Protein–RNA interactions for Protein: Q15436

SEC23A, Protein transport protein Sec23A, humanhuman

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23AQ15436 RASSF8-210ENST00000541490 5505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
SEC23AQ15436 AC009975.1-201ENST00000634588 2698 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
SEC23AQ15436 FNBP1L-203ENST00000370253 3889 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
SEC23AQ15436 ZMYM1-210ENST00000611874 4466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
SEC23AQ15436 RBBP8-202ENST00000360790 2962 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
SEC23AQ15436 OLFM3-206ENST00000536598 2801 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
SEC23AQ15436 SYNE2-212ENST00000554584 20508 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
SEC23AQ15436 USP15-203ENST00000353364 14950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
SEC23AQ15436 AC103988.1-201ENST00000566382 2177 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SEC23AQ15436 APCS-201ENST00000255040 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
SEC23AQ15436 RNU1-62P-201ENST00000362599 164 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SEC23AQ15436 RNU6-799P-201ENST00000363567 107 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SEC23AQ15436 RNU6-873P-201ENST00000363833 107 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SEC23AQ15436 Y_RNA.179-201ENST00000363844 90 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SEC23AQ15436 SNORA53-201ENST00000391141 249 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SEC23AQ15436 RNA5SP354-201ENST00000391247 136 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SEC23AQ15436 MIR208B-201ENST00000401172 77 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SEC23AQ15436 Y_RNA.602-201ENST00000410535 92 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SEC23AQ15436 LINC01402-201ENST00000422226 279 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
SEC23AQ15436 AC121342.1-201ENST00000423914 550 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
SEC23AQ15436 SMG7-AS1-202ENST00000432837 466 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
SEC23AQ15436 LINC02336-201ENST00000434117 330 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
SEC23AQ15436 LINC00393-201ENST00000443621 282 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
SEC23AQ15436 AC073901.1-201ENST00000462471 408 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SEC23AQ15436 RPL26P26-201ENST00000480251 434 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SEC23AQ15436 SNORA40.9-201ENST00000515895 93 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SEC23AQ15436 SNORA25.14-201ENST00000516481 132 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SEC23AQ15436 AC027176.1-201ENST00000560204 514 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SEC23AQ15436 AC025271.3-201ENST00000563031 255 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
SEC23AQ15436 LINC02165-201ENST00000563061 443 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
SEC23AQ15436 AC037487.3-201ENST00000606668 112 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SEC23AQ15436 AC006386.2-201ENST00000624491 75 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SEC23AQ15436 AC012005.1-201ENST00000624575 75 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SEC23AQ15436 DDX60L-207ENST00000505890 4568 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
SEC23AQ15436 PSG1-205ENST00000595124 1692 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
SEC23AQ15436 LRRC70-201ENST00000334994 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
SEC23AQ15436 AC026241.1-201ENST00000517873 2142 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SEC23AQ15436 ZNF204P-201ENST00000416749 2397 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SEC23AQ15436 RNU6-655P-201ENST00000362858 107 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SEC23AQ15436 RNU6-1210P-201ENST00000363775 107 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SEC23AQ15436 RNU6-793P-201ENST00000384233 104 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SEC23AQ15436 Y_RNA.541-201ENST00000384640 113 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SEC23AQ15436 MIR181A2-201ENST00000384863 110 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SEC23AQ15436 SNORD58.1-201ENST00000391313 66 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SEC23AQ15436 SNORA48.8-201ENST00000391324 134 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SEC23AQ15436 CBX3P9-201ENST00000402326 552 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SEC23AQ15436 AL133475.1-201ENST00000404414 305 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SEC23AQ15436 AIMP1P2-201ENST00000425294 312 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SEC23AQ15436 AC005160.1-201ENST00000432405 381 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SEC23AQ15436 AC110995.1-201ENST00000444185 628 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SEC23AQ15436 LINC01198-202ENST00000458282 558 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SEC23AQ15436 AC003982.1-202ENST00000469928 248 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SEC23AQ15436 AC091826.1-201ENST00000514065 313 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SEC23AQ15436 Y_RNA.700-201ENST00000516806 100 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SEC23AQ15436 MDM2-232ENST00000544561 213 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SEC23AQ15436 AC079598.5-201ENST00000547460 117 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SEC23AQ15436 AC233702.2-202ENST00000562547 291 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SEC23AQ15436 AC026462.2-201ENST00000565771 286 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SEC23AQ15436 LARP7P3-201ENST00000579888 337 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SEC23AQ15436 AL137843.1-201ENST00000605078 385 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SEC23AQ15436 AC127459.3-201ENST00000624328 466 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SEC23AQ15436 MME-216ENST00000615825 5523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
SEC23AQ15436 MGAT4C-211ENST00000621808 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
SEC23AQ15436 AL079305.1-201ENST00000623159 3008 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SEC23AQ15436 GRAMD1C-202ENST00000440446 3475 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
SEC23AQ15436 AL109809.4-201ENST00000603520 2185 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SEC23AQ15436 LRRTM2-201ENST00000274711 6017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
SEC23AQ15436 AC099654.7-201ENST00000635788 2127 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SEC23AQ15436 TAB2-201ENST00000367456 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SEC23AQ15436 RNU6-626P-201ENST00000363354 107 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SEC23AQ15436 RNU6-1027P-201ENST00000383998 107 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SEC23AQ15436 RNU6-1026P-201ENST00000384465 108 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SEC23AQ15436 RNU1-57P-201ENST00000384491 166 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SEC23AQ15436 RNU6-21P-201ENST00000384710 107 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SEC23AQ15436 MIR186-201ENST00000384988 86 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SEC23AQ15436 MIR487A-201ENST00000385009 80 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SEC23AQ15436 RNU2-20P-201ENST00000410425 191 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SEC23AQ15436 RNU6-1140P-201ENST00000410517 106 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SEC23AQ15436 AL445305.1-201ENST00000432577 575 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SEC23AQ15436 RPS3P1-201ENST00000456781 192 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SEC23AQ15436 AP001324.2-201ENST00000461163 319 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SEC23AQ15436 AC117462.1-201ENST00000461186 554 ntTSL 4 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SEC23AQ15436 RPL36AP48-201ENST00000485521 314 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SEC23AQ15436 AC092185.1-201ENST00000491371 97 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SEC23AQ15436 RNU6ATAC13P-201ENST00000516152 131 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SEC23AQ15436 RNU4-71P-201ENST00000516258 113 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SEC23AQ15436 RNA5SP367-201ENST00000516557 118 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SEC23AQ15436 AP003128.1-201ENST00000531414 448 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SEC23AQ15436 AC141273.1-201ENST00000565300 479 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SEC23AQ15436 AP005062.1-201ENST00000581502 607 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SEC23AQ15436 ANKAR-201ENST00000313581 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
SEC23AQ15436 AC091564.4-201ENST00000533934 2194 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SEC23AQ15436 RAPGEF6-202ENST00000308008 4176 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
SEC23AQ15436 ANKRD36BP1-201ENST00000358576 1779 ntBASIC3.28□□□□□ -1.89
SEC23AQ15436 ZNF567-201ENST00000360729 2691 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
SEC23AQ15436 MTND5P35-201ENST00000557537 1720 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SEC23AQ15436 EFCAB3-202ENST00000450662 1694 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SEC23AQ15436 KNTC1-205ENST00000450485 3655 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SEC23AQ15436 AK9-203ENST00000368948 2478 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SEC23AQ15436 RNU1-112P-201ENST00000364401 164 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 188.3 ms