Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 AL118523.1-201ENST00000444436 480 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
SEC23BQ15437 RNU7-26P-201ENST00000458980 63 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SEC23BQ15437 AL121594.1-201ENST00000475906 575 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SEC23BQ15437 AC090525.1-201ENST00000479116 478 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SEC23BQ15437 HMGB1P35-201ENST00000503360 598 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SEC23BQ15437 RN7SKP49-201ENST00000516675 260 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SEC23BQ15437 RNU6-1271P-201ENST00000517049 105 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SEC23BQ15437 RNU6-794P-201ENST00000517261 64 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SEC23BQ15437 AC109329.2-201ENST00000519658 482 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SEC23BQ15437 AP003733.2-201ENST00000529409 171 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SEC23BQ15437 AL122017.1-202ENST00000570612 319 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
SEC23BQ15437 MIR5680-201ENST00000577577 84 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SEC23BQ15437 AC100778.1-201ENST00000583579 332 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
SEC23BQ15437 AC006504.5-204ENST00000592404 765 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
SEC23BQ15437 AC007179.3-201ENST00000604976 235 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SEC23BQ15437 CENPF-206ENST00000614578 528 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
SEC23BQ15437 AC240442.1-201ENST00000616055 283 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SEC23BQ15437 MIR7112-201ENST00000616126 65 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SEC23BQ15437 MIR5739-201ENST00000619803 80 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SEC23BQ15437 OR5V1-217ENST00000641768 2763 ntAPPRIS P1 BASIC2.68□□□□□ -1.98
SEC23BQ15437 Y_RNA.64-201ENST00000362845 102 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SEC23BQ15437 VTRNA1-1-201ENST00000363120 99 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SEC23BQ15437 Y_RNA.222-201ENST00000364264 102 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SEC23BQ15437 RNU6-879P-201ENST00000364328 108 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SEC23BQ15437 Y_RNA.376-201ENST00000365638 108 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SEC23BQ15437 RNU6-318P-201ENST00000384283 103 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SEC23BQ15437 RNVU1-14-201ENST00000384770 164 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SEC23BQ15437 AC093423.2-201ENST00000429074 437 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
SEC23BQ15437 AL132875.2-201ENST00000436418 325 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
SEC23BQ15437 AL445524.1-202ENST00000440665 416 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
SEC23BQ15437 IFT74-AS1-201ENST00000456198 405 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
SEC23BQ15437 AC007215.1-201ENST00000464893 276 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SEC23BQ15437 CKS1BP2-201ENST00000497342 240 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SEC23BQ15437 RNU5F-2P-201ENST00000516066 82 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SEC23BQ15437 SNORA31.16-201ENST00000516773 139 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SEC23BQ15437 AC083973.1-205ENST00000518994 601 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
SEC23BQ15437 AP005436.2-201ENST00000528458 252 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
SEC23BQ15437 AC024270.4-201ENST00000570202 421 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
SEC23BQ15437 AL034555.1-201ENST00000604816 211 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SEC23BQ15437 AC005296.1-201ENST00000616145 209 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SEC23BQ15437 LINC02555-201ENST00000563933 1951 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SEC23BQ15437 AC131280.1-202ENST00000624067 4211 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SEC23BQ15437 OR4K2-204ENST00000641885 8681 ntAPPRIS P1 BASIC2.67□□□□□ -1.98
SEC23BQ15437 LTN1-201ENST00000361371 7685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
SEC23BQ15437 QSER1-204ENST00000527788 5052 ntTSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
SEC23BQ15437 IL23R-205ENST00000637002 2208 ntTSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
SEC23BQ15437 RNA5SP125-201ENST00000364843 120 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SEC23BQ15437 RNU6-281P-201ENST00000384212 103 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SEC23BQ15437 Y_RNA.489-201ENST00000384410 101 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SEC23BQ15437 TRAV34-201ENST00000390461 349 ntAPPRIS P1 BASIC2.67□□□□□ -1.98
SEC23BQ15437 TRDJ3-201ENST00000390476 59 ntAPPRIS P1 BASIC2.67□□□□□ -1.98
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SEC23BQ15437 BCL2L11-207ENST00000405953 425 ntTSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
SEC23BQ15437 AC003685.2-201ENST00000422795 395 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SEC23BQ15437 AIMP1P2-201ENST00000425294 312 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SEC23BQ15437 AP000705.1-201ENST00000454567 350 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SEC23BQ15437 snoU13.6-201ENST00000458785 104 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
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SEC23BQ15437 AL713866.2-201ENST00000603579 219 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SEC23BQ15437 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
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SEC23BQ15437 PRPSAP2-229ENST00000628609 192 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
SEC23BQ15437 CACNB4-238ENST00000636901 7706 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
SEC23BQ15437 SLC4A7-201ENST00000295736 7757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
SEC23BQ15437 CEP57L1-223ENST00000523787 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
SEC23BQ15437 CFH-202ENST00000367429 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
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SEC23BQ15437 Y_RNA.26-201ENST00000362539 101 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SEC23BQ15437 RNU6-806P-201ENST00000365147 105 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
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SEC23BQ15437 MT-TW-201ENST00000387382 68 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
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SEC23BQ15437 AC096920.1-201ENST00000423991 241 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SEC23BQ15437 INTS6-AS1-201ENST00000434512 466 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
SEC23BQ15437 AC006028.1-201ENST00000438379 402 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SEC23BQ15437 LINC01198-202ENST00000458282 558 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
SEC23BQ15437 SNORD127-201ENST00000458892 86 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SEC23BQ15437 RN7SL807P-201ENST00000470923 297 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SEC23BQ15437 CYCSP23-201ENST00000519781 313 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SEC23BQ15437 OOSP2-203ENST00000532905 496 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
SEC23BQ15437 MIR5695-201ENST00000579717 85 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SEC23BQ15437 AC024610.1-201ENST00000582685 323 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
SEC23BQ15437 AL670379.2-201ENST00000604983 252 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SEC23BQ15437 AC096577.2-201ENST00000611455 153 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SEC23BQ15437 MIR376A1-201ENST00000616574 68 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SEC23BQ15437 GLMN-201ENST00000370360 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
SEC23BQ15437 MRPL42-202ENST00000393128 1983 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
SEC23BQ15437 BX322639.1-202ENST00000423987 2213 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SEC23BQ15437 CCSAP-202ENST00000366686 4399 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.98
SEC23BQ15437 Y_RNA.105-201ENST00000363182 111 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
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