1AQ15573 LANCL1-AS1-202ENST00000420418 476 ntTSL 3 BASIC0.2□□□□□ -2.38
TAF1AQ15573 AC016717.1-201ENST00000448918 286 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
TAF1AQ15573 AC025918.1-201ENST00000452467 383 ntTSL 3 BASIC0.2□□□□□ -2.38
TAF1AQ15573 AC005062.1-201ENST00000457921 566 ntTSL 3 BASIC0.2□□□□□ -2.38
TAF1AQ15573 MTCO2P29-201ENST00000465212 189 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
TAF1AQ15573 AC124854.1-202ENST00000513779 339 ntTSL 3 BASIC0.2□□□□□ -2.38
TAF1AQ15573 AC112481.1-201ENST00000549669 901 ntTSL 2 BASIC0.2□□□□□ -2.38
TAF1AQ15573 AL391840.1-201ENST00000571144 367 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
TAF1AQ15573 AC013244.3-201ENST00000605614 388 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
TAF1AQ15573 AP000484.1-201ENST00000620067 1252 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
TAF1AQ15573 LINC01515-217ENST00000620859 694 ntTSL 5 BASIC0.2□□□□□ -2.38
TAF1AQ15573 RNU4-1-201ENST00000363925 141 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
TAF1AQ15573 RNY1-201ENST00000364228 113 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
TAF1AQ15573 Y_RNA.269-201ENST00000364685 89 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
TAF1AQ15573 Y_RNA.508-201ENST00000384502 114 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
TAF1AQ15573 MIR558-201ENST00000384920 94 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
TAF1AQ15573 AL355796.1-201ENST00000406706 323 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
TAF1AQ15573 RNU6-387P-201ENST00000411331 105 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
TAF1AQ15573 AC092813.2-201ENST00000434540 399 ntTSL 3 BASIC0.19□□□□□ -2.38
TAF1AQ15573 LINC00345-201ENST00000443679 285 ntTSL 5 BASIC0.19□□□□□ -2.38
TAF1AQ15573 AL157373.1-201ENST00000456036 276 ntTSL 3 BASIC0.19□□□□□ -2.38
TAF1AQ15573 LINC01323-201ENST00000486767 576 ntTSL 3 BASIC0.19□□□□□ -2.38
TAF1AQ15573 AK3P2-201ENST00000507976 429 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
TAF1AQ15573 LINC02233-201ENST00000513718 358 ntTSL 3 BASIC0.19□□□□□ -2.38
TAF1AQ15573 LRRC34P2-201ENST00000514850 553 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
TAF1AQ15573 RNU1-142P-201ENST00000516682 145 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
TAF1AQ15573 AL162424.1-201ENST00000602325 221 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
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